Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09707
- Subject:
- XM_006715349.4
- Aligned Length:
- 1890
- Identities:
- 1549
- Gaps:
- 315
Alignment
Query 1 ATGGTACCTGTTGAAAACACCGAGGGCCCCAGTCTGCTGAACCAGAAGGGGACAGCCGTGGAGACGGAGGGCAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTACCTGTTGAAAACACCGAGGGCCCCAGTCTGCTGAACCAGAAGGGGACAGCCGTGGAGACGGAGGGCAG 74
Query 75 CGGCAGCCGGCATCCTCCCTGGGCGAGAGGCTGCGGCATGTTTACCTTCCTGTCATCTGTCACTGCTGCTGTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGCAGCCGGCATCCTCCCTGGGCGAGAGGCTGCGGCATGTTTACCTTCCTGTCATCTGTCACTGCTGCTGTCA 148
Query 149 GTGGCCTCCTGGTGGGTTATGAACTTGGGATCATCTCTGGGGCTCTTCTTCAGATCAAAACCTTATTAGCCCTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTGGCCTCCTGGTGGGTTATGAACTTGGGATCATCTCTGGGGCTCTTCTTCAGATCAAAACCTTATTAGCCCTG 222
Query 223 AGCTGCCATGAGCAGGAAATGGTTGTGAGCTCCCTCGTCATTGGAGCCCTCCTTGCCTCACTCACCGGAGGGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCTGCCATGAGCAGGAAATGGTTGTGAGCTCCCTCGTCATTGGAGCCCTCCTTGCCTCACTCACCGGAGGGGT 296
Query 297 CCTGATAGACAGATATGGAAGAAGGACAGCAATCATCTTGTCATCCTGCCTGCTTGGACTCGGAAGCTTAGTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGATAGACAGATATGGAAGAAGGACAGCAATCATCTTGTCATCCTGCCTGCTTGGACTCGGAAGCTTAGTCT 370
Query 371 TGATCCTCAGTTTATCCTACACGGTTCTTATAGTGGGACGCATTGCCATAGGGGTCTCCATCTCCCTCTCTTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGATCCTCAGTTTATCCTACACGGTTCTTATAGTGGGACGCATTGCCATAGGGGTCTCCATCTCCCTCTCTTCC 444
Query 445 ATTGCCACTTGTGTTTACATCGCAGAGATTGCTCCTCAACACAGAAGAGGCCTTCTTGTGTCACTGAATGAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTGCCACTTGTGTTTACATCGCAGAGATTGCTCCTCAACACAGAAGAGGCCTTCTTGTGTCACTGAATGAGCT 518
Query 519 GATGATTGTCATCGGCATTCTTTCTGCCTATATTTCAAATTACGCATTTGCCAATGTTTTCCATGGCTGGAAGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATGATTGTCATCGGCATTCTTTCTGCCTATATTTCAAATTACGCATTTGCCAATGTTTTCCATGGCTGGAAGT 592
Query 593 ACATGTTTGGTCTTGTGATTCCCTTGGGAGTTTTGCAAGCAATTGCAATGTATTTTCTTCCTCCAAGCCCTCGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATGTTTGGTCTTGTGATTCCCTTGGGAGTTTTGCAAGCAATTGCAATGTATTTTCTTCCTCCAAGCCCTCGG 666
Query 667 TTTCTGGTGATGAAAGGACAAGAGGGAGCTGCTAGCAAGGTTCTTGGAAGGTTAAGAGCACTCTCAGATACAAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTCTGGTGATGAAAGGACAAGAGGGAGCTGCTAGCAAGGTTCTTGGAAGGTTAAGAGCACTCTCAGATACAAC 740
Query 741 TGAGGAACTCACTGTGATCAAATCCTCCCTGAAAGATGAATATCAGTACAGTTTTTGGGATCTGTTTCGTTCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAGGAACTCACTGTGATCAAATCCTCCCTGAAAGATGAATATCAGTACAGTTTTTGGGATCTGTTTCGTTCAA 814
Query 815 AAGACAACATGCGGACCCGAATAATGATAGGACTAACACTAGTATTTTTTGTACAAATCACTGGCCAACCAAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGACAACATGCGGACCCGAATAATGATAGGACTAACACTAGTATTTTTTGTACAAATCACTGGCCAACCAAAC 888
