Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11039
- Subject:
- XM_017004346.2
- Aligned Length:
- 2796
- Identities:
- 1824
- Gaps:
- 972
Alignment
Query 1 ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGGTCAGTGTTGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGGTCAGTGTTGT 74
Query 75 AAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAACTATGGATTTG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACT----------------- 131
Query 149 ATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAATGAAGTACTAC 222
Sbjct 132 -------------------------------------------------------------------------- 131
Query 223 ACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAGCCTTGGGGTC 296
Sbjct 132 -------------------------------------------------------------------------- 131
Query 297 AATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAGTATGTTTTAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 ------------------GGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAGTATGTTTTAG 187
Query 371 ATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGTACAACTGTAACTGCTTTAAGATTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 ATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGTACAACTGTAACTGCTTTAAGATTA 261
Query 445 TTTAAGAATCTACCTGTAAGAAAGCAGTTTTACTCAACTGCAAAAAAATGTAAAGATGAAATAAAAAAGATCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 TTTAAGAATCTACCTGTAAGAAAGCAGTTTTACTCAACTGCAAAAAAATGTAAAGATGAAATAAAAAAGATCCA 335
Query 519 AGATCTCCTCATGAGCTTTGGTATCCTTAAACCTGACTTAAGGATTGTCTTTGTACATAACAAGGCAGTTATTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 AGATCTCCTCATGAGCTTTGGTATCCTTAAACCTGACTTAAGGATTGTCTTTGTACATAACAAGGCAGTTATTT 409
Query 593 GGCAGAAAAGCAGAGTATCAGATCACAAGATGGCTCTCATGTCAGTTCTGGGGACTGCTGTTATGAACAATATG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 GGCAGAAAAGCAGAGTATCAGATCACAAGATGGCTCTCATGTCAGTTCTGGGGACTGCTGTTATGAACAATATG 483
Query 667 GAATCCTTTCAGTACCACTCTGAAGAATCTCAGATTTATCTCAGTGGATTTCTTCCAAAGTGTGATGCAGACCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 GAATCCTTTCAGTACCACTCTGAAGAATCTCAGATTTATCTCAGTGGATTTCTTCCAAAGTGTGATGCAGACCA 557
Query 741 CTCTTTCACTAGTCTTTCAACACCAGAAAGAAGTTTCATCTTCATAAACAGTCGACCAGTACATCAAAAAGATA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 CTCTTTCACTAGTCTTTCAACACCAGAAAGAAGTTTCATCTTCATAAACAGTCGACCAGTACATCAAAAAGATA 631
Query 815 TCTTAAAGTTAATCCGACATCATTACAATCTGAAATGCCTAAAGGAATCTACTCGTTTGTATCCTGTTTTCTTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 TCTTAAAGTTAATCCGACATCATTACAATCTGAAATGCCTAAAGGAATCTACTCGTTTGTATCCTGTTTTCTTT 705
Query 889 CTGAAAATCGATGTTCCTACAGCTGATGTTGATGTAAATTTAACACCAGATAAAAGCCAAGTATTATTACAAAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 CTGAAAATCGATGTTCCTACAGCTGATGTTGATGTAAATTTAACACCAGATAAAAGCCAAGTATTATTACAAAA 779
Query 963 TAAGGAATCTGTTTTAATTGCTCTTGAAAATCTGATGACGACTTGTTATGGACCATTACCTAGTACAAATTCTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 TAAGGAATCTGTTTTAATTGCTCTTGAAAATCTGATGACGACTTGTTATGGACCATTACCTAGTACAAATTCTT 853
Query 1037 ATGAAAATAATAAAACAGATGTTTCCGCAGCTGACATCGTTCTTAGTAAAACAGCAGAAACAGATGTGCTTTTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 ATGAAAATAATAAAACAGATGTTTCCGCAGCTGACATCGTTCTTAGTAAAACAGCAGAAACAGATGTGCTTTTT 927
Query 1111 AATAAAGTGGAATCATCTGGAAAGAATTATTCAAATGTTGATACTTCAGTCATTCCATTCCAAAATGATATGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 AATAAAGTGGAATCATCTGGAAAGAATTATTCAAATGTTGATACTTCAGTCATTCCATTCCAAAATGATATGCA 1001
Query 1185 TAATGATGAATCTGGAAAAAACACTGATGATTGTTTAAATCACCAGATAAGTATTGGTGACTTTGGTTATGGTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 TAATGATGAATCTGGAAAAAACACTGATGATTGTTTAAATCACCAGATAAGTATTGGTGACTTTGGTTATGGTC 1075
Query 1259 ATTGTAGTAGTGAAATTTCTAACATTGATAAAAACACTAAGAATGCATTTCAGGACATTTCAATGAGTAATGTA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 ATTGTAGTAGTGAAATTTCTAACATTGATAAAAACACTAAGAATGCATTTCAGGACATTTCAATGAGTAATGTA 1149
