Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_11696
- Subject:
- XM_006716441.1
- Aligned Length:
- 2650
- Identities:
- 1904
- Gaps:
- 725
Alignment
Query 1 ATGTGCTATGGAACTCCTAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGCTATGGAACTCCTAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACC 74
Query 75 AATGCTGCCCATCCACATGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AATGCTGCCCATCCACATGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATG 148
Query 149 ATTCTGTGGAGAGGCTGTATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATTCTGTGGAGAGGCTGTATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCC 222
Query 223 GACCATGGTTACCATATTGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACCATGGTTACCATATTGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGT 296
Query 297 GCCTTTTTTTATTCGTGGTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTTTTTTTATTCGTGGTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGG 370
Query 371 CCCCCACGATCCTGGATATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCCCACGATCCTGGATATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTG 444
Query 445 GACCCAGAAAAGCCAGGTAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACCCAGAAAAGCCAGGTAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGA 518
Query 519 AAGAGGCAAATTTCTACGTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGAGGCAAATTTCTACGTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATG 592
Query 593 AACGGGTCAAAGAACTATGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACGGGTCAAAGAACTATGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGC 666
Query 667 ATTGAGGATACATCTGGCAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGAGGATACATCTGGCAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAG 740
Query 741 CACGCGGAACCTCTACGCTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACGCGGAACCTCTACGCTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTG 814
Query 815 CCAGCAGAAGCCAAAGAAAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCAGCAGAAGCCAAAGAAAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTT 888
Query 889 GTCCATACTCGGCAGACACGTTCCTTGCCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGA 962
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTCCATACTCGGCAGACACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGA 962
Query 963 AGAAGAATTGCAAGTGTTGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGAAGAATTGCAAGTGTTGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATC 1036
Query 1037 TCCAGGCTTCCAGTGGTGGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCAGGCTTCCAGTGGTGGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACT 1110
Query 1111 GTCCGAGTGACACACAAGTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTCCGAGTGACACACAAGTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGC 1184
Query 1185 CAGAGCGTGGAAGGACCATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGAGCGTGGAAGGACCATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAA 1258
Query 1259 GAGAAGTGAGAGGACATCTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GAGAAGTGAGAGGACATCTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAA 1332
Query 1333 GAGAAAGGTGTAAAAAAGCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGAAAGGTGTAAAAAAGCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGA 1406
Query 1407 TAGCAAACTGCAACTTTTCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAGCAAACTGCAACTTTTCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGA 1480
Query 1481 AGGGGGAAGAGTGCAGCCTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGGGGAAGAGTGCAGCCTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTC 1554
Query 1555 TGGAACCTGGGATCTTTCTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGAACCTGGGATCTTTCTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGA 1628
Query 1629 GACGCATAATTTTCTTTTCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACGCATAATTTTCTTTTCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATC 1702
Query 1703 AGCTCACAAATACAGTGCACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCTCACAAATACAGTGCACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGA 1776
Query 1777 AGCTGTCAAGGATATAAGCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTT--GGAAATAAA---GATGGA--G 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.|...| |||||| |
Sbjct 1777 AGCTGTCAAGGATATAAGCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTTGAGGACAGTTATGGGATGGATGG 1850
Query 1844 GAAGCT--------------------------------------------ATGACCTACACAGAATGT---TG- 1869
||||.| |.||.|||||||| ||| ||
Sbjct 1851 GAAGGTTAATCAGCCCCGTCTCACTGCAGACATCAACTGGCAAGGCCTAGAGGAGCTACACAG--TGTGAATGA 1922
Query 1870 ------CT----GTTC---------------------CTGGTACCCTG-------------------TTCG--- 1890
|| ||.| |||||...||| ||.|
Sbjct 1923 AAACATCTATGAGTACAGACAAAACTACAGACTTAGTCTGGTGGACTGGACTAATTACTTGAAGGATTTAGATA 1996
Query 1891 --------GCCCCTCTAACCTCCAGAG---CTATG-------------------GTCTCAGA-TGCT------- 1926
||.|..||.| |||| ||||| |.||||.| ||||
Sbjct 1997 GAGTATTTGCACTGCTGA-----AGAGTCACTATGAGCAAAATAAAACAAATAAGACTCAAACTGCTCAAAGTG 2065
Query 1927 -----TCCTTT--------------------------------------------------------------- 1932
|.|||.
Sbjct 2066 ACGGGTTCTTGGTTGTCTCTGCTGAGCACGCTGTGTCAATGGAGATGGCCTCTGCTGACTCAGATGAAGACCCA 2139
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2140 AGGCATAAGGTTGGGAAAACACCTCATTTGACCTTGCCAGCTGACCTTCAAACCCTGCATTTGAACCGACCAAC 2213
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2214 ATTAAGTCCAGAGAGTAAACTTGAATGGAATAACGACATTCCAGAAGTTAATCATTTGAATTCTGAACACTGGA 2287
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2288 GAAAAACCGAAAAATGGACGGGGCATGAAGAGACTAATCATCTGGAAACCGATTTCAGTGGCGATGGCATGACA 2361
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2362 GAGCTAGAGCTCGGGCCCAGCCCCAGGCTGCAGCCCATTCGCAGGCACCCGAAAGAACTTCCCCAGTATGGTGG 2435
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2436 TCCTGGAAAGGACATTTTTGAAGATCAACTATATCTTCCTGTGCATTCCGATGGAATTTCAGTTCATCAGATGT 2509
Query 1933 -------------------------------------------------------------------------- 1932
Sbjct 2510 TCACCATGGCCACCGCAGAACACCGAAGTAATTCCAGCATAGCGGGGAAGATGTTGACCAAGGTGGAGAAGAAT 2583
Query 1933 ------------------------------------------------------------ 1932
Sbjct 2584 CACGAAAAGGAGAAGTCACAGCACCTAGAAGGCAGCGCCTCCTCTTCACTCTCCTCTGAT 2643