Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11342
• Subject: XM_006498640.2
• Aligned Length: 1842
• Identities: 1542
• Gaps: 120

Alignment

Query    1  ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACGTGCTGGGATTACAGTTGGTCCTGAGAAAAGGGTGCCAGCGATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC  148
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC  31

Query  149  AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTC  222
            ||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   32  AGTCAAGATCCTCACCTCCCATCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTT  105

Query  223  ACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCACCGCCACAGAG  296
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  106  ACTCCTACAGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCCCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCGCCACCACAGAG  179

Query  297  ATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCACTTGTGGTGCTC  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||..||||.||.|||||||||||||
Sbjct  180  ATTCAGCAATGGGCCTGCCTCCTCCACATCGTCAGCACTAACGAATCAACAGCTGCCGGCTACTTGTGGTGCTC  253

Query  371  GACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCCCTGAGATTGGG  444
            |.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct  254  GGCAGCTCAGCAAGTTGAAACGCTTCCTCACCACTCTGCAGCAGTTTGGCAATGATATCTCACCTGAGATCGGC  327

Query  445  GAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCACTGTAAGCTCCA  518
            ||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  328  GAGAAGGTTCGGACTCTCGTTCTAGCCTTGGTGAACTCAACAGTAACAATTGAAGAATTCCATTGCAAGCTCCA  401

Query  519  AGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGGG  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  402  GGAGGCCACAAACTTTCCTCTTCGTCCATTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGAG  475

Query  593  AACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAACACCTTCTGCTC  666
            |||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  476  AACTGCTGCACTGTGCCCGGGCTGCCAAGCAGACCCCGTCCCAGTACCTGGCCCAGCATGAGCACCTTCTGCTC  549

Query  667  AACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGGAAGAGGCCCAG  740
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  550  AACACCAGTATCGCATCTCCTGCTGACTCTTCTGAACTGCTCATGGAGGTTCATGGAAATGGAAAGAGGCCCAG  623

Query  741  TCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAAGAGAGTATGTA  814
            |||.||.|||||.||.|||||||.||||||.|||||.|||.||.|||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  624  TCCGGAAAGGAGGGACGAGAATAATTTTGAAAGAGATACAGTTCCTCCTGAACCGCCTGCCAAGAGAGTGTGTA  697

Query  815  CCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCTGGGGGCCAATTCCATCCT  888
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  698  CTATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCCGCCCTCACTGTTCCCCTTATGAATCCTGGGGGCCAGTTCCATCCT  771

Query  889  ACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCCAACAAGAT  962
            ||.||.||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  772  ACTCCACCACCTCTTCAGCACTATACACTAGAAGACATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCAAACAAGAT  845

Query  963  GCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG  1036
            ||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  GCTAGAACACCGAGAAGTTCGTGAGAGGCACCACAATCTTAGTCTCAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG  919

Query 1037  ATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATTGCATTATGGAA  1110
            |.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  920  ACCACCGTTTGACAGAAAGGGAGTGGGCTGATGAATGGAAACACCTTGACCATGCACTGAATTGCATTATGGAA  993

Query 1111  ATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAAGAACTCAACTA  1184
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  994  ATGGTAGAGAAAACTAGGCGCTCCATGGCAGTTCTGAGGCGCTGTCAGGAATCTGACCGTGAAGAACTCAACTA  1067

Query 1185  CTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAGGCAGCACAGCC  1258
            .||||||.|.||||..||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1068  TTGGAAACGGCGGTTTAATGAAAATACAGAGTTGAGGAAAACTGGGACTGAGTTGGTCTCTAGGCAGCACAGCC  1141

Query 1259  CTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAGGATACGTACCT  1332
            ||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.|.|||.||.||||..||||||||.||.|||
Sbjct 1142  CTGGGAGTACAGATTCTCTCAGCAACGATTCTCAGCGGGAATTTACCAGTAGACCAGCAACAGGATATGTGCCT  1215

Query 1333  GTGGAGTTTTGGAAAAAAACAGAAGAAGCTGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAAGTACAGAAGGC  1406
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1216  GTGGAGTTTTGGAAGAAAACAGAAGAAGCCGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAGGTACAGAAGGC  1289

Query 1407  CGTCGCTGAGGCAGAGCAGAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACAGAGAGAGCACGAATGGAGCAAACCATAGCGG  1480
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1290  TGTAGCTGAGGCAGAGCAAAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACGGAGAGAGCTCGAATGGAGCAGACCATAGCGG  1363

Query 1481  ATGTCAAGCGGCAGGCCGCAGAGGATGCTTTCCTCGTCATCAATGAGCAAGAGGAGTCCACGGAGAACTGCTGG  1554
            |||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1364  ATGTCAAACGGCAGGCTGCAGAAGATGCTTTCCTGGTCATCAATGAGCAAGAAGAGTCCACAGAGAACTGCTGG  1437

Query 1555  AACTGTGGCCGCAAAGCCAGCGAGACATGCAGTGGCTGCAATATCGCGCGATACTGTGGCTCTTTCTGCCAGCA  1628
            |||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1438  AACTGTGGCCGAAAAGCCAGTGAGACGTGCAGTGGCTGCAACATTGCTCGCTACTGCGGCTCCTTCTGCCAGCA  1511

Query 1629  CAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGTCAGAACCTGCATGGCCAGAGCCCCCACGGCCAGGGCCGGC  1702
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||||||||.||.||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1512  TAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGCCAGAGTCTACATGGCCACAGTCCCCACAGCCAGAGCAGGC  1585

Query 1703  CGCTGCTTCCTGTAGGCAGGGGCTCCTCTGCCAGGTCCGCCGACTGCAGCGTGCCCAGCCCAGCCCTCGACAAG  1776
            |.|||||.||||.|||..||||   |||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1586  CACTGCTCCCTGGAGGGCGGGG---CTCAGCCAGGTCTGCTGACTGCAGTGTGCCCAGCCCAGCCCTGGACAAG  1656

Query 1777  ACCTCGGCAACCACATCGCGTTCCTCAACACCTGCTTCTGTGACAGCTATCGACACCAACGGACTC  1842
            |||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|||||||.|||
Sbjct 1657  ACCTCAGCTACCACCTCACGGTCCTCAACACCTGCCTCTGTGACAGCCATTGATGCCAACGGGCTC  1722