Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_12193
- Subject:
- NM_018263.6
- Aligned Length:
- 4305
- Identities:
- 2753
- Gaps:
- 1551
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGGGAAAAGGGACGTAGGAAGAAGGGCAGGACCTGGGCGGAGGCCGCCAAGACGGTCTTAGAAAAATACCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAATACACCCATGAGTCATAAAGAAATTCTTCAAGTTATCCAGAGAGAAGGACTAAAAGAAATCAGAAGTGGGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTTCTCCTCTTGCATGCCTGAATGCAATGCTTCACACAAACTCCAGAGGTGAAGAGGGCATCTTCTATAAGGTT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCAGGTAGAATGGGAGTATATACTTTGAAGAAAGATGTGCCGGATGGGGTGAAAGAGCTGTCAGAAGGTTCAGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGAAAGCAGTGATGGTCAGTCAGATTCCCAGAGTTCTGAGAACAGCAGCAGCAGCAGTGATGGTGGCAGCAACA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AGGAGGGAAAAAAGAGCAGGTGGAAAAGGAAAGTATCGTCGTCCTCCCCGCAGTCAGGCTGCCCATCACCCACC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ATTCCAGCAGGTAAAGTCATTTCTCCATCACAGAAGCACAGCAAGAAGGCACTAAAGCAGGCGCTAAAGCAGCA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 ACAGCAGAAGAAGCAGCAGCAGCAATGCAGGCCAAGCATATCCATCTCCTCCAACCAGCATCTCTCACTAAAGA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 CTGTCAAAGCAGCCAGTGACTCTGTACCTGCCAAACCTGCAACATGGGAAGGAAAGCAATCTGATGGACAGACA 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GGCAGCCCTCAAAACTCAAACTCCAGCTTTTCTTCCTCAGTTAAAGTGGAAAATACTTTACTAGGCTTGGGGAA 740
Query 1 ----------------------------------------ATGAAAAGAACTAAATGTGCTGACATTGACGTTG 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGTCATTCCAGAGATCTGAGAGACTCCATACCAGACAAATGAAAAGAACTAAATGTGCTGACATTGACGTTG 814
Query 35 AGACACCGGACTCCATTCTGGTTAATACAAATCTGCGAGCACTGATCAACAAGCACACATTTTCAGTCCTTCCT 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGACACCGGACTCCATTCTGGTTAATACAAATCTGCGAGCACTGATCAACAAGCACACATTTTCAGTCCTTCCT 888
Query 109 GGAGATTGCCAGCAACGACTGCTTTTACTACTCCCAGAGGTAGATCGACAGGTTGGTCCAGATGGTTTAATGAA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAGATTGCCAGCAACGACTGCTTTTACTACTCCCAGAGGTAGATCGACAGGTTGGTCCAGATGGTTTAATGAA 962
Query 183 GTTAAATGGCTCAGCCCTTAACAATGAATTCTTCACTTCAGCAGCCCAAGGCTGGAAGGAAAGACTCTCAGAAG 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTAAATGGCTCAGCCCTTAACAATGAATTCTTCACTTCAGCAGCCCAAGGCTGGAAGGAAAGACTCTCAGAAG 1036
Query 257 GTGAGTTTACACCTGAGATGCAGGTGAGAATTCGACAAGAGATTGAGAAGGAGAAAAAAGTGGAGCCATGGAAA 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGAGTTTACACCTGAGATGCAGGTGAGAATTCGACAAGAGATTGAGAAGGAGAAAAAAGTGGAGCCATGGAAA 1110
Query 331 GAACAATTCTTTGAAAGCTACTATGGGCAGAGTTCTGGCCTGAGCCTTGAAGATTCTAAGAAATTGACAGCTTC 404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAACAATTCTTTGAAAGCTACTATGGGCAGAGTTCTGGCCTGAGCCTTGAAGATTCTAAGAAATTGACAGCTTC 1184
Query 405 TCCCAGTGATCCCAAAGTAAAGAAAACCCCAGCTGAACAACCAAAATCCATGCCTGTGTCAGAGGCCTCTCTTA 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCCAGTGATCCCAAAGTAAAGAAAACCCCAGCTGAACAACCAAAATCCATGCCTGTGTCAGAGGCCTCTCTTA 1258
