Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_13970
- Subject:
- NM_001363879.1
- Aligned Length:
- 3289
- Identities:
- 3278
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGAGTTGGTTCAACGCCTCCCAGCTCTCCAGCTTCGCTAAGCAGGCCCTGTCCCAGGCCCAGAAGTCTATTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGTTGGTTCAACGCCTCCCAGCTCTCCAGCTTCGCTAAGCAGGCCCTGTCCCAGGCCCAGAAGTCTATTGA 74
Query 75 CAGGGTTCTGGACATCCAGGAAGAGGAGCCGAGCATCTGGGCCGAGACCATTCCGTATGGAGAGCCGGGAATAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGGTTCTGGACATCCAGGAAGAGGAGCCGAGCATCTGGGCCGAGACCATTCCGTATGGAGAGCCGGGAATAA 148
Query 149 GTTCCCCTGTCAGTGGAGGATGGGATACTTCAACCTGGGGGTTGAAATCAAACACTGAACCTCAGAGTCCACCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTTCCCCTGTCAGTGGAGGATGGGATACTTCAACCTGGGGGTTGAAATCAAACACTGAACCTCAGAGTCCACCA 222
Query 223 ATAGCCTCTCCTAAAGCAATCACAAAGCCAGTTCGGAGGACTGTGGTCGATGAATCTGAAAATTTCTTCAGTGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATAGCCTCTCCTAAAGCAATCACAAAGCCAGTTCGGAGGACTGTGGTCGATGAATCTGAAAATTTCTTCAGTGC 296
Query 297 CTTTCTCTCGCCAACTGATGTCCAGACCATTCAGAAGAGTCCAGTGGTATCAAAACCTCCAGCAAAATCACAAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTTCTCTCGCCAACTGATGTCCAGACCATTCAGAAGAGTCCAGTGGTATCAAAACCTCCAGCAAAATCACAAC 370
Query 371 GACCAGAAGAAGAAGTGAAAAGCAGCTTACATGAATCCTTGCACATTGGCCAGTCAAGAACTCCTGAAACAACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GACCAGAAGAAGAAGTGAAAAGCAGCTTACATGAATCCTTGCACATTGGCCAGTCAAGAACTCCTGAAACAACT 444
Query 445 GAATCACAAGTAAAAGACTCTTCTTTGTGTGTTTCAGGGGAAACTCTGGCAGCAGGTACTTCATCACCTAAAAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAATCACAAGTAAAAGACTCTTCTTTGTGTGTTTCAGGGGAAACTCTGGCAGCAGGTACTTCATCACCTAAAAC 518
Query 519 TGAAGGCAAGCACGAAGAAACTGTTAATAAAGAATCGGATATGAAGGTGCCAACTGTAAGTTTGAAAGTATCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGGCAAGCACGAAGAAACTGTTAATAAAGAATCGGATATGAAGGTGCCAACTGTAAGTTTGAAAGTATCTG 592
Query 593 AAAGTGTAATTGATGTGAAAACAACTATGGAAAGTATATCTAATACGTCTACGCAGTCTCTCACAGCAGAAACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGTGTAATTGATGTGAAAACAACTATGGAAAGTATATCTAATACGTCTACGCAGTCTCTCACAGCAGAAACA 666
Query 667 AAGGACATAGCTTTGGAACCTAAGGAACAAAAACATGAAGACAGGCAGAGCAATACACCTTCTCCTCCTGTTAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGGACATAGCTTTGGAACCTAAGGAACAAAAACATGAAGACAGGCAGAGCAATACACCTTCTCCTCCTGTTAG 740
Query 741 TACCTTTTCATCAGGTACTTCTACCACCAGTGATATTGAAGTTTTAGATCATGAAAGTGTAATAAGTGAGAGCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TACCTTTTCATCAGGTACTTCTACCACCAGTGATATTGAAGTTTTAGATCATGAAAGTGTAATAAGTGAGAGCT 814
