Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14010
• Subject: XM_011526253.2
• Aligned Length: 1033
• Identities: 826
• Gaps: 206

Alignment

Query    1  ATGCCGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74

Query   75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct   75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAG--------------  134

Query  149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCTCAACCTCTCTAGGAAGAAGCCGTGTGGACAGTCTGAAATCAACACCCTGAAG  222
                                                                            ||||||||||
Sbjct  135  ----------------------------------------------------------------CACCCTGAAG  144

Query  223  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  CGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTTGCACAGAGTTTAAG  218

Query  297  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  AGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGACAGAGCTCATAATGG  292

Query  371  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  ATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACTATGAGCAGAAATGC  366

Query  445  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAGCAACAAGAAAAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  CGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAGCAACAAGAAAAGCT  440

Query  519  TTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCACCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  TTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCTGCACATCGGCACCC  514

Query  593  TGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGGCTCAAGAATGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  TGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGGCTCAAGAATGTGAA  588

Query  667  CGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGTGTCACCAGTGATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  CGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGTGTCACCAGTGATGA  662

Query  741  A-------------------------------------------------------------------------  741
            |                                                                         
Sbjct  663  AATGTACGAACAAGTCCGAAAGAGTTTAGAAATGTGCAGCATTCAGAGGGACATTGAATACTTTGTGAATCAAC  736

Query  742  ------------------------CACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGAAGAATGCAGTCCCA  791
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  GCAAAACTGGACAGATTCCACCAGCACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGAAGAATGCAGTCCCA  810

Query  792  GCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCACCAGATGATCC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  GCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGCTCACCAGATGATCC  884

Query  866  CAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAGTAAAATCAATGAAACCAGAGCTTTTTCCGGC  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  885  CAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAG-------------------------------  924