Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09671
• Subject: NM_001160127.1
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1317
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACAATAGGGAGAATGGAGAACGTGGAGGTCTTCACCGCTGAGGGCAAAGGAAGGGGTCTGAAGGCCACCAA  74
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGACAATAGGCAGCATGGAGAACGTGGAGGTCTTCACTTCCGAGGGCAAAGGCAGAGGTCTGAAGGCTACGAA  74

Query   75  GGAGTTCTGGGCTGCAGATATCATCTTTGCTGAGCGGGCTTATTCCGCAGTGGTTTTTGACAGCCTTGTTAATT  148
            |||||||||||||||.|||.||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.|
Sbjct   75  GGAGTTCTGGGCTGCGGATGTCATCTTTGCGGAGAGGGCTTATTCTGCAGTGGTTTTTGACAGCCTCATTAACT  148

Query  149  TTGTGTGCCACACCTGCTTCAAGAGGCAGGAGAAGCTCCATCGCTGTGGGCAGTGCAAGTTTGCCCATTACTGC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCGTGTGCCACACCTGCTTCAAGAGGCAGGAGAAGCTCCATCGCTGCGGGCAGTGCAAGTTCGCCCATTACTGC  222

Query  223  GACCGCACCTGCCAGAAGGATGCTTGGCTGAACCACAAGAATGAATGTTCGGCCATCAAGAGATATGGGAAGGT  296
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||..|.||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  223  GACCGCACGTGCCAGAAGGATGCTTGGCTGAATCACAAGAACGAGTGCGCTGCCATCAAGAAATATGGGAAAGT  296

Query  297  GCCCAATGAGAACATCAGGCTGGCGGCGCGCATCATGTGGAGGGTGGAGAGAGAAGGCACCGGGCTCACGGAGG  370
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  297  GCCCAACGAGAACATCAGGCTGGCCGCCCGCATCATGTGGCGGGTGGAGAGAGAGGGCACTGGGCTCACAGAGG  370

Query  371  GCTGCCTGGTGTCCGTGGACGACTTGCAGAACCACGTGGAGCACTTTGGGGAGGAGGAGCAGAAGGACCTGCGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  GCTGCCTGGTGTCCGTGGATGACTTACAGAACCACGTGGAGCACTTTGGGGAGGAGGAGCAGAAGGAACTCCGA  444

Query  445  GTGGACGTGGACACATTCTTGCAGTACTGGCCGCCGCAGAGCCAGCAGTTCAGCATGCAGTACATCTCGCACAT  518
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  GTAGACGTGGACACGTTCTTGCAGTACTGGCCACCACAGAGCCAGCAGTTCAGCATGCAGTATATCTCACACAT  518

Query  519  CTTCGGAGTGATTAACTGCAACGGTTTTACTCTCAGTGATCAGAGAGGCCTGCAGGCCGTGGGCGTAGGCATCT  592
            |||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||
Sbjct  519  CTTTGGTGTGATCAACTGCAACGGTTTCACTCTCAGTGACCAGAGAGGGCTACAGGCAGTAGGTGTGGGCATCT  592

Query  593  TCCCCAACCTGGGCCTGGTGAACCATGACTGTTGGCCCAACTGTACTGTCATATTTAACAATGGCAATCATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCCAACCTGGGCCTGGTGAACCATGATTGCTGGCCAAACTGCACTGTCATATTCAACAATGGCAATCATGAG  666

Query  667  GCAGTGAAATCCATGTTTCATACCCAGATGAGAATTGAGCTCCGGGCCCTAGGCAAGATCTCAGAAGGAGAGGA  740
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCAGTGAAATCCATGTTTCACACGCAGATGAGGATTGAGCTCCGGGCCCTGGGCAAGATCTCAGAAGGCGAGGA  740

Query  741  GCTGACTGTGTCCTATATTGACTTCCTCAACGTTAGTGAAGAACGCAAGAGGCAGCTGAAGAAGCAGTACTACT  814
            |||||||||||||||.||.||||||||..||.|.|||||.||.||||.|.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GCTGACTGTGTCCTACATAGACTTCCTGCACCTCAGTGAGGAGCGCAGGCGGCAGCTGAAGAAACAGTACTACT  814

Query  815  TTGACTGCACATGTGAACACTGCCAGAAAAAACTGAAGGATGACCTCTTCCTGGGGGTGAAAGACAACCCCAAG  888
            ||||||||.|.|||||.|||||||||||....||||||||.|||||||||||||..|.|||.||..||||||||
Sbjct  815  TTGACTGCTCCTGTGAGCACTGCCAGAAGGGGCTGAAGGACGACCTCTTCCTGGCAGCGAAGGAAGACCCCAAG  888

Query  889  CCCTCTCAGGAAGTGGTGAAGGAGATGATACAATTCTCCAAGGATACATTGGAAAAGATAGACAAGGCTCGTTC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  889  CCCTCCCAGGAAGTGGTGAAGGAGATGATACAATTCTCAAAGGATACACTGGAAAAAATAGACAAGGCTCGCTC  962

Query  963  CGAGGGTTTGTATCATGAGGTTGTGAAATTATGCCGGGAGTGCCTGGAGAAGCAGGAGCCAGTGTTTGCTGACA  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  963  CGAGGGTTTGTATCACGAGGTTGTGAAGCTGTGTCGGGAGTGCCTGGAGAAGCAGGAGCCAGTGTTCGCCGACA  1036

Query 1037  CCAACATCTACATGCTGCGGATGCTGAGCATTGTTTCGGAGGTCCTTTCCTACCTCCAGGCCTTTGAGGAGGCC  1110
            |||||.|||||.||||.|||.||||.|||||||..||.||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1037  CCAACCTCTACGTGCTTCGGCTGCTCAGCATTGCATCAGAGGTCCTCTCCTACCTCCAGGCCTATGAGGAGGCC  1110

Query 1111  TCGTTCTATGCCAGGAGGATGGTGGACGGCTATATGAAGCTCTACCACCCCAACAATGCCCAACTGGGCATGGC  1184
            ||....|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCACATTATGCCAGGAGGATGGTTGATGGCTACATGAAACTCTACCACCATAACAATGCCCAACTGGGCATGGC  1184

Query 1185  CGTGATGCGGGCAGGGCTGACCAACTGGCATGCTGGTAACATTGAGGTGGGGCACGGGATGATCTGCAAAGCCT  1258
            .||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGATGAGGGCAGGGCTTACCAACTGGCATGCTGGTCACATCGAAGTGGGGCATGGGATGATCTGCAAAGCCT  1258

Query 1259  ATGCCATTCTCCTGGTGACACACGGACCCTCCCACCCCATCACTAAGGACTTAGAGGCCATGCGGGTGCAGACG  1332
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1259  ATGCTATTCTCCTGGTGACCCATGGACCCTCCCACCCTATCACCAAAGACTTAGAGGCCATGCGGATGCAGACA  1332

Query 1333  GAGATGGAGCTACGCATGTTCCGCCAGAACGAATTCATGTACTACAAGATGCGCGAGGCTGCCCTGAACAACCA  1406
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGATGGAGCTGCGTATGTTCCGCCAAAACGAATTCATGTATCACAAGATGCGAGAGGCTGCCCTGAACAACCA  1406

Query 1407  GCCCATGCAGGTCATGGCCGAGCCCAGCAATGAGCCATCCCCAGCTCTGTTCCACAAGAAGCAA  1470
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1407  GCCCATGCAGGTCATGGCTGAGCCTAGCAATGAACCAGCCCCCGCTCTGTTCCATAAGAAGCAG  1470