Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_11039
Subject:
NM_001321044.2
Aligned Length:
770
Identities:
630
Gaps:
140

Alignment

Query   1  MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLENYGFDKIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYY  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MKQLPAATVRLLSSSQIITSVVSVVKELIENSLDAGATSVDVKLENYGFDKIEVRDNGEGIKAVDAPVMAMKYY  74

Query  75  TSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSICCIAEVLITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRL  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TSKINSHEDLENLTTYGFRGEALGSICCIAEVLITTRTAADNFSTQYVLDGSGHILSQKPSHLGQGTTVTALRL  148

Query 149  FKNLPVRKQFYSTAKKCKDEIKKIQDLLMSFGILKPDLRIVFVHNKAVIWQKSRVSDHKMALMSVLGTAVMNNM  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 149  FKNLPVRKQFYSTAKKCKDEIKKIQDLLMSFGILKPDLRIVFVHNK----------------------------  194

Query 223  ESFQYHSEESQIYLSGFLPKCDADHSFTSLSTPERSFIFINSRPVHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFF  296
                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195  -----------IYLSGFLPKCDADHSFTSLSTPERSFIFINSRPVHQKDILKLIRHHYNLKCLKESTRLYPVFF  257

Query 297  LKIDVPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKESVLIALENLMTTCYGPLPSTNSYENNKTDVSAADIVLSKTAETDVLF  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258  LKIDVPTADVDVNLTPDKSQVLLQNKESVLIALENLMTTCYGPLPSTNSYENNKTDVSAADIVLSKTAETDVLF  331

Query 371  NKVESSGKNYSNVDTSVIPFQNDMHNDESGKNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTKNAFQDISMSNV  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332  NKVESSGKNYSNVDTSVIPFQNDMHNDESGKNTDDCLNHQISIGDFGYGHCSSEISNIDKNTKNAFQDISMSNV  405

Query 445  SWENSQTEYSKTCFISSVKHTQSENGNKDHIDESGENEEEAGLENSSEISADEWSRGNILKNSVGENIEPVKIL  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 406  SWENSQTEYSKTCFISSVKHTQSENGNKDHIDESGENEEEAGLENSSEISADEWSRGNILKNSVGENIEPVKIL  479

Query 519  VPEKSLPCKVSNNNYPIPEQMNLNEDSCNKKSNVIDNKSGKVTAYDLLSNRVIKKPMSASALFVQDHRPQFLIE  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480  VPEKSLPCKVSNNNYPIPEQMNLNEDSCNKKSNVIDNKSGKVTAYDLLSNRVIKKPMSASALFVQDHRPQFLIE  553

Query 593  NPKTSLEDATLQIEELWKTLSEEEKLNLFNGSHYLDVLYKMTADDQRYSGSTYLSDPRLTANGFKIKLIPGVSI  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 554  NPKTSLEDATLQIEELWKTLSEEEKLNLFNGSHYLDVLYKMTADDQRYSGSTYLSDPRLTANGFKIKLIPGVSI  627

Query 667  TEN-----------------------------------------------------------------------  669
           |||                                                                       
Sbjct 628  TENYLEIEGMANCLPFYGVADLKEILNAILNRNAKEVYECRPRKVISYLEGEAVRLSRQLPMYLSKEDIQDIIY  701

Query 670  ------------------------------  669
                                         
Sbjct 702  RMKHQFGNEIKECVHGRPFFHHLTYLPETT  731