Query 815 CAGCGAGCTCGAGACAAGAGACTACAGATTCAAAATCAAGTCTTCACTTGATGCAGACATCTTTTCAGCTTCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGCGAGCTCGAGACAAGAGACTACAGATTCAAAATCAAGTCTTCACTTGATGCAGACATCTTTTCAGCTTCTC 888
Query 889 TCTGCATCTGCTTGTCCTGAATATAATCGTTTAGATGATTTCCAAAAACTCACTGAGAGTTGCTGTTCATCTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCTGCATCTGCTTGTCCTGAATATAATCGTTTAGATGATTTCCAAAAACTCACTGAGAGTTGCTGTTCATCTGA 962
Query 963 TGCTTTTGAAAGAATAGACTCATTTAGTGTACAGTCATTAGATAGCCGGAGTGTAAGTGAAATCAATTCAGATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGCTTTTGAAAGAATAGACTCATTTAGTGTACAGTCATTAGATAGCCGGAGTGTAAGTGAAATCAATTCAGATG 1036
Query 1037 ATGAATTGTCAGGCAAGGGATATGCTTTAGTGCCTATTATAGTTAATTCTTCAACTCCAAAGTCTAAAACAGTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGAATTGTCAGGCAAGGGATATGCTTTAGTGCCTATTATAGTTAATTCTTCAACTCCAAAGTCTAAAACAGTT 1110
Query 1111 GAATCTGCTGAAGGAAAATCTGAAGAAGTAAATGAAACATTAGTTATACCCACTGAGGAAGCAGAAATGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAATCTGCTGAAGGAAAATCTGAAGAAGTAAATGAAACATTAGTTATACCCACTGAGGAAGCAGAAATGGAAGA 1184
Query 1185 AAGTGGACGAAGTGCAACTCCTGTTAACTGTGAACAGCCTGATATCTTGGTTTCTTCTACACCAATAAATGAAG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGTGGACGAAGTGCAACTCCTGTTAACTGTGAACAGCCTGATATCTTGGTTTCTTCCACACCAATAAATGAAG 1258
Query 1259 GACAGACTGTGTTAGACAAGGTGGCTGAGCAGTGTGAACCTGCTGAAAGTCAGCCAGAAGCACTTTCTGAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GACAGACTGTGTTAGACAAGGTGGCTGAGCAGTGTGAACCTGCTGAAAGTCAGCCAGAAGCACTTTCTGAGAAG 1332
Query 1333 GAAGATGTTTGCAAG---------ACAGTTGAATTTCTGAATGAAAAGCTGGAAAAAAGGGAGGCTCAGTTATT 1397
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGATGTTTGCAAGGTAACTCTAACAGTTGAATTTCTGAATGAAAAGCTGGAAAAAAGGGAGGCTCAGTTATT 1406
Query 1398 ATCTCTTAGTAAGGAAAAAGCACTTCTAGAAGAAGCTTTTGATAACCTGAAAGATGAAATGTTCAGAGTGAAAG 1471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATCTCTTAGTAAGGAAAAAGCACTTCTAGAAGAAGCTTTTGATAACCTGAAAGATGAAATGTTCAGAGTGAAAG 1480
Query 1472 AAGAAAGCAGTAGCATTTCTTCCTTGAAAGATGAGTTTACTCAAAGAATTGCAGAAGCAGAAAAGAAAGTTCAA 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGAAAGCAGTAGCATTTCTTCCTTGAAAGATGAGTTTACTCAAAGAATTGCAGAAGCAGAAAAGAAAGTTCAA 1554
Query 1546 CTAGCCTGCAAAGAGAGAGATGCTGCTAAAAAGGAAATCAAAAACATAAAAGAAGAACTTGCCACTAGATTAAA 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTAGCCTGCAAAGAGAGAGATGCTGCTAAAAAGGAAATCAAAAACATAAAAGAAGAACTTGCCACTAGATTAAA 1628
