Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_13006
Subject:
NM_018287.7
Aligned Length:
846
Identities:
841
Gaps:
5

Alignment

Query   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74
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Sbjct   1  MKMADRSGKIIPGQVYIEVEYDYEYEAKDRKIVIKQGERYILVKKTNDDWWQVKPDENSKAFYVPAQYVKEVTR  74

Query  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148
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Sbjct  75  KALMPPVKQVAGLPNNSTKIMQSLHLQRSTENVNKLPELSSFGKPSSSVQGTGLIRDANQNFGPSYNQGQTVNL  148

Query 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  SLDLTHNNGKFNNDSHSPKVSSQNRTRSFGHFPGPEFLDVEKTSFSQEQSCDSAGEGSERIHQDSESGDELSSS  222

Query 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296
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Sbjct 223  STEQIRATTPPNQGRPDSPVYANLQELKISQSALPPLPGSPAIQINGEWETHKDSSGRCYYYNRGTQERTWKPP  296

Query 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDD  370
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Sbjct 297  RWTRDASISKGDFQNPGDQELLSSEENYYSTSYSQSDSQCGSPPRGWSEELDERGHTLYTSDYTNEKWLKHVDD  370

Query 371  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  444
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Sbjct 371  QGRQYYYSADGSRSEWELPKYNASSQQQREIIKSRSLDRRLQEPIVLTKWRHSTIVLDTNDKESPTASKPCFPE  444

Query 445  NESSPSSPKHQDT-----DQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  513
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Sbjct 445  NESSPSSPKHQDTASSPKDQEKYGLLNVTKIAENGKKVRKNWLSSWAVLQGSSLLFTKTQGSSTSWFGSNQSKP  518

Query 514  EFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS  587
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Sbjct 519  EFTVDLKGATIEMASKDKSSKKNVFELKTRQGTELLIQSDNDTVINDWFKVLSSTINNQAVETDEGIEEEIPDS  592

Query 588  PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  661
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Sbjct 593  PGIEKHDKEKEQKDPKKLRSFKVSSIDSSEQKKTKKNLKKFLTRRPTLQAVREKGYIKDQVFGSNLANLCQREN  666

Query 662  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  735
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Sbjct 667  GTVPKFVKLCIEHVEEHGLDIDGIYRVSGNLAVIQKLRFAVNHDEKLDLNDSKWEDIHVITGALKMFFRELPEP  740

Query 736  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  809
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Sbjct 741  LFTFNHFNDFVNAIKQEPRQRVAAVKDLIRQLPKPNQDTMQILFRHLRRVIENGEKNRMTYQSIAIVFGPTLLK  814

Query 810  PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  841
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Sbjct 815  PEKETGNIAVHTVYQNQIVELILLELSSIFGR  846