Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_13612
• Subject: NM_001353450.2
• Aligned Length: 1893
• Identities: 1884
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGTCCCACCAAGAAGGCAGCACAGACGGCTTACCAGACTTAGGGACTGAAAGCCTGTTCAGCAGCCCAGAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCACCAAGAAGGCAGCACAGACGGCTTACCAGACTTAGGGACTGAAAGCCTGTTCAGCAGCCCAGAGGA  74

Query   75  GCAGTCTGGAGCCGTGGCGGCGACAGAGGCCTCCTCAGACATTGACATAGCGACCTCAGAGCTGAGTGTGACAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGTCTGGAGCCGTGGCGGCGACAGAGGCCTCCTCAGACATTGACATAGCGACCTCAGAGCTGAGTGTGACAG  148

Query  149  TGACCGGAGATGGCAGTGATAGCAGGGATGGTGGATTCCCCAACGATGCCAGCACAGAAAATCGAAGCTCAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGACCGGAGATGGCAGTGATAGCAGGGATGGTGGATTCCCCAACGATGCCAGCACAGAAAATCGAAGCTCAGAC  222

Query  223  CAAGAAAGCGCAAGTGAAGACATCGAACTTGAGAGCTTGGAGGACTTTGAGCATTTCCTCATGAGTGGTGAAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGAAAGCGCAAGTGAAGACATCGAACTTGAGAGCTTGGAGGACTTTGAGCATTTCCTCATGAGTGGTGAAAG  296

Query  297  TTTATTCCATTACCCTTTAGTGGGAGAGGAGGAGACAGAAAGGGAGGAGGAAGACGAAGAGATACAAGAGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTATTCCATTACCCTTTAGTGGGAGAGGAGGAGACAGAAAGGGAGGAGGAAGACGAAGAGATACAAGAGGAGG  370

Query  371  GAGGGGAGGAGGAGGAA---------GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAACAG  435
            |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGGGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAACAG  444

Query  436  CCTCGGGCGGGTCCACAAGGCAGTGGCGGCAACCATGAGCAGTATTCGTTAGAGGAGGATCAGGCGCTGGAGGA  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCGGGCGGGTCCACAAGGCAGTGGCGGCAACCATGAGCAGTATTCGTTAGAGGAGGATCAGGCGCTGGAGGA  518

Query  510  GTGGGTTTCCTCAGAGACATCTGCCCTGCCCCGACCTCGCTGGCAGGTCGTTACTGCTCTTCACCAGCGGCAGC  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTGGGTTTCCTCAGAGACATCTGCCCTGCCCCGACCTCGCTGGCAGGTCGTTACTGCTCTTCACCAGCGGCAGC  592

Query  584  TGGGTTCACGTCCCCGCTTTGTATATGAGGCCTGTGGGGCAAGAGCCTTTGTGCAGCGTTTCCGCCTGCAATAT  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGTTCACGTCCCCGCTTTGTATATGAGGCCTGTGGGGCAAGAGCCTTTGTGCAGCGTTTCCGCCTGCAATAT  666

Query  658  CGTCTTGCAGACCATGTCGGCTGTGTCAATACTGTACACTTTAACCAGCGTGGCACCCGGCTGGCCAGTAGCGG  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTCTTGCAGACCATGTCGGCTGTGTCAATACTGTACACTTTAACCAGCGTGGCACCCGGCTGGCCAGTAGCGG  740

Query  732  TGATGACCTAAAGGTGATAGTGTGGGACTGGGTGCGGCAGAGGCCAGTACTGAACTTTGAAAGTGGTCACACAA  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATGACCTAAAGGTGATAGTGTGGGACTGGGTGCGGCAGAGGCCAGTACTGAACTTTGAAAGTGGTCACACAA  814

Query  806  ATAATGTCTTCCAGGCCAAGTTCCTTCCTAACTGTGGTGATTCCACTCTGGCCATGTGTGCCCGTGATGGGCAG  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAATGTCTTCCAGGCCAAGTTCCTTCCTAACTGTGGTGATTCCACTCTGGCCATGTGTGCCCGTGATGGGCAG  888

Query  880  GTACGGGTAGCAGAGTTAATTAATGCATCATATTTCAACAATACTAAGTGTGTGGCCCAGCACAGGGGACCTGC  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTACGGGTAGCAGAGTTAATTAATGCATCATATTTCAACAATACTAAGTGTGTGGCCCAGCACAGGGGACCTGC  962