Query 1620 TAGTAGTGAAACTGCAGACCTTTTGAAAGAGAAAGATGAGCAGATCCGAGGGTTAATGGAAGAAGGAGAAAAAC 1693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TAGTAGTGAAACTGCAGACCTTTTGAAAGAGAAAGATGAGCAGATCCGAGGGTTAATGGAAGAAGGAGAAAAAC 1702
Query 1694 TTTCAAAACAGCAGCTGCACAATTCTAACATCATCAAGAAATTAAGAGCTAAAGACAAGGAGAATGAAAATATG 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTTCAAAACAGCAGCTGCACAATTCTAACATCATCAAGAAATTAAGAGCTAAAGACAAGGAGAATGAAAATATG 1776
Query 1768 GTTGCAAAGCATGAACAAAAAAGTTAAAGAGCTAGAAGAGGAGTTGCAGCATTTGAAACAGGTCCTTGATGGCA 1841
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTTGCAAAGC-TGAACAAAAAAGTTAAAGAGCTAGAAGAGGAGTTGCAGCATTTGAAACAGGTCCTTGATGGCA 1849
Query 1842 AAGAAGAGGTTGAGAAACAACATAGAGAAAATATTAAAAAACTAAATTCCATGGTAGAACGCCAAGAGAAAGAT 1915
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 AAGAAGAGGTTGAGAAACAACATAGAGAAAATATTAAAAAACTAAATTCCATGGTAGAACGCCAAGAGAAAGAT 1923
Query 1916 CTTGGCCGTCTTCAGGTAGACATGGATGAACTTGAAGAAAAGAACCGAAGTATTCAGGCTGCCCTGGATAGTGC 1989
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 CTTGGCCGTCTTCAGGTAGACATGGATGAACTTGAAGAAAAGAACCGAAGTATTCAGGCTGCCCTGGATAGTGC 1997
Query 1990 ATACAAAGAACTTACTGATCTTCACAAAGCCAATGCTGCAAAGGATAGTGAGGCACAGGAAGCTGCTCTGAGCC 2063
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 ATACAAAGAACTTACTGATCTTCACAAAGCCAATGCTGCAAAGGATAGTGAGGCACAGGAAGCTGCTCTGAGCC 2071
Query 2064 GTGAAATGAAAGCTAAAGAAGAACTTTCTGCAGCATTAGAGAAGGCCCAAGAAGAAGCCCGTCAGCAGCAAGAA 2137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 GTGAAATGAAAGCTAAAGAAGAACTTTCTGCAGCATTAGAGAAGGCCCAAGAAGAAGCCCGTCAGCAGCAAGAA 2145
Query 2138 ACATTAGCCATTCAAGTGGGGGACCTTAGGCTTGCATTGCAGCGTACAGAACAAGCGGCTGCCAGAAAGGAGGA 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 ACATTAGCCATTCAAGTGGGGGACCTTAGGCTTGCATTGCAGCGTACAGAACAAGCGGCTGCCAGAAAGGAGGA 2219
Query 2212 TTATTTACGCCATGAGATCGGTGAACTTCAGCAGAGACTCCAGGAAGCAGAGAATCGAAACCAGGAACTGAGTC 2285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TTATTTACGCCATGAGATCGGTGAACTTCAGCAGAGACTCCAGGAAGCAGAGAATCGAAACCAGGAACTGAGTC 2293
Query 2286 AAAGTGTTTCATCAACAACAAGACCATTGCTTCGACAAATAGAAAATTTGCAAGCAACCCTGGGATCCCAGACA 2359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 AAAGTGTTTCATCAACAACAAGACCATTGCTTCGACAAATAGAAAATTTGCAAGCAACCCTGGGATCCCAGACA 2367
Query 2360 TCGTCGTGGGAGAAATTAGAGAAGAATCTTTCTGATAGGCTTGGTGAATCCCAGACCTTGCTGGCAGCAGCAGT 2433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 TCGTCGTGGGAGAAATTAGAGAAGAATCTTTCTGATAGGCTTGGTGAATCCCAGACCTTGCTGGCAGCAGCAGT 2441
Query 2434 TGAGAGAGAACGTGCAGCTACAGAAGAACTCCTTGCTAACAAAATTCAGATGTCTTCCATGGAGTCACAGAATT 2507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 TGAGAGAGAACGTGCAGCTACAGAAGAACTCCTTGCTAACAAAATTCAGATGTCTTCCATGGAGTCACAGAATT 2515
