Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11482
- Subject:
- NM_001301866.1
- Aligned Length:
- 1431
- Identities:
- 1012
- Gaps:
- 270
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
|||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 75 TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT 222
|
Sbjct 149 A------------------------------------------------------------------------- 149
Query 223 GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA 296
Sbjct 150 -------------------------------------------------------------------------- 149
Query 297 AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA 370
|.|||||||
Sbjct 150 ------------------------TCGAGGCAT----------------------------------------- 158
Query 371 TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT 444
.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 159 -------------------------------------------------GGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC 183
Query 445 CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT 518
|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 184 CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT 257
Query 519 CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA 592
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 258 CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCA 331
Query 593 TTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTG 666
||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.|||
Sbjct 332 TTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTG 405
Query 667 GACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTC 740
|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 406 GACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAAGTGCCTGTC 479
Query 741 CGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAG 814
.||||.||||||.|| |||.||||.|||.||||||||| ||.|||||||..|||||||||||||||||.|
Sbjct 480 AGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGG 547
Query 815 CCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCC 888
||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||
Sbjct 548 CCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCC 621
Query 889 GAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCA 962
||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||
Sbjct 622 GAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCA 695
Query 963 CTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGG 1036
.||.||.||||| |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.||||
Sbjct 696 TTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGG 766
Query 1037 CGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATC 1110
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 767 CCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATC 840
Query 1111 TACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCT 1184
|||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 841 TACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGT 914
Query 1185 GCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGT 1258
||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 915 GCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGT 988
Query 1259 ACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTC 1332
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 989 ACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTT 1062
Query 1333 CGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCG 1406
||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1063 CGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCG 1136
Query 1407 AGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1137 GGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC 1161