Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_10956
- Subject:
- XM_024446444.1
- Aligned Length:
- 1384
- Identities:
- 1199
- Gaps:
- 173
Alignment
Query 1 ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCGATACACAACCATGAGACAGTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGA 74
Query 75 ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAAGGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAG 148
Query 149 AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAATCATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCAT 222
Query 223 CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTTATTTTATATTTGAATATATGAAAGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGA 296
Query 297 ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCAGTCATCAGAAATATTATGTATCAAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATA 370
Query 371 GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTTTGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGA 444
Query 445 GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATTAAGGTCACAGCCACCATACACTGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAG 518
Query 519 ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTGATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGC 592
Query 593 CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTCGATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGT 666
Query 667 GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGCATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAA 740
Query 741 AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATGAAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAAC 814
Query 815 GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAACACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCAT 888
Query 889 CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAAGCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCC 962
Query 963 TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATCAGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGC 1036
Query 1037 CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGCGTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACG 1110
Query 1111 CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACT-------AAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAAAGTGGTA 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||| |.||.|
Sbjct 1111 CTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACATGCCAACTGCTTCCAGAGCCA----GTACCC------------------ 1162
Query 1178 GGAGGCGTTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTGGAGATAGCTGGGAAGAGTTGGAGGACTATGATTTCGGAGCC 1251
||||.|| ||
Sbjct 1163 -------------TCAGGCT----------------------------------------------------CC 1171
Query 1252 TCCCATTCCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAAAGAAAA-AAGGAAAAAAGATT--CTCCATTTCGTCAACA 1322
..|||.||.| ||.|| ||||| ||| ||.|| ||
Sbjct 1172 AACCACTCGA----------CAGGG-----------GAAAACAAG------AGCTTACCT-------------- 1204
Query 1323 GGTGAAGATGGCTGTTATTTCCCT---CTCAGCACACCAGTTTCCCACGTTA 1371
|||||||.|||||| .||
Sbjct 1205 ----------GCTGTTACTTCCCTAAAATC---------------------- 1224