Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_12824
Subject:
NM_032451.2
Aligned Length:
2142
Identities:
1742
Gaps:
399

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCCGGGCGGGCAGCTGCGGCGGCGCCGCGGCGGGCGCAGGGCGGCCGGAGCCCTGGGAGCTGTCCCTGGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGGTGCTGAAGGCCTACGAGCAGCCGCTCAACGAGGAGCAGGCGTGGGCCGTGTGCTTCCAGGGCTGCCGCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGCTGCGGGGCTCGCCGGGCCGGCGCCTGCGGGATACCGGGGACCTCCTGCTGCGCGGGGACGGCTCGGTCGGG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GCGCGGGAGCCCGAGGCCGCGGAACCTGCAACCATGGTCGTGCCACTAGCCAGCTCGGAAGCCCAGACCGTGCA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GTCCCTCGGCTTCGCCATCTACCGCGCGCTGGACTGGGGGCTGGACGAGAGCGAGGAGCGCGAACTCAGCCCTC  370

Query    1  -----------------------ATGGCCAACAACGACAGCGAGGACAGCGGCTGCGGTGCCGCCGATGAGGGC  51
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGGAGCGGCTCATCGACCTCATGGCCAACAACGACAGCGAGGACAGCGGCTGCGGTGCCGCCGATGAGGGC  444

Query   52  TACGGGGGTCCCGAGGAGGAGGAGGAGGCCGAGGGCGTCCCCCGCAGCGTGCGCACCTTTGCCCAGGCCATGCG  125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACGGGGGTCCCGAGGAGGAGGAGGAGGCCGAGGGCGTCCCCCGCAGCGTGCGCACCTTTGCCCAGGCCATGCG  518

Query  126  GCTGTGCGCGGCGCGGCTGACCGACCCCCGGGGCGCACAGGCGCATTACCAGGCCGTGTGCCGCGCGCTCTTCG  199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGTGCGCGGCGCGGCTGACCGACCCCCGGGGCGCACAGGCGCATTACCAGGCCGTGTGCCGCGCGCTCTTCG  592

Query  200  TGGAGACGCTGGAGCTGCGGGCCTTCCTGGCCAGGGTCCGGGAGGCCAAGGAGATGCTGCAGAAGCTTCGGGAG  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGAGACGCTGGAGCTGCGGGCCTTCCTGGCCAGGGTCCGGGAGGCCAAGGAGATGCTGCAGAAGCTTCGGGAG  666

Query  274  GACGAGCCGCATCTGGAGACGCCTCGGGCAGAGCTGGACAGCCTGGGTCACACAGACTGGGCCCGACTGTGGGT  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACGAGCCGCATCTGGAGACGCCTCGGGCAGAGCTGGACAGCCTGGGTCACACAGACTGGGCCCGACTGTGGGT  740

Query  348  TCAGCTCATGCGGGAGCTCCGCCGCGGAGTGAAGCTGAAGAAGGTGCAAGAGCAGGAGTTCAACCCCCTCCCCA  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGCTCATGCGGGAGCTCCGCCGCGGAGTGAAGCTGAAGAAGGTGCAAGAGCAGGAGTTCAACCCCCTCCCCA  814

Query  422  CCGAGTTCCAGCTCACGCCCTTCGAGATGCTGATGCAGGACATCCGGGCCCGGAACTACAAGCTGCGCAA----  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  815  CCGAGTTCCAGCTCACGCCCTTCGAGATGCTGATGCAGGACATCCGGGCCCGGAACTACAAGCTGCGCAAGGTC  888

Query  492  --GGTGGATGGGGACATCCCGCCCCGGGTGAAGAAGGACGCTCACGAGCTCATCCTGGACTTTATCCGCTCACG  563
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGGTGGATGGGGACATCCCGCCCCGGGTGAAGAAGGACGCTCACGAGCTCATCCTGGACTTTATCCGCTCACG  962

Query  564  GCCTCCACTGAAGCAGGTCTCTGAGAGGCGGCTGCGCCCGTTGCCACCAAAGCAAAGGTCCCTGCATGAGAAGA  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCTCCACTGAAGCAGGTCTCTGAGAGGCGGCTGCGCCCGTTGCCACCAAAGCAAAGGTCCCTGCATGAGAAGA  1036

Query  638  TCCTGGAGGAGATCAAGCAGGAGCGGAGGCTGCGCCCGGTGCGGGGCGAGGGCTGGGCTGCCCGCGGGTTTGGC  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCTGGAGGAGATCAAGCAGGAGCGGAGGCTGCGCCCGGTGCGGGGCGAGGGCTGGGCTGCCCGCGGGTTTGGC  1110

Query  712  TCTCTGCCCTGCATCCTCAACGCCTGCTCCGGAGATGCCAAGTCCACCTCCTGCATCAACCTGTCAGTCACAGA  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTCTGCCCTGCATCCTCAACGCCTGCTCCGGAGATGCCAAGTCCACCTCCTGCATCAACCTGTCAGTCACAGA  1184