Query 479 TCAGAATAGTTCCAGTAGTCTCCCAGTCAGAGTGTAAAGAAGAAGCATTGCAAATGTCATCACCAGGCAGAAAA 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCAGAATAGTTCCAGTAGTCTCCCAGTCAGAGTGTAAAGAAGAAGCATTGCAAATGTCATCACCAGGCAGAAAA 1332
Query 553 GAAGAGTGTGAAAGCCAAGGTGAAGTGCAGCCGAACTTCTCCACATCTTCAGAGCCCCTGCTTTCCTCAGCTCT 626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGAGTGTGAAAGCCAAGGTGAAGTGCAGCCGAACTTCTCCACATCTTCAGAGCCCCTGCTTTCCTCAGCTCT 1406
Query 627 CAATACACATGAGCTTAGCAGCATTCTTCCCATCAAGTGCCCAAAGGATGAGGATCTCTTGGAGCAGAAGCCAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAATACACATGAGCTTAGCAGCATTCTTCCCATCAAGTGCCCAAAGGATGAGGATCTCTTGGAGCAGAAGCCAG 1480
Query 701 TCACCTCTGCTGAACAGGAATCTGAGAAGAACCATCTCACCACAGCTTCTAATTATAACAAAAGTGAAAGCCAA 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCACCTCTGCTGAACAGGAATCTGAGAAGAACCATCTCACCACAGCTTCTAATTATAACAAAAGTGAAAGCCAA 1554
Query 775 GAATCTTTAGTTACATCGCCAAGCAAACCCAAGAGTCCTGGGGTTGAAAAACCAATAGTGAAGCCCACAGCAGG 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATCTTTAGTTACATCGCCAAGCAAACCCAAGAGTCCTGGGGTTGAAAAACCAATAGTGAAGCCCACAGCAGG 1628
Query 849 AGCGGGTCCACAGGAGACTAATATGAAAGAACCTCTAGCAACTCTTGTTGATCAGAGCCCAGAAAGCCTCAAGA 922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCGGGTCCACAGGAGACTAATATGAAAGAACCTCTAGCAACTCTTGTTGATCAGAGCCCAGAAAGCCTCAAGA 1702
Query 923 GGAAGTCTTCCCTCACCCAAGAAGAGGCCCCTGTGAGCTGGGAGAAGAGGCCACGTGTCACTGAGAATCGCCAG 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGAAGTCTTCCCTCACCCAAGAAGAGGCCCCTGTGAGCTGGGAGAAGAGGCCACGTGTCACTGAGAATCGCCAG 1776
Query 997 CACCAGCAGCCATTTCAGGTCTCACCACAGCCCTTTCTCAATAGAGGGGACAGAATCCAGGTGCGAAAAGTACC 1070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CACCAGCAGCCATTTCAGGTCTCACCACAGCCCTTTCTCAATAGAGGGGACAGAATCCAGGTGCGAAAAGTACC 1850
Query 1071 ACCTCTCAAGATCCCGGTCTCCAGAATCTCCCCCATGCCGTTTCATCCATCGCAGGTCTCTCCCAGGGCTCGTT 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACCTCTCAAGATCCCGGTCTCCAGAATCTCCCCCATGCCGTTTCATCCATCGCAGGTCTCTCCCAGGGCTCGTT 1924
Query 1145 TTCCAGTCTCCATCACTAGTCCTAACAGAACAGGAGCCAGAACTCTTGCAGACATCAAAGCAAAAGCCCAACTG 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTCCAGTCTCCATCACTAGTCCTAACAGAACAGGAGCCAGAACTCTTGCAGACATCAAAGCAAAAGCCCAACTG 1998
Query 1219 GTCAAAGCACAGAGGGCAGCAGCTGCCGCTGCCGCCGCAGCTGCTGCAGCCGCCTCAGTTGGAGGGACCATTCC 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTCAAAGCACAGAGGGCAGCAGCTGCCGCTGCCGCCGCAGCTGCTGCAGCCGCCTCAGTTGGAGGGACCATTCC 2072
Query 1293 AGGACCTGGCCCAGGGGGTGGACAAGGTCCAGGAGAGGGTGGTGAAGGGCAGACTGCTAGAGGAGGCAGTCCAG 1366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGGACCTGGCCCAGGGGGTGGACAAGGTCCAGGAGAGGGTGGTGAAGGGCAGACTGCTAGAGGAGGCAGTCCAG 2146