Query 1333 TCATGGGAGAACTCTCAGACGGAATATAGTAAAACTTGTTTTATAAGTTCCGTTAAGCACACCCAGTCAGAAAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 TCATGGGAGAACTCTCAGACGGAATATAGTAAAACTTGTTTTATAAGTTCCGTTAAGCACACCCAGTCAGAAAA 1223
Query 1407 TGGCAATAAAGACCATATAGATGAGAGTGGGGAAAATGAGGAAGAAGCAGGTCTTGAAAACTCTTCGGAAATTT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 TGGCAATAAAGACCATATAGATGAGAGTGGGGAAAATGAGGAAGAAGCAGGTCTTGAAAACTCTTCGGAAATTT 1297
Query 1481 CTGCAGATGAGTGGAGCAGGGGAAATATACTTAAAAATTCAGTGGGAGAGAATATTGAACCTGTGAAAATTTTA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 CTGCAGATGAGTGGAGCAGGGGAAATATACTTAAAAATTCAGTGGGAGAGAATATTGAACCTGTGAAAATTTTA 1371
Query 1555 GTGCCTGAAAAAAGTTTACCATGTAAAGTAAGTAATAATAATTATCCAATCCCTGAACAAATGAATCTTAATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 GTGCCTGAAAAAAGTTTACCATGTAAAGTAAGTAATAATAATTATCCAATCCCTGAACAAATGAATCTTAATGA 1445
Query 1629 AGATTCATGTAACAAAAAATCAAATGTAATAGATAATAAATCTGGAAAAGTTACAGCTTATGATTTACTTAGCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1446 AGATTCATGTAACAAAAAATCAAATGTAATAGATAATAAATCTGGAAAAGTTACAGCTTATGATTTACTTAGCA 1519
Query 1703 ATCGAGTAATCAAGAAACCCATGTCAGCAAGTGCTCTTTTTGTTCAAGATCATCGTCCTCAGTTTCTCATAGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520 ATCGAGTAATCAAGAAACCCATGTCAGCAAGTGCTCTTTTTGTTCAAGATCATCGTCCTCAGTTTCTCATAGAA 1593
Query 1777 AATCCTAAGACTAGTTTAGAGGATGCAACACTACAAATTGAAGAACTGTGGAAGACATTGAGTGAAGAGGAAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1594 AATCCTAAGACTAGTTTAGAGGATGCAACACTACAAATTGAAGAACTGTGGAAGACATTGAGTGAAGAGGAAAA 1667
Query 1851 ACTGAA-------------------------------------------------------------------- 1856
||||||
Sbjct 1668 ACTGAAATATGAAGAGAAGGCTACTAAAGACTTGGAACGATACAATAGTCAAATGAAGAGAGCCATTGAACAGG 1741
Query 1857 -------------------------------------------------------------------------- 1856
Sbjct 1742 AGTCACAAATGTCACTAAAAGATGGCAGAAAAAAGATAAAACCCACCAGCGCATGGAATTTGGCCCAGAAGCAC 1815
Query 1857 -------------------------------------------------------------------------- 1856
Sbjct 1816 AAGTTAAAAACCTCATTATCTAATCAACCAAAACTTGATGAACTCCTTCAGTCCCAAATTGAAAAAAGAAGGAG 1889
Query 1857 -------------------------------------------------------------------------- 1856
Sbjct 1890 TCAAAATATTAAAATGGTACAGATCCCCTTTTCTATGAAAAACTTAAAAATAAATTTTAAGAAACAAAACAAAG 1963
Query 1857 -------------------------------------------------------------------------- 1856
Sbjct 1964 TTGACTTAGAAGAGAAGGATGAACCTTGCTTGATCCACAATCTCAGGTTTCCTGATGCATGGCTAATGACATCC 2037
Query 1857 -------------------------------------------------------------------------- 1856
Sbjct 2038 AAAACAGAGGTAATGTTATTAAATCCATATAGAGTAGAAGAAGCCCTGCTATTTAAAAGACTTCTTGAGAATCA 2111
Query 1857 ------------------------------------------------TCTTTTTAATGGATCTCATTATTTAG 1882
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2112 TAAACTTCCTGCAGAGCCACTGGAAAAGCCAATTATGTTAACAGAGAGTCTTTTTAATGGATCTCATTATTTAG 2185
Query 1883 ACGTTTTATATAAAATGACAGCAGATGACCAAAGATACAGTGGATCAACTTACCTGTCTGATCCTCGTCTTACA 1956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2186 ACGTTTTATATAAAATGACAGCAGATGACCAAAGATACAGTGGATCAACTTACCTGTCTGATCCTCGTCTTACA 2259
Query 1957 GCGAATGGTTTCAAGATAAAATTGATACCAGGAGTTTCAATTACTGAAAAT----------------------- 2007
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2260 GCGAATGGTTTCAAGATAAAATTGATACCAGGAGTTTCAATTACTGAAAATTACTTGGAAATAGAAGGAATGGC 2333
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2334 TAATTGTCTCCCATTCTATGGAGTAGCAGATTTAAAAGAAATTCTTAATGCTATATTAAACAGAAATGCAAAGG 2407
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2408 AAGTTTATGAATGTAGACCTCGCAAAGTGATAAGTTATTTAGAGGGAGAAGCAGTGCGTCTATCCAGACAATTA 2481
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2482 CCCATGTACTTATCAAAAGAGGACATCCAAGACATTATCTACAGAATGAAGCACCAGTTTGGAAATGAAATTAA 2555
Query 2008 ---------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2556 AGAGTGTGTTCATGGTCGCCCATTTTTTCATCATTTAACCTATCTTCCAGAAACTACA 2613