Query  786  TGCTGGGGGCAGCGCCCAGCGCCCGCGGCCCCGCGTGCTGCTCAAGGCGCCTACCTTGGCTGAAATGGAAGAGA  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTGGGGGCAGCGCCCAGCGCCCGCGGCCCCGCGTGCTGCTCAAGGCGCCTACCTTGGCTGAAATGGAAGAGA  1258

Query  860  TGAATACATCTGAGGAAGAAGAGTCTCCGTGTGGGGAGGTGACGCTGAAACGGGACCGCTCCTTCTCAGAGCAT  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAATACATCTGAGGAAGAAGAGTCTCCGTGTGGGGAGGTGACGCTGAAACGGGACCGCTCCTTCTCAGAGCAT  1332

Query  934  GACCTGGCCCAGCTCCGAAGTGAGGTGGCCTCTGGCCTGCAGTCGGCCACCCACCCCCCAGGAGGGACGGAGCC  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GACCTGGCCCAGCTCCGAAGTGAGGTGGCCTCTGGCCTGCAGTCGGCCACCCACCCCCCAGGAGGGACGGAGCC  1406

Query 1008  ACCACGGCCCCGAGCTGGCAGTGCGCATGTGTGGAGGCCCGGCTCCCGAGACCAGGGTACCTGTCCCGCGAGTG  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCACGGCCCCGAGCTGGCAGTGCGCATGTGTGGAGGCCCGGCTCCCGAGACCAGGGTACCTGTCCCGCGAGTG  1480

Query 1082  TCTCTGACCCCAGCCACCCCCTACTCAGCAACCGGGGCTCCTCGGGGGACAGACCCGAGGCCTCCATGACCCCC  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTCTGACCCCAGCCACCCCCTACTCAGCAACCGGGGCTCCTCGGGGGACAGACCCGAGGCCTCCATGACCCCC  1554

Query 1156  GATGCCAAACACCTGTGGCTGGAGTTCAGCCACCCCGTGGAGAGCCTGGCGCTGACTGTGGAAGAGGTGATGGA  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATGCCAAACACCTGTGGCTGGAGTTCAGCCACCCCGTGGAGAGCCTGGCGCTGACTGTGGAAGAGGTGATGGA  1628

Query 1230  CGTGCGCCGTGTGCTGGTGAAGGCCGAGATGGAAAAGTTTTTGCAGAACAAGGAGCTCTTCAGCAGTCTGAAGA  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGTGCGCCGTGTGCTGGTGAAGGCCGAGATGGAAAAGTTTTTGCAGAACAAGGAGCTCTTCAGCAGTCTGAAGA  1702

Query 1304  AGGGGAAGATTTGCTGCTGCTGCCGGGCCAAGTTCCCGCTGTTCTCGTGGCCGCCCAGCTGTCTCTTCTGCAAG  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGGGAAGATTTGCTGCTGCTGCCGGGCCAAGTTCCCGCTGTTCTCGTGGCCGCCCAGCTGTCTCTTCTGCAAG  1776

Query 1378  AGAGCCGTCTGCACTTCCTGTAGCATAAAGATGAAGATGCCTTCTAAGAAATTTGGACACATCCCTGTCTACAC  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGAGCCGTCTGCACTTCCTGTAGCATAAAGATGAAGATGCCTTCTAAGAAATTTGGACACATCCCTGTCTACAC  1850

Query 1452  ACTGGGCTTTGAGAGTCCTCAGAGGGTATCAGCTGCCAAAACCGCGCCAATCCAGAGAAGAGACATCTTTCAGT  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACTGGGCTTTGAGAGTCCTCAGAGGGTATCAGCTGCCAAAACCGCGCCAATCCAGAGAAGAGACATCTTTCAGT  1924

Query 1526  CTCTGCAAGGGCCACAGTGGCAGAGCGTGGAGGAGGCGTTCCCCCACATCTACTCCCACGGCTGTGTCCTGAAG  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTCTGCAAGGGCCACAGTGGCAGAGCGTGGAGGAGGCGTTCCCCCACATCTACTCCCACGGCTGTGTCCTGAAG  1998

Query 1600  GATGTCTGCAGTGAGTGCACCAGCTTTGTGGCAGACGTGGTGCGTTCCAGCCGCAAGAGCGTGGACGTCCTCAA  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATGTCTGCAGTGAGTGCACCAGCTTTGTGGCAGACGTGGTGCGTTCCAGCCGCAAGAGCGTGGACGTCCTCAA  2072

Query 1674  CACTACGCCACGACGCAGTCGCCAGACCCAATCCCTCTACATCCCTAACACCAGGACTTTTGACTTCAAG  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2073  CACTACGCCACGACGCAGTCGCCAGACCCAATCCCTCTACATCCCTAACACCAGGACTCTTGACTTCAAG  2142