Query 1367 GCTCAGACAGAGTCAGTGAAACTGGAAAGGGCCCCACACTGGAACTGGCAGGAACTGGAAGCAGGGGAGGTACG 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCTCAGACAGAGTCAGTGAAACTGGAAAGGGCCCCACACTGGAACTGGCAGGAACTGGAAGCAGGGGAGGTACG 2220
Query 1441 AGAGAGCTTTTACCCTGTGGTCCAGAGACTCAGCCCCAGTCTGAGACCAAGACCACCCCAAGCCAGGCACAGCC 1514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGAGAGCTTTTACCCTGTGGTCCAGAGACTCAGCCCCAGTCTGAGACCAAGACCACCCCAAGCCAGGCACAGCC 2294
Query 1515 TCATAGTGTCTCTGGAGCACAACTACAGCAAACCCCCCCAGTGCCTCCAACACCTGCCGTCAGTGGAGCATGCA 1588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TCATAGTGTCTCTGGAGCACAACTACAGCAAACCCCCCCAGTGCCTCCAACACCTGCCGTCAGTGGAGCATGCA 2368
Query 1589 CAAGTGTCCCATCACCAGTCCACATAGAGAAATTGGATAATGAAAAACTGAACCCCACCAGAGCAACAGCCACA 1662
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAAGTGTCCCATCACCAGCCCACATAGAGAAATTGGATAATGAAAAACTGAACCCCACCAGAGCAACAGCCACA 2442
Query 1663 GTGGCCTCTGTCAGCCATCCACAAGGGCCCAGTAGTTGCAGACAGGAGAAAGCACCTTCTCCAA---------- 1726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GTGGCCTCTGTCAGCCATCCACAAGGGCCCAGTAGTTGCAGACAGGAGAAAGCACCTTCTCCAACAGGTCCTGC 2516
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2517 TCTAATCTCAGGTGCCTCACCTGTTCATTGTGCAGCTGATGGCACAGTTGAGCTCAAAGCAGGTCCTAGTAAGA 2590
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2591 ATATACCTAACCCTTCAGCCTCATCAAAGACAGATGCTAGTGTGCCAGTGGCTGTAACTCCCTCCCCTTTAACA 2664
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2665 TCTTTATTGACCACAGCCACTTTAGAAAAGCTTCCTGTACCCCAGGTCAGTGCAACTACAGCACCTGCTGGATC 2738
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2739 AGCTCCACCCTCGAGCACTTTGCCAGCAGCTTCTAGCCTTAAAACCCCAGGAACTTCTTTAAACATGAATGGAC 2812
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2813 CCACTTTAAGACCAACCTCTAGTATCCCTGCTAATAATCCTTTAGTGACTCAGCTGCTTCAAGGCAAAGATGTT 2886
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2887 CCCATGGAGCAAATTCTGCCTAAACCTCTCACCAAAGTTGAAATGAAAACGGTTCCACTGACTGCAAAAGAGGA 2960
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 2961 AAGGGGGATGGGAGCGCTCATAGCTACCAACACAACAGAAAATAGCACCAGAGAGGAAGTTAATGAGAGACAGT 3034
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 3035 CCCATCCAGCTACGCAGCAGCAGCTGGGCAAAACCTTGCAAAGTAAGCAGCTCCCCCAGGTTCCAAGGCCCCTT 3108
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 3109 CAGCTCTTTTCAGCTAAGGAGCTGAGGGACTCCAGCATTGACACACACCAATACCACGAAGGACTAAGTAAAGC 3182
Query 1727 -------------------------------------------------------------------------- 1726
Sbjct 3183 AACCCAAGATCAGATCCTTCAGACTCTCATTCAGAGGGTTCGGAGGCAGAATCTTCTCTCAGTTGTGCCGCCCT 3256
Query 1727 ---------------------CAGGTTTCCAGCTGGAAGACATCTCCACAAGCCAGAGGTTCATGCTGGGTTTT 1779
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CACAGTTCAACTTCGCTCACTCAGGTTTCCAGCTGGAAGACATCTCCACAAGCCAGAGGTTCATGCTGGGTTTT 3330
Query 1780 GCTGGCAGAAGGACATCCAAACCTGCAATGGCAGGGCACTACTTACTGAATATTTCTACCTACGGCCGGGGCTC 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GCTGGCAGAAGGACATCCAAACCTGCAATGGCAGGGCACTACTTACTGAATATTTCTACCTACGGCCGGGGCTC 3404
