Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12758
Subject:
NM_001170535.3
Aligned Length:
671
Identities:
465
Gaps:
154

Alignment

Query   1  ---------------------------------------------------------------------MQLEA  5
                                                                                ....|
Sbjct   1  MSWLFGINKGPKGEGAGPPPPLPPAQPGAEGGGDRGLGDRPAPKDKWSNFDPTGLERAAKAARELEHSRYAKDA  74

Query   6  LNLLHTLVWARSLCRAGAVQTQERLSGSASPEQVPAGECCALQEYEAAVEQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQ  79
           |||               .|.||        ..........|.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  LNL---------------AQMQE--------QTLQLEQQSKLKEYEAAVEQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQ  125

Query  80  HQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQQLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATVEREMELRHKNEMLRVETEARARAKA  153
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 126  HQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQQLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATVEREMELRHKNEMLRVEAEARARAKA  199

Query 154  ERENADIIREQIRLKASEHRQTVLESIRTAGTLFGEGFRAFVTDRDKVTATVAGLTLLAVGVYSAKNATAVTGR  227
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 200  ERENADIIREQIRLKAAEHRQTVLESIRTAGTLFGEGFRAFVTDWDKVTATVAGLTLLAVGVYSAKNATLVAGR  273

Query 228  FIEARLGKPSLVRETSRITVLEALRHPIQVSRRLLSRPQDVLEGVVLSPSLEARVRDIAIATRNTKKNRGLYRH  301
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 274  FIEARLGKPSLVRETSRITVLEALRHPIQVSRRLLSRPQDALEGVVLSPSLEARVRDIAIATRNTKKNRSLYRN  347

Query 302  ILLYGPPGTGKTLFAKKLALHSGMDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLFDWANTSRRGLLLFMDEADAFLRKRA  375
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 348  ILMYGPPGTGKTLFAKKLALHSGMDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLFDWANTSRRGLLLFVDEADAFLRKRA  421

Query 376  TEEISKDLRATLNAFLYHMGQHSNKFMLVLASNLPEQFDCAINSRIDVMVHFDLPQQEERERLVRLHFDNCVLK  449
           ||.||.|||||||||||..||||||||||||||.|||||.|||.||..|||||||.|||||||||..||..|||
Sbjct 422  TEKISEDLRATLNAFLYRTGQHSNKFMLVLASNQPEQFDWAINDRINEMVHFDLPGQEERERLVRMYFDKYVLK  495

Query 450  PATEGKRRLKLAQFDYGRKCSEVARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYASKDGVLTEAMMDACVQDAVQQYRQKM  523
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||..|||
Sbjct 496  PATEGKQRLKLAQFDYGRKCSEVARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYASEDGVLTEAMMDTRVQDAVQQHQQKM  569

Query 524  RWLKAEGPGRGVEHPLSGVQGETLTSWSLATDPSYPCLAGPCTFRICSWMGTGLCPGPLSPRMSCGGGRPFCPP  597
           .||||||||||.|...|                                                         
Sbjct 570  CWLKAEGPGRGDEPSPS---------------------------------------------------------  586

Query 598  GHPLL  602
                
Sbjct 587  -----  586