Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09906
• Subject: XM_011541180.2
• Aligned Length: 2202
• Identities: 1899
• Gaps: 300

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACTTCAGATAGAGATGTAGAATCAATGGGTGTCTCTTCTAAATGGCTGCAGAGGGTGCTGACCTGGGCCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTAGACTCTGCCCTTCTAGGAGCATCTCAAGATTGTCTTATTTTGGGTGTGGGCAATTTGCATATTTCTCCAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGAACCATCCAGAACCTGAGCAGCCTGTCTTCAGACAGAGAGAGGCCCACGGCTGTTTCTTGAAATCTGGTGAT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCAGGTCCTGTCCAGAAAGCTCGGGGTGTGGCAGTGAAAAAACAACCAGGGAACTGCCTCGTACACACAGCGCT  296

Query    1  ----ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGG  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGAATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGG  370

Query   71  GGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATC  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATC  444

Query  145  TCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTG  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTG  518

Query  219  GCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATG  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATG  592

Query  293  TGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGC  666

Query  367  TTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGT  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGT  740

Query  441  GCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTG  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTG  814

Query  515  AAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCG  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCG  888

Query  589  ACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGAC  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGAC  962

Query  663  GATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTG  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTG  1036

Query  737  CAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCT  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCT  1110

Query  811  CTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTT  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTT  1184

Query  885  CAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGG  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGG  1258

Query  959  AGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACA  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACA  1332

Query 1033  GTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCC  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCC  1406

Query 1107  CTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGG  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGG  1480

Query 1181  GGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCT  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCT  1554

Query 1255  CAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCA  1328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCA  1628

Query 1329  TTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTT  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTT  1702

Query 1403  TCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTG  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTG  1776

Query 1477  GAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGC  1550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGC  1850

Query 1551  CGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGG  1624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGG  1924

Query 1625  AGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATA  1698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATA  1998

Query 1699  TCCGGAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTC  1772
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TCCGGAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTC  2072

Query 1773  TGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACC  1846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACC  2146

Query 1847  CACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC  2202