Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12574
• Subject: XM_017009846.2
• Aligned Length: 1611
• Identities: 1095
• Gaps: 516

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGCGAGGCCCGGCCCCCAATTCCCCCAGCGAGGGAGGGAGGCCCCCGGCGGCCGGGAGCCTGCGAGCCGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCGGGACCCGAGCGCACGCAGGGGCGCGGCGACGGCGGGGGCTAGTCGGGCTGCGGAGGCGGCCGTCGGGAGTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CGGAGCGCCTCGGACGAGGGTCCAACCGCCGGCAGGCACCAGAGGGCACGGCTGGCTCGGCACTGGGAGGGGCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CGGCGCTCGCAGCCCCCCACGCCCAGAGAGGATGCGGTGCGCCCTGAGAGCCGGGTAGCCTCGGATAGCGGCGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TGCGTACGCGATGATGGATGAGCCGTGGTGGGAAGGGCGCGTCGCCTCGGACGTCCACTGCACCCTGCGCGAGA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  AGGAACTGAAGCTGCCCACCTTCCGAGCCCACTCCCCACTCCTGAAGAGCCGCCGGTTCTTCGTGGACATCCTG  444

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct  445  ACCCTGCTGAGCAGCCACTGCCAGCTCTGCCCTGCAGCCCGGCACCTGGCCGTCTACCTGCTGGACCACTTCAT  518

Query    3  GGATCGCTACAACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAG  76
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATCGCTACAACGTCACCACCTCCAAGCAGCTCTACACCGTGGCCGTCTCCTGCCTCCTGCTTGCAAACGGAG  592

Query   77  TTTCGCTCTTATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCA  150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTCGCTCTTATCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCATGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCA  666

Query  151  AGCAATTCTCCTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTCGA  224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCAATTCTCCTGCTTCAGCGCCCCACCCCCCACCCACACCGCCCCAAGTAGCTGAGACTACAGGTAAGTTCGA  740

Query  225  GGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCC  298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATCGGGAAGACCACGTCCCCAAGTTGGAGCAAATAAACAGCACGAGGATCCTGAGCAGCCAGAACTTCACCC  814

Query  299  TCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACG  372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCACCAAGAAGGAGCTGCTGAGCACAGAGCTGCTGCTCCTGGAGGCCTTCAGCTGGAACCTCTGCCTGCCCACG  888

Query  373  CCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCAC  446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGCCCACTTCCTGGACTACTACCTCTTGGCCTCCGTCAGCCAGAAGGACCACCACTGCCACACCTGGCCCAC  962

Query  447  CACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATC  520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACCTGCCCCCGCAAGACCAAAGAGTGCCTCAAGGAGTATGCCCATTACTTCCTAGAGGTCACCCTGCAAGATC  1036

Query  521  ACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTT  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATATTCTACAAATTCCAGCCTTCTGTGGTCGCTGCGGCCTGTGTTGGGGCCTCCAGGATTTGCCTGCAGCTT  1110

Query  595  TCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAAT  668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTCCCTACTGGACCAGAGACCTGCAGAGGATCTCAAGCTATTCCCTGGAGCACCTCAGCACGTGTATTGAAAT  1184

Query  669  CCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCG  742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGCTGGTAGTGTATGACAACGTCCTCAAGGATGCCGTAGCCGTCAAGAGCCAGGCCTTGGCAATGGTGCCCG  1258

Query  743  GCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACC  816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCACACCCCCCACCCCCACTCAAGTGCTGTTCCAGCCACCAGCCTACCCGGCCCTCGGCCAGCCAGCGACCACC  1332

Query  817  CTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGG  890
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGCACAGTTCCAGACCCCCGTGCAGGACCTATGCTTGGCCTATCGGGACTCCTTGCAGGCCCACCGTTCAGG  1406

Query  891  GAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTC  964
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGCCTGCTCTCGGGGAGTACAGGCTCATCCCTCCACACCCCGTACCAACCGCTGCAGCCCTTGGATATGTGTC  1480

Query  965  CCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACC  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCGTGCCCGTCCCTGCATCCCTTAGCATGCATATGGCCATTGCAGCTGAGCCCAGGCACTGCCTCGCCACCACC  1554

Query 1039  TATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1095
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATGGAAGCAGCTACTTCAGTGGGAGCCACATGTTCCCCACCGGCTGCTTTGACAGA  1611