Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_10548
• Subject: NM_130768.3
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1174
• Gaps: 248

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGAGCGCGCTGCGAGGCCTGCCAGTGGCTGGCGGAGGCGAGAGTAGCGAGAGCGAGGATGATGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGAGCGCGCTGCGAGGCCTGCCAGTGGCTGGCGGAGGCGAGAGTAGCGAGAGCGAGGATGATGGCTG  74

Query   75  GGAGATTGGGTATCTCGACCGGACGTCTCAGAAATTGAAAAGGCTATTACCCATTGAAGAAAAGAAAGAAAAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGATTGGGTATCTCGACCGGACGTCTCAGAAATTGAAAAGGCTATTACCCATTGAAGAAAAGAAAGAAAAAT  148

Query  149  TTAAGAAAGCAATGACCATCGGAGATGTTTCATTGGTCCAGGAGCTCCTAGATTCTGGCATTAGTGTAGATTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTAAGAAAGCAATGACCATCGGAGATGTTTCATTGGTCCAGGAGCTCCTAGATTCTGGCATTAGTGTAGATTCC  222

Query  223  AACTTTCAGTATGGATGGACTCCCCTTATGTATGCTGCTAGTGTTGCCAATGCAGAGCTGGTTCGGGTCCTTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACTTTCAGTATGGATGGACTCCCCTTATGTATGCTGCTAGTGTTGCCAATGCAGAGCTGGTTCGGGTCCTTTT  296

Query  297  GGACAGAGGTGCTAATGCAAGCTTTGAGAAGGATAAGCAAAGTATTTTGATAACTGCATGTTCTGCTCATGGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACAGAGGTGCTAATGCAAGCTTTGAGAAGGATAAGCAAAGTATTTTGATAACTGCATGTTCTGCTCATGGCT  370

Query  371  CAGAGGAACAGATCTTGAAGTGTGTAGAACTACTACTTTCAAGAAATGCTGATCCAAATGTTGCTTGTAGGAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAGGAACAGATCTTGAAGTGTGTAGAACTACTACTTTCAAGAAATGCTGATCCAAATGTTGCTTGTAGGAGA  444

Query  445  CTTATGACCCCAATCATGTATGCTGCTCGAGATGGTCACACCCAGGTTGTTGCTCTCCTTGTTGCTCATGGAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTATGACCCCAATCATGTATGCTGCTCGAGATGGTCACACCCAGGTTGTTGCTCTCCTTGTTGCTCATGGAGC  518

Query  519  AGAAGTTAATACCCAGGATGAGAATGGTTACACTGCTTTAACGTGGGCAGCACGTCAGGGTCATAAAAATATAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGTTAATACCCAGGATGAGAATGGTTACACTGCTTTAACGTGGGCAGCACGTCAGGGTCATAAAAATATAG  592

Query  593  TTTTGAAGTTGCTTGAACTTGGAGCTAATAAAATGCTACAAACCAAAGATGGAAAGATGCCAAGTGAGATTGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTGAAGTTGCTTGAACTTGGAGCTAATAAAATGCTACAAACCAAAGATGGAAAGATGCCAAGTGAGATTGCA  666

Query  667  AAAAGAAACAAACATCATGAGATCTTCAACTTACTTTCTTTTACTTTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAAGAAACAAACATCATGAGATCTTCAACTTACTTTCTTTTACTTTAAATCCATTGGAAGGAAAACTTCAACA  740

Query  741  GCTAACTAAAGAAGACACTATTTGTAAAATATTGACAACAGATTCTGATAGAGAAAAAGATCACATTTTTAGTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTAACTAAAGAAGACACTATTTGTAAAATATTGACAACAGATTCTGATAGAGAAAAAGATCACATTTTTAGTT  814

Query  815  CATATACAGCATTTGGAGATCTGGAAGTATTTTTACATGGTCTTGGACTTGAACATATGACAGATTTACTAAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATATACAGCATTTGGAGATCTGGAAGTATTTTTACATGGTCTTGGACTTGAACATATGACAGATTTACTAAAG  888

Query  889  GAAAGGGATATAACGTTAAGACATCTTTTGACCATGAGGGAAGATGAATTTACAAAGAATGGAATTACCAGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAAGGGATATAACGTTAAGACATCTTTTGACCATGAGGGAAGATGAATTTACAAAGAATGGAATTACCAGTAA  962

Query  963  AGACCAGCAGAAAATTCTGGCTGCTCTTAAAGAACTACAGGTAGAAGAGATACAATTTGGAGAGCTATCTGAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACCAGCAGAAAATTCTGGCTGCTCTTAAAGAACTACAGGTAGAAGAGATACAATTTGGAGAGCTATCTGAAG  1036

Query 1037  AGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTCTCAAATTAAATAAACAGTGTGGCCATTTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACAAAGTTGGAAATCAGTGGTGATGAGTTCCTCAACTTTCTTCTCAAATTAAATAAACAGTGTGGCCATTTA  1110

Query 1111  ATAACAGCTGTACAGAATGTTATTACTGAGTTACCTGTAAATTCTCAAAAGGTA--------------TTCT--  1168
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||              ||||  
Sbjct 1111  ATAACAGCTGTACAGAATGTTATTACTGAGTTACCTGTAAATTCTCAAAAGATAACACTGGAATGGGCTTCTCC  1184

Query 1169  ACAAAAGTTAT---------------------------------------------------------------  1179
            .||.|| ||.|                                                               
Sbjct 1185  CCAGAA-TTTTACTTCAGTTTGTGAAGAATTGGTTAATAATGTTGAAGATTTGAGTGAAAAGGTCTGCAAACTA  1257

Query 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179
                                                                                      
Sbjct 1258  AAAGACCTAATTCAAAAGTTGCAAAATGAACGGGAAAATGATCCAACTCATATACAATTAAGGGAAGAAGTATC  1331

Query 1180  --------------------------------------------------------------------------  1179
                                                                                      
Sbjct 1332  TACATGGAATAGTAGAATTTTGAAGAGGACAGCTATTACCATATGCGGATTCGGTTTTCTTCTTTTCATTTGCA  1405

Query 1180  --------------------  1179
                                
Sbjct 1406  AGCTAACTTTCCAGAGGAAA  1425