Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12258
• Subject: XM_024449054.1
• Aligned Length: 1503
• Identities: 1026
• Gaps: 474

Alignment

Query    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCACCTGACTACGAAGTGCTATCCGTGCGAGAACAGCTATTCCACGAGAGGATCCGCGAGTGTATTAT  74

Query   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCAACACTTCTGTTTGCAACACTGTACATCCTCTGCCACATCTTCCTGACCCGCTTCAAGAAGCCTGCTGAGT  148

Query  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCACCACAGTGGATGATGAAGATGCCACCGTCAACAAGATTGCGCTCGAGCTGTGCACCTTTACCCTGGCAATT  222

Query  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCTGGGTGCTGTCCTGCTCCTGCCCTTCTCCATCATCAGCAATGAGGTGCTGCTCTCCCTGCCTCGGAACTA  296

Query  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTACATCCAGTGGCTCAACGGCTCCCTCATCCATGGCCTCTGGAACCTTGTTTTTCTCTTCTCCAACCTGTCCC  370

Query  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATCTTCCTCATGCCCTTTGCATATTTCTTCACTGAGTCTGAGGGCTTTGCTGGCTCCAGAAAGGGTGTCCTG  444

Query  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCGGGTCTATGAGACAGTGGTGATGTTGATGCTCCTCACTCTGCTGGTGCTAGGTATGGTGTGGGTGGCATC  518

Query  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCATTGTGGACAAGAACAAGGCCAACAGAGAGTCACTCTATGACTTTTGGGAGTACTATCTCCCCTACCTCT  592

Query  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGTTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTCATGCATCTCCTTCCTTGGGGTTCTGCTGCTCCTGGTGTGTACTCCACTGGGTCTCGCCCGCATGTTCTCC  666

Query  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCACTGGGAAGCTGCTAGTCAAGCCCCGGCTGCTGGAAGACCTGGAGGAGCAGCTGTACTGCTCAGCCTTTGA  740

Query  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGCAGCCCTGACCCGCAGGATCTGTAATCCTACTTCCTGCTGGCTGCCTTTAGACATGGAGCTGCTACACA  814

Query  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTG------------------------------------  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct  815  GACAGGTCCTGGCTCTGCAGACACAGAGGGTCCTGCTGGGTATGTGGCTTCGTAGGGCTTGGGATACCTGGGTT  888

Query  853  ------------------------------------------------------------GAGAAGAGGCGGAA  866
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  889  TCCCCAAGGAGAGTAGCCCCTGGTTCCAGGTGCTTGCTGACAGCCTCCCATCCCTGCACAGAGAAGAGGCGGAA  962

Query  867  GGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTG  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTTCAGCCTGGCAACGGAACCTGGGCTACCCCCTGGCTATGCTGTGCTTGCTGGTGCTGACGGGCCTGTCTG  1036

Query  941  TGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAGGTTGTA  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1037  TGCTCATTGTGGCCATCCACATCCTGGAGCTGCTCATCGATGAGGCTGCCATGCCCCGAGGCATGCAG------  1104

Query 1015  CTCATCTTTTACCTAATGGTGTCCTCAGTTGTGGGCTTCTATAGCTCTCCACTCTTCCGGAGCCTGCGGCCCAG  1088
              ||     .||||    ||.|||       ||||               ||||                    
Sbjct 1105  --CA-----AACCT----GTCTCC-------TGGG---------------ACTC--------------------  1125

Query 1089  ATGGCACGACACTGCCATGACGCAGATAATTGGGAACTGTGTCTGTCTCCTGGTCCTAAGCTCAGCACTTCCTG  1162
                                                                                      
Sbjct 1126  --------------------------------------------------------------------------  1125

Query 1163  TCTTCTCTCGAACCCTGGGGCTCACTCGCTTTGACCTGCTGGGTGACTTTGGACGCTTCAACTGGCTGGGCAAT  1236
                                                                                      
Sbjct 1126  --------------------------------------------------------------------------  1125

Query 1237  TTCTACATTGTGTTCCTCTACAACGCAGCCTTTGCAGGCCTCACCACACTCTGTCTGGTGAAGACCTTCACTGC  1310
                                                                                      
Sbjct 1126  --------------------------------------------------------------------------  1125

Query 1311  AGCTGTGCGGGCAGAGCTGATCCGGGCCTTTGGGCTGGACAGACTGCCGCTGCCCGTCTCCGGTTTCCCCCAGG  1384
                                                                                      
Sbjct 1126  --------------------------------------------------------------------------  1125

Query 1385  CATCTAGGAAGACCCAGCACCAG  1407
                                   
Sbjct 1126  -----------------------  1125