Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_11745
• Subject: XM_017316812.1
• Aligned Length: 1202
• Identities: 999
• Gaps: 133

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGGAGA  7
                                                                               |||||..
Sbjct    1  ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGCGAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATT  74

Query    8  AAAAGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  78
            ...||.||   ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT  144

Query   79  ACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGC  152
            ||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  145  ACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGC  218

Query  153  CGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCA  225
            ||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct  219  CGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCA  291

Query  226  CCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACA  296
            |||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  292  CCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACA  365

Query  297  AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  366  AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAG  439

Query  371  ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG-------------------------------------------------  395
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  440  ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGC  513

Query  396  -----GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCAC  464
                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  514  TCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCAC  587

Query  465  CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACAC  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  588  CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGC  661

Query  539  CATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGC  612
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  662  CATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGC  735

Query  613  TTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACAT  686
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  736  TTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACAT  809

Query  687  TCCTTTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGA  760
            .|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  810  CCCTCTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGA  883

Query  761  GGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTG  834
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTG  957

Query  835  GTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTAC  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  GTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTAC  1031

Query  909  TGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCG  982
            |||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1032  TGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTG  1105

Query  983  ACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTAC  1056
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1106  ACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTAC  1179

Query 1057  AGCCGATTTGCCCCCTAC  1074
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1180  AGCCGATTTGCCCCCTAC  1197