Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14455
- Subject:
- NM_174937.4
- Aligned Length:
- 1758
- Identities:
- 1631
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGGCGGGCGCCAGGTTCCAGCGGCGGCGGCGGCAGCTGCAGCAGCAGCAGCCCCGGCGGCGGCAGCCTCT 74
Query 1 -------------------------------------------------ATGGTGCCGGGCTCGGCCGGGCTGC 25
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCTGGCCGATGGACGCAGAGCCGCCGCCGCCGCCGCCCTGGGTCTGGATGGTGCCGGGCTCGGCCGGGCTGC 148
Query 26 TCCGGCTCAGCGCGGGGGTCGTGGTTCCCCCGGTGCTGCTCGCCTCGGCCCCGCCGCCCGCGGCCCCGCTGCTC 99
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCGGCTCAGCGCGGGGGTCGTGGTTCCCCCGGTGCTGCTCGCCTCGGCCCCGCCGCCCGCGGCCCCGCTGCTC 222
Query 100 CCCGGTCTCCCCGGCTGGCCGGCCCCGAGCGAGCCGGTGCTCCCGCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCGCCAGACTC 173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCGGTCTCCCCGGCTGGCCGGCCCCGAGCGAGCCGGTGCTCCCGCTGCTGCCGCTGCCCTCTGCGCCAGACTC 296
Query 174 CGCCGCCGCCGCCGCCGCGCACCCCTTCCCCGCGCTCCACGGGCAGTGGCTGTTTGGTGGCCATTCTCCGTCCC 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGCCGCCGCCGCCGCCGCGCACCCCTTCCCCGCGCTCCACGGGCAGTGGCTGTTTGGTGGCCATTCTCCGTCCC 370
Query 248 TAGGACTGCCCCCCTCTTCCACAGTGGAGCTGGTGCCCGTCTTCCCACATCTCTGCCCTTCTGCTCTTGCAACC 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGGACTGCCCCCCTCTTCCACAGTGGAGCTGGTGCCCGTCTTCCCACATCTCTGCCCTTCTGCTCTTGCAACC 444
Query 322 CCTATTGGGAAAAGTTGGATAGACAAAAGGATTCCTAACTGTAAGATCTTTTTTAATAATTCCTTTGCTCTGGA 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTATTGGGAAAAGTTGGATAGACAAAAGGATTCCTAACTGTAAGATCTTTTTTAATAATTCCTTTGCTCTGGA 518
Query 396 CTCAACGTGGATACATCCTGAGGAGTCAAGGTTTTTCCATGGGCATGAAAAGCCTCGTTTGCTGGCAAATCAAG 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTCAACGTGGATACATCCTGAGGAGTCAAGGTTTTTCCATGGGCATGAAAAGCCTCGTTTGCTGGCAAATCAAG 592
Query 470 TAGCTGTGTCTCTGTCCAGGCCGGCTCCTGCCTCCAGGCCGCTCCCCACGGTGGTGTTAGCACCTCAGCCCATC 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGCTGTGTCTCTGTCCAGGCCGGCTCCTGCCTCCAGGCCGCTCCCCACGGTGGTGTTAGCACCTCAGCCCATC 666
Query 544 CCAGGTGGCTGCCATAACAGCCTTAAGGTGACCAGCAGCCCCGCCATTGCCATCGCCACCGCCGCCGCCGCTGC 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCAGGTGGCTGCCATAACAGCCTTAAGGTGACCAGCAGCCCCGCCATTGCCATCGCCACCGCCGCCGCCGCTGC 740
Query 618 CATGGTCTCCGTGGACCCTGAGAACCTCCGGGGCCCGTCCCCCTCCAGCGTGCAGCCGCGCCACTTCCTGACCT 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATGGTCTCCGTGGACCCTGAGAACCTCCGGGGCCCGTCCCCCTCCAGCGTGCAGCCGCGCCACTTCCTGACCT 814
Query 692 TGGCACCCATCAAAATACCCCTCCGGACGTCCCCCGTCTCAGATACAAGGACAGAGCGGGGCCGAGTGGCCCGC 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGCACCCATCAAAATACCCCTCCGGACGTCCCCCGTCTCAGATACAAGGACAGAGCGGGGCCGAGTGGCCCGC 888
