Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12193
• Subject: NM_018263.6
• Aligned Length: 1435
• Identities: 917
• Gaps: 517

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MREKGRRKKGRTWAEAAKTVLEKYPNTPMSHKEILQVIQREGLKEIRSGTSPLACLNAMLHTNSRGEEGIFYKV  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  PGRMGVYTLKKDVPDGVKELSEGSEESSDGQSDSQSSENSSSSSDGGSNKEGKKSRWKRKVSSSSPQSGCPSPT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  IPAGKVISPSQKHSKKALKQALKQQQQKKQQQQCRPSISISSNQHLSLKTVKAASDSVPAKPATWEGKQSDGQT  222

Query    1  --------------------------------------MKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLP  36
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GSPQNSNSSFSSSVKVENTLLGLGKKSFQRSERLHTRQMKRTKCADIDVETPDSILVNTNLRALINKHTFSVLP  296

Query   37  GDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEIEKEKKVEPWK  110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GDCQQRLLLLLPEVDRQVGPDGLMKLNGSALNNEFFTSAAQGWKERLSEGEFTPEMQVRIRQEIEKEKKVEPWK  370

Query  111  EQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRK  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  EQFFESYYGQSSGLSLEDSKKLTASPSDPKVKKTPAEQPKSMPVSEASLIRIVPVVSQSECKEEALQMSSPGRK  444

Query  185  EECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQ  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EECESQGEVQPNFSTSSEPLLSSALNTHELSSILPIKCPKDEDLLEQKPVTSAEQESEKNHLTTASNYNKSESQ  518

Query  259  ESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQ  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ESLVTSPSKPKSPGVEKPIVKPTAGAGPQETNMKEPLATLVDQSPESLKRKSSLTQEEAPVSWEKRPRVTENRQ  592

Query  333  HQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADIKAKAQL  406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  HQQPFQVSPQPFLNRGDRIQVRKVPPLKIPVSRISPMPFHPSQVSPRARFPVSITSPNRTGARTLADIKAKAQL  666

Query  407  VKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGT  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  VKAQRAAAAAAAAAAAAASVGGTIPGPGPGGGQGPGEGGEGQTARGGSPGSDRVSETGKGPTLELAGTGSRGGT  740

Query  481  RELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPVHIEKLDNEKLNPTRATAT  554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  741  RELLPCGPETQPQSETKTTPSQAQPHSVSGAQLQQTPPVPPTPAVSGACTSVPSPAHIEKLDNEKLNPTRATAT  814

Query  555  VASVSHPQGPSSCRQEKAPSPT----------------------------------------------------  576
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  815  VASVSHPQGPSSCRQEKAPSPTGPALISGASPVHCAADGTVELKAGPSKNIPNPSASSKTDASVPVAVTPSPLT  888

Query  577  --------------------------------------------------------------------------  576
                                                                                      
Sbjct  889  SLLTTATLEKLPVPQVSATTAPAGSAPPSSTLPAASSLKTPGTSLNMNGPTLRPTSSIPANNPLVTQLLQGKDV  962

Query  577  --------------------------------------------------------------------------  576
                                                                                      
Sbjct  963  PMEQILPKPLTKVEMKTVPLTAKEERGMGALIATNTTENSTREEVNERQSHPATQQQLGKTLQSKQLPQVPRPL  1036

Query  577  ---------------------------------------------------------GFQLEDISTSQRFMLGF  593
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct 1037  QLFSAKELRDSSIDTHQYHEGLSKATQDQILQTLIQRVRRQNLLSVVPPSQFNFAHSGFQLEDISTSQRFMLGF  1110

Query  594  AGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEE  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGRRTSKPAMAGHYLLNISTYGRGSESFRRTHSVNPEDRFCLSSPTEALKMGYTDCKNATGESSSSKEDDTDEE  1184

Query  668  STGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDE  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  STGDEQESVTVKEEPQVSQSAGKGDTSSGPHSRETLSTSDCLASKNVKAEIPLNEQTTLSKENYLFTRGQTFDE  1258

Query  742  KTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRGMIN  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  KTLARDLIQAAQKQMAHAVRGKAIRSSPELFSSTVLPLPADSPTHQPLLLPPLQTPKLYGSPTQIGPSYRGMIN  1332

Query  816  VSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKA  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  VSTSSDMDHNSAVPGSQVSSNVGDVMSFSVTVTTIPASQAMNPSSHGQTIPVQAFSEENSIEGTPSKCYCRLKA  1406

Query  890  MIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR  918
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  MIMCKGCGAFCHDDCIGPSKLCVSCLVVR  1435