Query 2508 CTCTTTTAAGACAGGAAAACAGTAGATTTCAAGCCCAGCTAGAATCAGAGAAAAATAGGCTGTGTAAACTGGAG 2581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 CTCTTTTAAGACAGGAAAACAGTAGATTTCAAGCCCAGCTAGAATCAGAGAAAAATAGGCTGTGTAAACTGGAG 2589
Query 2582 GATGAGAACAATAGGTACCAGGTTGAATTGGAAAACCTAAAAGATGAATATGTAAGAACACTTGAAGAGACGAG 2655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 GATGAGAACAATAGGTACCAGGTTGAATTGGAAAACCTAAAAGATGAATATGTAAGAACACTTGAAGAGACGAG 2663
Query 2656 GAAAGAAAAGACATTGTTGAATAGTCAGTTAGAAATGGAAAGAATGAAAGTTGAACAAGAAAGGAAGAAAGCCA 2729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664 GAAAGAAAAGACATTGTTGAATAGTCAGTTAGAAATGGAAAGAATGAAAGTTGAACAAGAAAGGAAGAAAGCCA 2737
Query 2730 TTTTTACTCAAGAAACAATAAAAGAAAAGGAACGCAAGCCATTTTCTGTTTCTAGCACTCCCACCATGTCACGC 2803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 TTTTTACTCAAGAAACAATAAAAGAAAAGGAACGCAAGCCATTTTCTGTTTCTAGCACTCCCACCATGTCACGC 2811
Query 2804 TCAAGTTCAATAAGTGGTGTTGATATGGCAGGACTACAGACATCTTTTCTGTCTCAGGATGAGTCTCATGATCA 2877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 TCAAGTTCAATAAGTGGTGTTGATATGGCAGGACTACAGACATCTTTTCTGTCTCAGGATGAGTCTCATGATCA 2885
Query 2878 CTCATTTGGACCAATGCCTATATCAGCAAATGGAAGCAATCTTTATGATGCTGTAAGGATGGGAGCAGGATCAA 2951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 CTCATTTGGACCAATGCCTATATCAGCAAATGGAAGCAATCTTTATGATGCTGTAAGGATGGGAGCAGGATCAA 2959
Query 2952 GCATAATTGAAAACCTACAGTCTCAGCTAAAGCTAAGGGAAGGGGAAATCACTCATTTACAGCTAGAAATTGGC 3025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 GCATAATTGAAAACCTACAGTCTCAGCTAAAGCTAAGGGAAGGGGAAATCACTCATTTACAGCTAGAAATTGGC 3033
Query 3026 AATCTAGAAAAAACTCGATCAATAATGGCTGAAGAACTAGTTAAATTAACAAATCAAAATGATGAACTTGAAGA 3099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 AATCTAGAAAAAACTCGATCAATAATGGCTGAAGAACTAGTTAAATTAACAAATCAAAATGATGAACTTGAAGA 3107
Query 3100 GAAGGTGAAGGAGATACCCAAACTTAGAACTCAGCTAAGAGATTTGGATCAAAGGTACAACACTATTCTGCAGA 3173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 GAAGGTGAAGGAGATACCCAAACTTAGAACTCAGCTAAGAGATTTGGATCAAAGGTACAACACTATTCTGCAGA 3181
Query 3174 TGTATGGAGAAAAAGCAGAAGAGGCAGAAGAACTTCGATTAGATCTCGAAGATGTAAAAAATATGTACAAAACT 3247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 TGTATGGAGAAAAAGCAGAAGAGGCAGAAGAACTTCGATTAGATCTCGAAGATGTAAAAAATATGTACAAAACT 3255
Query 3248 CAAATAGATGAACTTTTAAGACAAAGTCTCAGT 3280
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3256 CAAATAGATGAACTTTTAAGACAAAGTCTCAGT 3288