Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11482
• Subject: XM_011243703.2
• Aligned Length: 1554
• Identities: 1236
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            |||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct   75  TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222
            |..|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCGAGGCATGGCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAAT  222

Query  223  GGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCA  296

Query  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGA  370

Query  371  TCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAAT  444
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  371  TCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAAC  444

Query  445  CAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTT  518
            |||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTT  518

Query  519  CAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC----  588
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||    
Sbjct  519  CAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTG  592

Query  589  --------------------------------------------------------------------------  588
                                                                                      
Sbjct  593  GTAAGCCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATAAAGAGCGA  666

Query  589  ---------------------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGA  617
                                                         ||||||||.|||||||||||.||||..||
Sbjct  667  TGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGTACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAACCACAACGA  740

Query  618  AATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCA  691
            .|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct  741  GATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCA  814

Query  692  AACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCC  765
            |||                              |.||||||.|||||||.||||.||||||.||   |||.|||
Sbjct  815  AAC------------------------------GAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCC  855

Query  766  AGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCT  839
            |.|||.|||||||||   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  856  AACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCT  926

Query  840  GGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGA  913
            ||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct  927  GGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCA  1000

Query  914  TGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAG  987
            |||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.|||||   |||||||||.
Sbjct 1001  TGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGAT  1071

Query  988  AACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGA  1061
            |||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  AACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGA  1145

Query 1062  CTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGC  1135
            ||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||..|||||
Sbjct 1146  CTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGC  1219

Query 1136  ACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCG  1209
            |.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1220  ATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCG  1293

Query 1210  CAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCT  1283
            |||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1294  CAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCT  1367

Query 1284  CTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGT  1357
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1368  CTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGT  1441

Query 1358  GCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            |.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1442  GTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC  1515