Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14010
• Subject: XM_011526256.1
• Aligned Length: 1047
• Identities: 725
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  ATGCCGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAGGTATGGCAAAGATCTGCT-CAACCTCTCTAGGA---AG--AAGCCGTGTGGACAGTCT-GAAATCAA---  212
                             .|||| |||.|.|   ||||   ||  ||.||.|.|  .|||.|| |.||||.|   
Sbjct    1  -----------------ATGCTCCAAGCAC---AGGATCCAGCTAAACCATAT--TCAGACTGGCAATCCACAG  52

Query  213  ----CACCCTGAAGCGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTT  282
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  AACTCACCCTGAAGCGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTT  126

Query  283  GCACAGAGTTTAAGAGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGAC  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  GCACAGAGTTTAAGAGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGAC  200

Query  357  AGAGCTCATAATGGATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACT  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  AGAGCTCATAATGGATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACT  274

Query  431  ATGAGCAGAAATGCCGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAG  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  ATGAGCAGAAATGCCGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAG  348

Query  505  CAACAAGAAAAGCTTTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  CAACAAGAAAAGCTTTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCT  422

Query  579  GCACATCGGCACCCTGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGG  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  GCACATCGGCACCCTGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGG  496

Query  653  CTCAAGAATGTGAACGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGT  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  CTCAAGAATGTGAACGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGT  570

Query  727  GTCACCAGTGATGAA-----------------------------------------------------------  741
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  571  GTCACCAGTGATGAAATGTACGAACAAGTCCGAAAGAGTTTAGAAATGTGCAGCATTCAGAGGGACATTGAATA  644

Query  742  --------------------------------------CACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGA  777
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  CTTTGTGAATCAACGCAAAACTGGACAGATTCCACCAGCACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGA  718

Query  778  AGAATGCAGTCCCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGC  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  AGAATGCAGTCCCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGC  792

Query  852  TCACCAGATGATCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAGTAAAATCAATGAAACCAGAG  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  793  TCACCAGATGATCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAG--------------------  846

Query  926  CTTTTTCCGGC  936
                       
Sbjct  847  -----------  846