Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11482
- Subject:
- XM_011243708.1
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1266
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
|||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 75 TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CC 162
|..|||.|.||| ||
Sbjct 149 ATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCTGATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCC 222
Query 163 AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC 296
Query 237 GGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT 310
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT 370
Query 311 TGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGG 384
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 371 TGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGG 444
Query 385 CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTC 458
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTC 518
Query 459 ATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCT 532
.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 519 CTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTT 592
Query 533 GCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC------------------ 588
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAAGCCTCACAAA 666
Query 589 -------------------------------------------------------------------------- 588
Sbjct 667 TGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATAAAGAGCGATGCCACAACTACTT 740
Query 589 -------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACC 631
||||||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||
Sbjct 741 GGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGTACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACC 814
Query 632 TGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCT 705
||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCT 888
Query 706 ATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGA 779
||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||.||||||.|| |||.||||.|||.||||||||
Sbjct 889 ATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGA 959
Query 780 GAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCC 853
| ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 960 G---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCC 1030
Query 854 TGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCAC 927
|||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1031 TGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCAC 1104
Query 928 AAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCT 1001
|||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.||||| |||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 1105 AAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCT 1175
Query 1002 CTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCG 1075
.|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1176 GTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAG 1249
Query 1076 AGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGG 1149
||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1250 AGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGG 1323
Query 1150 CTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCG 1223
|||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||
Sbjct 1324 CTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCG 1397
Query 1224 CGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACG 1297
.|||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1398 TGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACG 1471
Query 1298 TCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGC 1371
|||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1472 TCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGC 1545
Query 1372 CAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1546 CAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC 1605