Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14010
• Subject: NM_013831.4
• Aligned Length: 1036
• Identities: 779
• Gaps: 134

Alignment

Query    1  ATGCCGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74
            |||.||.||||.|||||||||||.|||||.|||||..|.|||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||
Sbjct    1  ATGACGGGCTCGCTGTTCAAGGGGAACTTCTGGAGCACGGACATTCTCAGCACCATTGGCTACGACAGCATTAT  74

Query   75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148
            |||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct   75  CCAGCACCTGAACAATGGCCGTAAGAACTGCAAGGAGTTTGAAGACTTTTTGAAAGAAAGAGCATCAATTGAAG  148

Query  149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCTCAACCTCTCTAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAAATCAACACCCTGAAG  222
            |||..|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||
Sbjct  149  AGAAATATGGCAAAGACCTGCTGAACCTCTCCAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAGATCAATACCTTGAAG  222

Query  223  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  296
            .|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||.|.||||
Sbjct  223  AGAGCCCTTGAGGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAACGTGGCTCAATGTCACATTCAGCTTGCGCAGACTCTAAG  296

Query  297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||....|||||||
Sbjct  297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCCGGGAAAAGCAGAAGCTGCAGCGGAAAAAGACAGAAACAATAATGG  370

Query  371  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  444
            |||||..|||.||.||||.||.|..|||.|||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  371  ATGCTGCCCACAAGCAAAGGAACGCACAGTTCAAGAAAGCCATGGATGCCAAGAAGAATTATGAGCAAAAGTGC  444

Query  445  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAA--GCAACAAGAAAAG  516
            ||||||||.|||||||||||.||.||.|||..|||.||.|||||..|||..||||  ||  |||||||||||||
Sbjct  445  CGGGACAAGGATGAGGCAGAGCAAGCTGTCCACCGCAGCGCCAATGTGGCCAACC--AACGGCAACAAGAAAAG  516

Query  517  CTTTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCAC  590
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||..||.
Sbjct  517  CTTTTTGTGAAACTGGCCACTTCAAAGACTGCAGTAGAGGATTCAGACAAAGCGTACATGTTGCACATCAACAT  590

Query  591  CCTGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGGCTCAAGAATGTG  664
            .|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||..||.||||||||.|||||||
Sbjct  591  GCTGGAGAAGGTTCGAGAAGACTGGCAGAGTGAACACATTAAGGCCTGCGAGGTGTTCGAGGCTCAGGAATGTG  664

Query  665  AACGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGTGTCACCAGTGA-  737
            |||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|.|.||| 
Sbjct  665  AACGAATCAACTTCTTCCGGAATGCACTGTGGTTGCATCTGAATCAGCTGTCACAACAATGTGTCGCAAATGAC  738

Query  738  -------------------------------------------------------------------TGAA---  741
                                                                               ||||   
Sbjct  739  GAGATGTATGAGCAAGTCCGTAAGAGTTTAGAAACATGCAGCATTGAGAAGGACATCCAGTATTTTGTGAACCA  812

Query  742  --------------------------CACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCC-CAGAAGAATGCAGTC  788
                                      |||||||||||||||||||.||||||| |||| |||..||||||.|.|
Sbjct  813  GCGGAAAACTGGACAGACTCCCCCAGCACCCATCATGTATGAGAACTTCTACT-CTCCTCAGCGGAATGCTGCC  885

Query  789  CCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCACCAGATGA  862
            |||.||||||||.||||||||||.||....||||||||||||||.|||||..|.|||||..|...|||||||||
Sbjct  886  CCACCAGGAAAGACTACAGGGCCCAATCCAGCAAGGAGAGGACCTCTCCCTGTCCCTAAGCGGATACCAGATGA  959

Query  863  TCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAGTAAAATCAATGAAACCAGAGCTTTTTCCGGC  936
            |||..||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||                               
Sbjct  960  TCCTGATTACTCTGTGGTTGAAGATTACAGTTTGCTCTATCAG-------------------------------  1002