Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_12690
• Subject: NM_026485.2
• Aligned Length: 1132
• Identities: 859
• Gaps: 146

Alignment

Query    1  ATGGACGGGGAGGAGCAGCAGCCACCGCACGAGGCCAACGTGGAACCTGTTGT---------------------  53
            |||||.||.||||   ||.|||||.|.||.|||||..|||||||||||||.||                     
Sbjct    1  ATGGAGGGAGAGG---AGAAGCCAGCTCAAGAGGCTGACGTGGAACCTGTGGTAACAGCAGGCACCTCAGAAGC  71

Query   54  -----------------------GCCGTCAGA-----------------GGCTTCA------------------  69
                                   .||.|||||                 |.|||||                  
Sbjct   72  AGTGCCAAGGGTGCTTGCTGGAGACCCTCAGAACATCTCTGATGTGGATGCCTTCAACTTGCTCCTGGAGATGA  145

Query   70  -----------------------------------------------GAGCCGGTGCC------------CAGG  84
                                                           .|||..|||.|            ||||
Sbjct  146  AACTGAAACGACGGCGTGAACGCCCCAACCTTCCACGTACAGTGACCCAGCTAGTGGCCGAGGATGGGAGCAGG  219

Query   85  GTGTACGTGGTGGGGACAGCCCACTTCAGCGACGACAGCAAGAGGGACGTTGTGAAGACCATCCGGGAGGTGCA  158
            |||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  220  GTGTATGTGGTGGGCACTGCTCACTTCAGTGATGATAGCAAGAGAGATGTAGTAAAGACTATCCGGGAGGTGCA  293

Query  159  GCCTGACGTGGTGGTCGTGGAGCTCTGCCAATATCGTGTGTCCATGCTGAAGATGGACGAGAGCACGCTGCTGC  232
            .||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  294  ACCGGATGTGGTCGTGGTGGAGCTCTGTCAGTACCGGGTGTCCATGCTCAAGATGGACGAGAGGACGCTGCTGC  367

Query  233  GGGAGGCCCAGGAGCTCAGCCTGGAGAAGCTGCAGCAGGCCGTGAGGCAGAACGGGCTCATGTCGGGGCTGATG  306
            |.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  368  GAGAGGCCAAGGAGGTCAGCCTGGAGAAGCTGCAGCAGGCTGTCAGGCAGAATGGGCTTATGTCTGGACTCATG  441

Query  307  CAGATGCTGCTGCTGAAGGTGTCTGCACACATCACCGAGCAGCTGGGCATGGCCCCAGGTGGCGAGTTCAGGGA  380
            ||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  442  CAGATGTTGCTGCTGAAGGTGTCTGCTCACATCACTGAGCAGCTGGGCATGGCCCCTGGTGGCGAGTTCAGGGA  515

Query  381  GGCCTTCAAGGAGGCCAGCAAGGTGCCTTTCTGCAAGTTCCACCTGGGTGACCGACCCATCCCCGTCACCTTCA  454
            |||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  516  GGCCTTCAAAGAGGCCAGCAAGGTACCATTCTGCAAATTCCACCTGGGTGACCGACCAATCCCAGTCACCTTTA  589

Query  455  AGAGGGCCATCGCAGCGCTCTCCTTCTGGCAGAAGGTCAGGCTGGCTTGGGGCCTGTGCTTCCTGTCAGACCCC  528
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  590  AGAGGGCCATTGCTGCACTCTCCTTCTGGCAGAAAGTCAAGCTGGCCTGGGGCCTGTGCTTCCTGTCAGACCCA  663

Query  529  ATCAGCAAGGATGACGTGGAACGCTGCAAGCAGAAGGACCTACTGGAGCAGATGATGGCCGAGATGATTGGCGA  602
            ||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  664  ATCAGCAAAGACGACGTGGAGCGCTGCAAACAGAAGGACCTGTTGGAGCAGATGATGGCCGAGATGATTGGGGA  737

Query  603  GTTCCCAGACCTGCACCGCACCATCGTCTCGGAGCGCGACGTCTACCTAACCTACATGCTGCGCCAGGCCGCGC  676
            |||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  738  GTTTCCTGACCTGCATCGCACCATTGTCTCAGAGCGTGACGTCTATCTGACCTATATGCTGCGGCAGGCCGCAC  811

Query  677  GGCGCCTCGAGCTGCCTCGGGCCTCTGACGCCGAGCCCAGGAAGTGCGTCCCCTCCGTGGTCGTGGGCGTCGTG  750
            |||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  812  GGCGCCTTGAGCTTCCCCGCGCCTCTGATGCTGAGCCCAGGAAGTGTGTCCCGTCTGTGGTTGTGGGCGTCGTT  885

Query  751  GGCATGGGCCACGTGCCTGGCATCGAGAAGAACTGGAGCACCGACCTCAACATCCAGGAGATCATGACCGTGCC  824
            ||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  886  GGCATGGGGCATGTGCCTGGCATTGAGAAGAACTGGAGTACCGACCTCAACATCCAGGAGATCATGACAGTCCC  959

Query  825  CCCGCCGTCCGTCTCCGGCAGAGTGTCTCGGTTGGCCGTGAAGGCCGCCTTCTTCGGCCTGCTGGGCTACAGCC  898
            |||.||||||.||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  960  CCCACCGTCCATCTCAGGCAGAGTGTCCCGGGTGGCTGTGAAGGCGGCCTTCTTTGGTCTCCTGGGCTATAGCC  1033

Query  899  TGTACTGGATGGGCCGCCGCACCGCGAGCCTGGTCCTGTCGCTGCCCGCCGCGCAGTACTGCCTGCAGAGGGTG  972
            ||||||||||||||||.||.|||..||.||||||||||||.|||||.||.||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1034  TGTACTGGATGGGCCGTCGGACCCTGAACCTGGTCCTGTCACTGCCTGCTGCACAGTTCTGCCTCCAGAGGGTG  1107

Query  973  ACCGAGGCCCGGCACAAG----  990
            |.|||.||||||| ||.|    
Sbjct 1108  AGCGAAGCCCGGC-CAGGCCGG  1128