Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11323
- Subject:
- NM_011031.2
- Aligned Length:
- 1617
- Identities:
- 1307
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGCTCCAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGATGTCCTGGTTCGGTGTCCTGAGCTGGGTGCAGGCAGAATT 74
Query 1 -------------------ATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACA 55
|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 CTTCACCTCCATTGGGCACATGACCGATCTGATTTACGCAGAGAAGGACCTGGTACAGTCTCTGAAGGAGTACA 148
Query 56 TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCA 129
||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||.||||..|||
Sbjct 149 TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTCGCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAGCAAGATGGAAGCCCTGACCAGCAGATCA 222
Query 130 GCTGCTGATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTG 203
|||||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 223 GCTGCCGACCCCGAGGGCTACCTGGCTCATCCTGTGAATGCCTACAAGCTGGTGAAGCGGTTGAACACAGACTG 296
Query 204 GCCTGCGCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGT 277
||||||.||||.||||||||||||.|||||..|..|.|||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 297 GCCTGCACTGGGGGACCTTGTCCTTCAGGATGCTTCGGCAGGTTTTGTCGCTAACCTCTCAGTTCAGCGGCAAT 370
Query 278 TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGAC 351
|||||||||||||||||||||||...||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct 371 TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGTCTGGAGCTGCCAGAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACGTACAAACTGGAT 444
Query 352 CCAGGCACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGG 425
||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CCGGACACGATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGCACAAAGTACCAGGCCATGCTGAGTGTGGACGACTGCTTTGG 518
Query 426 GATGGGCCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGC 499
|.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 GCTGGGCCGCTCAGCTTACAATGAAGGAGACTATTACCATACTGTGCTGTGGATGGAGCAGGTACTGAAGCAGC 592
Query 500 TTGATGCCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTG 573
|.|||||.||||||||||||||....||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||..||
Sbjct 593 TCGATGCTGGGGAGGAGGCCACTGTTACCAAGTCCCTGGTGCTGGACTACCTGAGCTATGCTGTCTTCCAACTG 666
Query 574 GGTGATCTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG 647
|||||.|||||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGTGACCTGCACCGTGCTGTGGAACTCACCCGCCGCCTGCTCTCTCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG 740
Query 648 GAATCTGCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGC 721
||||||||||||||||||.|.|||.||.||||||||.||||..|||.|..|..|||||||||||||.||.|..|
Sbjct 741 GAATCTGCGGTACTTTGAACGGTTGTTAGAGGAAGAAAGAGGGAAATCACTGTCAAATCAGACAGACGCCGGAC 814
Query 722 TAGCAACCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGT 795
|.||.||||..|||..|.|.||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 815 TGGCCACCCAGGAAAACTTGTACGAGAGGCCCACGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTGTACGAGAGCCTGTGT 888
Query 796 CGTGGGGAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGC 869
||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.
Sbjct 889 CGAGGGGAGGGCGTGAAACTGACACCCCGGAGGCAGAAGAAGCTTTTCTGTAGGTACCATCATGGAAACAGAGT 962
Query 870 CCCACAGCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATG 943
.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GCCACAGCTCCTCATCGCCCCCTTCAAAGAGGAAGACGAGTGGGACAGCCCACACATCGTCAGGTACTATGATG 1036
Query 944 TCATGTCTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGAT 1017
|.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 TGATGTCCGACGAAGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATTGCTAAGCCCAAACTTGCACGAGCCACTGTGCGTGAC 1110
Query 1018 CCCAAGACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCC 1091
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111 CCCAAGACAGGTGTCCTCACTGTTGCCAGCTACAGAGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAGGATGACGACCC 1184
Query 1092 TGTTGTGGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGG 1165
||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||||||||..|.||.||||
Sbjct 1185 TGTTGTGGCCCGGGTCAACCGGCGGATGCAACATATCACCGGGCTAACGGTGAAGACTGCAGAGCTATTGCAGG 1258
Query 1166 TTGCAAATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAG--GCGACCTTTTGA--CAGCGG 1235
|.|||||.||.|||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|| |||| ||| .||..|
Sbjct 1259 TCGCAAACTACGGAATGGGGGGACAGTACGAACCACACTTTGACTTCTCAAGGAGCGA-----TGAGCAAGATG 1327
Query 1236 CCTCAAAAC----AGAG---GGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGT 1302
|.|..||.| ||.| |||||..|..|.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1328 CTTTCAAGCGTTTAGGGACTGGGAACCGTGTGGCCACGTTTCTAAACTACATGAGCGATGTCGAAGCTGGTGGT 1401
Query 1303 GCCACCGTCTTCCCTGATCTGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACC-TCT 1375
|||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||| |||
Sbjct 1402 GCCACCGTCTTTCCTGACTTGGGAGCTGCTATTTGGCCCAAGAAGGGCACAGCTGTATTCTGGTACAACCTTCT 1475
Query 1376 TGCGGAGCGGGGAAGGTGACTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCC 1449
| ||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 T-CGCAGTGGGGAAGGTGATTATCGGACGAGACATGCAGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCC 1548
Query 1450 AATAAGTGGTTCCATGAACGAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC 1512
||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 1549 AACAAGTGGTTCCATGAGCGAGGACAGGAGTTCTTAAGACCTTGTGGAACAACGGAAGTTGAT 1611