Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09906
- Subject:
- XM_017000916.1
- Aligned Length:
- 2094
- Identities:
- 1899
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGGACGCTGGTCAAGGGCAATTTGCATATTTCTCCAAAGAACCATCCAGAACCTGAGCAGCCTGTCTTCAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACAGAGAGAGGCCCACGGCTGTTTCTTGAAATCTGGTGATCCAGGTCCTGTCCAGAAAGCTCGGGGTGTGGCAG 148
Query 1 --------------------------------------------ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGG 30
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAAAAAACAACCAGGGAACTGCCTCGTACACACAGCGCTGGGAATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGG 222
Query 31 CTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGAC 104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGAC 296
Query 105 TGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACA 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACA 370
Query 179 GCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATG 252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATG 444
Query 253 ACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTT 326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTT 518
Query 327 GAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGG 592
Query 401 CCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATG 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATG 666
Query 475 TTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAA 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAA 740
Query 549 CCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTG 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTG 814
Query 623 GAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGC 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGC 888
Query 697 TCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAA 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAA 962
Query 771 GAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCG 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCG 1036
Query 845 CCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGT 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGT 1110
Query 919 GAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGG 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGG 1184
Query 993 TCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGC 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGC 1258
Query 1067 CAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTT 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTT 1332
Query 1141 GGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCT 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCT 1406
Query 1215 GGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACG 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACG 1480
Query 1289 TCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGG 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGG 1554
Query 1363 ATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGT 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct 1555 ATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGT 1628
Query 1437 CGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCC 1510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCC 1702
Query 1511 ACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAG 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAG 1776
Query 1585 AAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGG 1658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGG 1850
Query 1659 CGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAG 1732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1851 CGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAG 1924
Query 1733 ACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCT 1806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCT 1998
Query 1807 GAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCA 1880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCA 2072
Query 1881 GGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC 1902
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC 2094