Query 889 ATATTGTTCTATGCATCAACTGTTTTGAAGTCAGTTGGATTTCAAAGCAATGAGGCAGCTAGCCTCGCCTCCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATATTGTTCTATGCATCAACTGTTTTGAAGTCAGTTGGATTTCAAAGCAATGAGGCAGCTAGCCTCGCCTCCAC 962
Query 963 TGGGGTTGGAGTCGTCAAGGTCATTAGCACCATCCCTGCCACTCTTCTTGTAGACCATGTTGGCAGCAAAACAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 TGGGGTTGGAGTCGTCAAGGTCATTAGCACCATCCCTGCCACTCTTCTTGTAGACCATGTCGGCAGCAAAACAT 1036
Query 1037 TCCTCTGCATTGGCTCCTCTGTGATGGCAGCTTCGTTGGTGACCATGGGCATCGTAAATCTCAACATCCACATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCTCTGCATTGGCTCCTCTGTGATGGCAGCTTCGTTGGTGACCATGGGCATCGTAAATCTCAACATCCACATG 1110
Query 1111 AACTTCACCCATATCTGCAGAAGCCACAATTCTATCAACCAGTCCTTGGATGAGTCTGTGATTTATGGACCAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AACTTCACCCATATCTGCAGAAGCCACAATTCTATCAACCAGTCCTTGGATGAGTCTGTGATTTATGGACCAGG 1184
Query 1185 AAACCTGTCAACCAACAACAATACTCTCAGAGACCACTTCAAAGGGATTTCTTCCCATAGCAGAAGCTCACTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAACCTGTCAACCAACAACAATACTCTCAGAGACCACTTCAAAGGGATTTCTTCCCATAGCAGAAGCTCACTCA 1258
Query 1259 TGCCCCTGAGAAATGATGTGGATAAGAGAGGGGAGACGACCTCAGCATCCTTGCTAAATGCTGGATTAAGCCAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGCCCCTGAGAAATGATGTGGATAAGAGAGGGGAGACGACCTCAGCATCCTTGCTAAATGCTGGATTAAGCCAC 1332
Query 1333 ACTGAATACCAGATAGTCACAGACCCTGGGGACGTCCCAGCTTTTTTGAAATGGCTGTCCTTAGCCAGCTTGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTGAATACCAGATAGTCACAGACCCTGGGGACGTCCCAGCTTTTTTGAAATGGCTGTCCTTAGCCAGCTTGCT 1406
Query 1407 TGTTTATGTTGCTGCTTTTTCAATTGGTCTAGGACCAATGCCCTGGCTGGTGCTCAGCGAG-----ATCTTTCC 1475
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1407 TGTTTATGTTGCTGCTTTTTCAATTGGTCTAGGACCAA--------------------GAGATGTTATCTTT-- 1458
Query 1476 TGGTGGGATCAGAGGACGAGCCA-------TGGCTTTAACTTCT----AGCATGA-ACTGGGGCATCAATCTCC 1537
||| |||| ||.|| ||.|.| ||.|| ||..||| ||| |||||
Sbjct 1459 -------ATC---GGAC-AGTCAACAAACTTGCCCT---CTGCTCCAGAGGGTGACACT---------ATCTC- 1508
Query 1538 TCATCTCGCTGAC-ATTTTTGACTGTAACTGATCTTATTGGCCTGC--CATGGGTGTGCT-TTATATATACAAT 1607
.|||||...||| ||||.|.| ||.| ||||.| ||.| ||| |||||.|.|||..
Sbjct 1509 -TATCTCCAAGACTATTTATTA-TGCA-------------GCCTACAACAAG-----GCTATTATACAAACAGC 1562
Query 1608 CATG-------AGTCT--AGCA-------TCCCTGCTTTTTGTTGTTATGTTTATACC--TGAGACAAAGGGAT 1663
|.|| ||.|| |||| ||..|||.|||| || |.|||||
Sbjct 1563 CTTGGAAAGACAGCCTAGAGCAAAGACAGTCAGTGCCTTTT---------------CCCATAAGACA------- 1614
Query 1664 GCTCTTTGGAACAAATATCAATGGAGCTAGCAAAAGTGAACTATGTGAAAAACAACATTTGTTTTATGAGTCAT 1737
Sbjct 1615 -------------------------------------------------------------------------- 1614
Query 1738 CACCAAGAAGAATTAGTGCCAAAACAGCCTCAAAAAAGAAAACCCCAGGAGCAGCTCTTGGAGTGTAACAAGCT 1811
Sbjct 1615 -------------------------------------------------------------------------- 1614
Query 1812 GTGTGGTAGGGGCCAATCCAGGCAGCTTTCTCCAGAGACC 1851
Sbjct 1615 ---------------------------------------- 1614