Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11039
• Subject: NM_000534.4
• Aligned Length: 932
• Identities: 668
• Gaps: 263

Alignment

Query   1  MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLENYGFDKIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYY  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLENYGFDKIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYY  74

Query  75  TSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSICCIAEVLITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRL  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSICCIAEVLITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRL  148

Query 149  FKNLPVRKQFYSTAKKCKDEIKKIQDLLMSFGILKPDLRIVFVHNKAVIWQKSRVSDHKMALMSVLGTAVMNNM  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  FKNLPVRKQFYSTAKKCKDEIKKIQDLLMSFGILKPDLRIVFVHNKAVIWQKSRVSDHKMALMSVLGTAVMNNM  222

Query 223  ESFQYHSEESQIYLSGFLPKCDADHSFTSLSTPERSFIFINSRPVHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFF  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ESFQYHSEESQIYLSGFLPKCDADHSFTSLSTPERSFIFINSRPVHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFF  296

Query 297  LKIDVPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKESVLIALENLMTTCYGPLPSTNSYENNKTDVSAADIVLSKTAETDVLF  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  LKIDVPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKESVLIALENLMTTCYGPLPSTNSYENNKTDVSAADIVLSKTAETDVLF  370

Query 371  NKVESSGKNYSNVDTSVIPFQNDMHNDESGKNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTKNAFQDISMSNV  444
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Sbjct 371  NKVESSGKNYSNVDTSVIPFQNDMHNDESGKNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTKNAFQDISMSNV  444

Query 445  SWENSQTEYSKTCFISSVKHTQSENGNKDHIDESGENEEEAGLENSSEISADEWSRGNILKNSVGENIEPVKIL  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  SWENSQTEYSKTCFISSVKHTQSENGNKDHIDESGENEEEAGLENSSEISADEWSRGNILKNSVGENIEPVKIL  518

Query 519  VPEKSLPCKVSNNNYPIPEQMNLNEDSCNKKSNVIDNKSGKVTAYDLLSNRVIKKPMSASALFVQDHRPQFLIE  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  VPEKSLPCKVSNNNYPIPEQMNLNEDSCNKKSNVIDNKSGKVTAYDLLSNRVIKKPMSASALFVQDHRPQFLIE  592

Query 593  NPKTSLEDATLQIEELWKTLSEEEKL------------------------------------------------  618
           ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 593  NPKTSLEDATLQIEELWKTLSEEEKLKYEEKATKDLERYNSQMKRAIEQESQMSLKDGRKKIKPTSAWNLAQKH  666

Query 619  --------------------------------------------------------------------------  618
                                                                                     
Sbjct 667  KLKTSLSNQPKLDELLQSQIEKRRSQNIKMVQIPFSMKNLKINFKKQNKVDLEEKDEPCLIHNLRFPDAWLMTS  740

Query 619  ----------------------------------------NLFNGSHYLDVLYKMTADDQRYSGSTYLSDPRLT  652
                                                   .|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  KTEVMLLNPYRVEEALLFKRLLENHKLPAEPLEKPIMLTESLFNGSHYLDVLYKMTADDQRYSGSTYLSDPRLT  814

Query 653  ANGFKIKLIPGVSITEN---------------------------------------------------------  669
           |||||||||||||||||                                                         
Sbjct 815  ANGFKIKLIPGVSITENYLEIEGMANCLPFYGVADLKEILNAILNRNAKEVYECRPRKVISYLEGEAVRLSRQL  888

Query 670  --------------------------------------------  669
                                                       
Sbjct 889  PMYLSKEDIQDIIYRMKHQFGNEIKECVHGRPFFHHLTYLPETT  932