Query 1854 AGAGAGCTTTAGGAGGACCCATTCTGTAAACCCTGAAGATCGTTTTTGTCTAAGCAGCCCCACTGAAGCCTTGA 1927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 AGAGAGCTTTAGGAGGACCCATTCTGTAAACCCTGAAGATCGTTTTTGTCTAAGCAGCCCCACTGAAGCCTTGA 3478
Query 1928 AAATGGGATATACAGACTGTAAAAATGCAACAGGAGAGAGTAGCAGCAGCAAAGAAGATGACACTGATGAGGAA 2001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 AAATGGGATATACAGACTGTAAAAATGCAACAGGAGAGAGTAGCAGCAGCAAAGAAGATGACACTGATGAGGAA 3552
Query 2002 AGTACTGGTGATGAGCAGGAATCTGTCACAGTGAAAGAGGAGCCCCAGGTTTCCCAGAGTGCTGGCAAGGGTGA 2075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 AGTACTGGTGATGAGCAGGAATCTGTCACAGTGAAAGAGGAGCCCCAGGTTTCCCAGAGTGCTGGCAAGGGTGA 3626
Query 2076 CACAAGTTCAGGACCTCACAGCAGGGAAACTCTATCTACCAGTGATTGCTTAGCTAGCAAGAATGTGAAGGCTG 2149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CACAAGTTCAGGACCTCACAGCAGGGAAACTCTATCTACCAGTGATTGCTTAGCTAGCAAGAATGTGAAGGCTG 3700
Query 2150 AGATACCATTGAATGAGCAAACCACTTTAAGTAAGGAGAATTACCTGTTCACTAGAGGCCAAACATTTGATGAA 2223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AGATACCATTGAATGAGCAAACCACTTTAAGTAAGGAGAATTACCTGTTCACTAGAGGCCAAACATTTGATGAA 3774
Query 2224 AAGACCCTAGCCAGAGATTTAATTCAGGCAGCACAGAAGCAGATGGCTCATGCAGTGAGAGGTAAGGCAATCCG 2297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 AAGACCCTAGCCAGAGATTTAATTCAGGCAGCACAGAAGCAGATGGCTCATGCAGTGAGAGGTAAGGCAATCCG 3848
Query 2298 TAGCAGCCCCGAGCTTTTCAGTTCTACTGTTCTTCCTCTGCCTGCAGACAGCCCCACCCACCAGCCCCTACTCC 2371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 TAGCAGCCCCGAGCTTTTCAGTTCTACTGTTCTTCCTCTGCCTGCAGACAGCCCCACCCACCAGCCCCTACTCC 3922
Query 2372 TTCCACCCCTGCAAACCCCGAAGTTGTATGGAAGCCCCACCCAGATAGGGCCAAGCTATAGAGGCATGATCAAT 2445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 TTCCACCCCTGCAAACCCCGAAGTTGTATGGAAGCCCCACCCAGATAGGGCCAAGCTATAGAGGCATGATCAAT 3996
Query 2446 GTCTCCACCTCATCTGACATGGACCATAACTCTGCTGTACCAGGTAGCCAGGTATCTAGCAATGTAGGTGATGT 2519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 GTCTCCACCTCATCTGACATGGACCATAACTCTGCTGTACCAGGTAGCCAGGTATCTAGCAATGTAGGTGATGT 4070
Query 2520 CATGTCATTTTCAGTGACTGTCACTACCATCCCTGCTAGCCAAGCTATGAATCCCAGCAGCCATGGCCAGACCA 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4071 CATGTCATTTTCAGTGACTGTCACTACCATCCCTGCTAGCCAAGCTATGAATCCCAGCAGCCATGGCCAGACCA 4144
Query 2594 TTCCTGTTCAGGCGTTCTCCGAAGAGAACAGCATAGAGGGCACGCCTTCGAAATGTTACTGCCGCTTGAAAGCC 2667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4145 TTCCTGTTCAGGCGTTCTCCGAAGAGAACAGCATAGAGGGCACGCCTTCGAAATGTTACTGCCGCTTGAAAGCC 4218
Query 2668 ATGATCATGTGCAAAGGCTGTGGCGCTTTCTGCCATGATGATTGCATCGGCCCCTCCAAACTGTGCGTCTCCTG 2741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4219 ATGATCATGTGCAAAGGCTGTGGCGCTTTCTGCCATGATGATTGCATCGGCCCCTCCAAACTGTGCGTCTCCTG 4292
Query 2742 CCTTGTCGTTCGG 2754
|||||||||||||
Sbjct 4293 CCTTGTCGTTCGG 4305