Query  954  CCACAAGTTGGCTCTGGAGCCTGACTCTCCTTATAAGTTCCTCACTTCAGGTGAAGATGCTGTTGTCTTCACCA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACAAGTTGGCTCTGGAGCCTGACTCTCCTTATAAGTTCCTCACTTCAGGTGAAGATGCTGTTGTCTTCACCA  1036

Query 1028  TTGACCTCAGACAAGACCGGCCAGCTTCAAAAGTTGTGGTAACAAGAGAAAATGATAAGAAAGTGGGACTGTAT  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGACCTCAGACAAGACCGGCCAGCTTCAAAAGTTGTGGTAACAAGAGAAAATGATAAGAAAGTGGGACTGTAT  1110

Query 1102  ACAATTACTGTGAATCCCGCCAATACCTACCAATTTGCAGTGGGTGGACAAGATCAGTTTGTAAGGATTTATGA  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACAATTACTGTGAATCCCGCCAATACCTACCAATTTGCAGTGGGTGGACAAGATCAGTTTGTAAGGATTTATGA  1184

Query 1176  CCAGAGGAAAATTGATAAGAAAGAAAACAATGGCGTGCTCAAGAAATTCACTCCTCATCATCTGGTTAATTGTG  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGAGGAAAATTGATAAGAAAGAAAACAATGGCGTGCTCAAGAAATTCACTCCTCATCATCTGGTTAATTGTG  1258

Query 1250  ATTTCCCAACAAACATCACCTGCGTTGTGTACAGCCACGATGGCACAGAGCTGCTAGCCAGCTACAATGATGAC  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTTCCCAACAAACATCACCTGCGTTGTGTACAGCCACGATGGCACAGAGCTGCTAGCCAGCTACAATGATGAC  1332

Query 1324  GATATTTACCTCTTCAACTCCTCTCACAGTGATGGTGCTCAATACAGTAAGAGATTTAAGGGACACAGAAATAA  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATATTTACCTCTTCAACTCCTCTCACAGTGATGGTGCTCAATACAGTAAGAGATTTAAGGGACACAGAAATAA  1406

Query 1398  TACCACAGTCAAAGGTGTTAATTTCTATGGCCCCAGGAGTGAGTTTGTAGTGAGCGGTAGTGATTGCGGGCACA  1471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TACCACAGTCAAAGGTGTTAATTTCTATGGCCCCAGGAGTGAGTTTGTAGTGAGCGGTAGTGATTGCGGGCACA  1480

Query 1472  TCTTCTTCTGGGAGAAATCATCCTGCCAAATCATCCAGTTCCTAAAGGGGAGCAGAGAAGGTACAATAAACTGT  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTTCTTCTGGGAGAAATCATCCTGCCAAATCATCCAGTTCCTAAAGGGGAGCAGAGAAGGTACAATAAACTGT  1554

Query 1546  CTTGAACCCCACCCTTACCTACCTGTGTTGGCGTGCAGTGGCCTAGATCATGATGTCAAGATCTGGACACCCAC  1619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTGAACCCCACCCTTACCTACCTGTGTTGGCGTGCAGTGGCCTAGATCATGATGTCAAGATCTGGACACCCAC  1628

Query 1620  AGCTAAAGCTGCCACTGAGCTTACTGGGTTAAAGAAGGTGATTAAGAAGAACAAGTGGGAACGAGATGAAGACA  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGCTAAAGCTGCCACTGAGCTTACTGGGTTAAAGAAGGTGATTAAGAAGAACAAGTGGGAACGAGATGAAGACA  1702

Query 1694  GCTTGCACCATGGCAGCCTGTTTGACCAGTACATGCTTTGGTTCCTCCTGCGTCACGTGACGCAGAGAGGTCGT  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCTTGCACCATGGCAGCCTGTTTGACCAGTACATGCTTTGGTTCCTCCTGCGTCACGTGACGCAGAGAGGTCGT  1776

Query 1768  CACCAGGACTGGAGAAGTGGTGAAGCTGAATTTCCAGATGAAGAATCGGATGAGTCTTCCAGCACTTCAGAGAC  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CACCAGGACTGGAGAAGTGGTGAAGCTGAATTTCCAGATGAAGAATCGGATGAGTCTTCCAGCACTTCAGAGAC  1850

Query 1842  ATCTGAGGAGGAGGTCCAAGACCGAGTGCAGTGCATGCCATCC  1884
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCTGAGGAGGAGGTCCAAGACCGAGTGCAGTGCATGCCATCC  1893