Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13019
• Subject: NM_177974.3
• Aligned Length: 1303
• Identities: 1123
• Gaps: 167

Alignment

Query    1  ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCTGGCCGCCTGCCCTCTCTCGTGCTGGTGGTGCTGCTGGTGGTGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGGGTTTCGGGGCCAACCGGCGGGCTGGCCGCCTGCCCTCTCTCGTGCTGGTGGTGCTGCTGGTGGTGAT  74

Query   75  CGTCGTCCTCGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTCCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTCGTCCTCGCCTTCAACTACTGGAGCATCTCCTCCCGCCACGTCCTGCTTCAGGAGGAGGTGGCCGAGCTGC  148

Query  149  AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAAGTGGCCCGCGGGCGGCTGGAAAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTGTTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGCCAGGTCCAGCGCACCGAAGTGGCCCGCGGGCGGCTGGAAAAGCGCAATTCGGACCTCTTGCTGTTGGTG  222

Query  223  GACACGCACAAGAAACAGATCGACCAGAAGGAGGCCGACTACGGCCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACACGCACAAGAAACAGATCGACCAGAAGGAGGCCGACTACGGCCGCCTCAGCAGCCGGCTGCAGGCCAGAGA  296

Query  297  GGGCCTCGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAACTACAGAACAACATATCGTATCAGATGGCAGACATAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCCTCGGGAAGAGATGCGAGGATGACAAGGTTAAACTACAGAACAACATATCGTATCAGATGGCAGACATAC  370

Query  371  ATCATTTAAAGGAGCAACTTGCTGAGCTTCGTCAGGAATTTCTTCGACAAGAAGACCAGCTTCAGGACTATAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCATTTAAAGGAGCAACTTGCTGAGCTTCGTCAGGAATTTCTTCGACAAGAAGACCAGCTTCAGGACTATAGG  444

Query  445  AAGAACAATACTTACCTTGTGAAGAGGTTAGAATATGAAAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATGAAGGAATTGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAACAATACTTACCTTGTGAAGAGGTTAGAATATGAAAGTTTTCAGTGTGGACAGCAGATGAAGGAATTGAG  518

Query  519  AGCACAGCATGAAGAAAATATTAAAAAGTTAGCAGACCAGTTTTTAGAGGAACAAAAGCAAGAGACCCAAAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCACAGCATGAAGAAAATATTAAAAAGTTAGCAGACCAGTTTTTAGAGGAACAAAAGCAAGAGACCCAAAAGA  592

Query  593  TTCAATCAAATGATGGAAAGGAATTGGATATAAACAATCAAGTAGTACCTAAAAATATTCCAAAAGTAGCTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCAATCAAATGATGGAAAGGAATTGGATATAAACAATCAAGTAGTACCTAAAAATATTCCAAAAGTAGCTGAG  666

Query  667  AATGTTGCAGATAAGAATGAAGAACCCTCAAGCAATCATATTCCACATGGGAAAGAACAAATCAAAAGAGGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATGTTGCAGATAAGAATGAAGAACCCTCAAGCAATCATATTCCACATGGGAAAGAACAAATCAAAAGAGGTGG  740

Query  741  TGATGCAGGGATGCCTGGAATAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTTGATGATCTTCCCCCTGCTTTAAGGAAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGCAGGGATGCCTGGAATAGAAGAGAATGACCTAGCAAAAGTTGATGATCTTCCCCCTGCTTTAAGGAAGC  814

Query  815  CTCCTATTTCAGTTTCTCAACATGAAAGTCATCAAGCAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAACCTCTCTCCCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCTATTTCAGTTTCTCAACATGAAAGTCATCAAGCAATCTCCCATCTTCCAACTGGACAACCTCTCTCCCCA  888

Query  889  AATATGCCTCCAGATTCACACATAAACCACAATGGAAACCCCGGTACTTCAAAACAGAATCCTTCCAGTCCTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATATGCCTCCAGATTCACACATAAACCACAATGGAAACCCCGGTACTTCAAAACAGAATCCTTCCAGTCCTCT  962

Query  963  TCAGCGTTTAATTCCAGGCTCAAACTTGGACAGTGAACCCAGAATTCAAACAGATATACTAAAGCAGGCTACCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGCGTTTAATTCCAGGCTCAAACTTGGACAGTGAACCCAGAATTCAAACAGATATACTAAAGCAGGCTACCA  1036

Query 1037  AGGACAGAGTCAGTGATTTCCATAAATTGAAGCAAAGCCGATTCTTTGATGAA-AATGAATCCCCTGTTGATCC  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         .||||||| ||.||          ||   
Sbjct 1037  AGGACAGAGTCAGTGATTTCCATAAATTGAAGCAAA---------ATGATGAAGAACGA----------GA---  1088

Query 1110  GCAGCATGGCTCTAAACTGGCGGATTATAATGGGGATGATGGTAACGTAGGTGAGTATGAGGCAGACAAGCAGG  1183
                    ||| |.||.|||      ||..||..||..||||.||                ||| |||      
Sbjct 1089  --------GCT-TCAAATGG------ATCCTGCAGACTATGGAAA----------------GCA-ACA------  1124

Query 1184  CTGAGCTGGCTTACAATGAGGAAGAAGATG---GTGATGGTGGAGAGGAAGACGTCCAAGGTGAGCGTGGGCCT  1254
                      ||.||||         ||||   .|                                       
Sbjct 1125  ----------TTTCAAT---------GATGTCCTT---------------------------------------  1140

Query 1255  GGCCTCCATGCTATAACCATGAAACCCACCTCTAAGTTTTTTGGT  1299
                                                         
Sbjct 1141  ---------------------------------------------  1140