Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09906
• Subject: XM_017000917.1
• Aligned Length: 2079
• Identities: 1899
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCAATTTGCATATTTCTCCAAAGAACCATCCAGAACCTGAGCAGCCTGTCTTCAGACAGAGAGAGGCCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGGCTGTTTCTTGAAATCTGGTGATCCAGGTCCTGTCCAGAAAGCTCGGGGTGTGGCAGTGAAAAAACAACCAG  148

Query    1  -----------------------------ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCT  45
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAACTGCCTCGTACACACAGCGCTGGGAATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCT  222

Query   46  CTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTT  119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTT  296

Query  120  CGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAG  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAG  370

Query  194  AGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGC  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGC  444

Query  268  GGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGAC  341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGAC  518

Query  342  GGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTT  415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTT  592

Query  416  GCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTG  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTG  666

Query  490  AAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAA  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAA  740

Query  564  GCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCAC  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCAC  814

Query  638  CCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATA  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATA  888

Query  712  GCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGC  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGC  962

Query  786  CATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGC  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGC  1036

Query  860  TCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTG  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTG  1110

Query  934  GCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGT  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGT  1184

Query 1008  GGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCA  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCA  1258

Query 1082  GTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCC  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCC  1332

Query 1156  CACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCAT  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCAT  1406

Query 1230  CTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTG  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTG  1480

Query 1304  CGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTAC  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTAC  1554

Query 1378  TGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCC  1451
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCC  1628

Query 1452  CGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCA  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCA  1702

Query 1526  AGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTG  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTG  1776

Query 1600  GCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCA  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCA  1850

Query 1674  GGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCC  1747
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCGGAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCC  1924

Query 1748  AGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATC  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATC  1998

Query 1822  TGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGG  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGG  2072

Query 1896  GCTGGAC  1902
            |||||||
Sbjct 2073  GCTGGAC  2079