Query 766 CCTCCTGCCCTGATGCTGCGGGCCCAGAAGAGCCGGGATGGAGACAAAGAAGACAAGGAGCCTCCACCGATGCT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTCCTGCCCTGATGCTGCGGGCCCAGAAGAGCCGGGATGGAGACAAAGAAGACAAGGAGCCTCCACCGATGCT 962
Query 840 GGGGGGAGGAGAGGACAGCACAGCCAGAGGCAACAGGCCAGTGGCCTCCACCCAGGTGCCCGGATCCCCCTGGT 913
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGGGGAGGAGAGGACAGCACAGCCAGAGGCAACAGGCCAGTGGCCTCCACCCCGGTGCCCGGATCCCCCTGGT 1036
Query 914 GTGTGGTCTGGACGGGCNATGACCGAGTTTTCTTCTTCAACCCAACGATGCACCTGTCTGTCTGGGAGAAGCCC 987
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGTGGTCTGGACGGGCGATGACCGAGTTTTCTTCTTCAACCCAACGATGCACCTGTCTGTCTGGGAGAAGCCC 1110
Query 988 ATGGACCTGAAGGACCGCGGAGACCTCAACAGGATCATTGAGGACCCGCCCCACAAACGCAAGCTGGAGGCACC 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGGACCTGAAGGACCGCGGAGACCTCAACAGGATCATTGAGGACCCGCCCCACAAACGCAAGCTGGAGGCACC 1184
Query 1062 AGCAACTGACAACAGCGATGGGTCCAGTTCTGAAGACAACAGGGAAGACCAAGATGTGAAAACCAAGAGGAACC 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCAACTGACAACAGCGATGGGTCCAGTTCTGAAGACAACAGGGAAGACCAAGATGTGAAAACCAAGAGGAACC 1258
Query 1136 GGACCGAAGGCTGCGGGAGTCCCAAGCCAGAGGAGGCAAAGAGAGAGGACAAAGGCACAAGGACGCCGCCCCCG 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGACCGAAGGCTGCGGGAGTCCCAAGCCAGAGGAGGCAAAGAGAGAGGACAAAGGCACAAGGACGCCGCCCCCG 1332
Query 1210 CAGATCCTCCTGCCTCTGGAGGAGCGTGTGACCCACTTCCGAGACATGCTGCTGGAGAGAGGGGTATCAGCATT 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGATCCTCCTGCCTCTGGAGGAGCGTGTGACCCACTTCCGAGACATGCTGCTGGAGAGAGGGGTATCAGCATT 1406
Query 1284 TTCTACCTGGGAGAAAGAATTACACAAAATCGTGTTTGACCCACGCTATCTCCTGCTCAACTCTGAGGAACGAA 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTCTACCTGGGAGAAAGAATTACACAAAATCGTGTTTGACCCACGCTATCTCCTGCTCAACTCTGAGGAACGAA 1480
Query 1358 AGCAGATATTTGAACAGTTTGTCAAGACAAGAATAAAAGAAGAATACAAGGAAAAGAAAAGTAAATTGCTGCTA 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCAGATATTTGAACAGTTTGTCAAGACAAGAATAAAAGAAGAATACAAGGAAAAGAAAAGTAAATTGCTGCTA 1554
Query 1432 GCCAAAGAAGAATTCAAGAAACTTCTAGAGAAATCTAAAGTGTCTCCCAGGACCACGTTTAAGGAGTTTGCAGA 1505
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCCAAAGAAGAATTCAAGAAACTTCTAGAGGAATCTAAAGTGTCTCCCAGGACCACGTTTAAGGAGTTTGCAGA 1628
Query 1506 GAAATACGGCCGGGATCAGAGGTTCCGACTTGTTCAAAAAAGAAAGGACCAGGAGCATTTTTTCAACAAATTCA 1579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1629 GAAATACGGCCGGGATCAGAGGTTCCGACTTGTTCAAAAAAGAAAGGACCAGGAGCATTTTTTCAACCAATTCA 1702
Query 1580 TACTTATTCTTAAGAAACGGGACAAGGAAAACAGACTAAGGCTGCGGAAAATGAGA 1635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TACTTATTCTTAAGAAACGGGACAAGGAAAACAGACTAAGGCTGCGGAAAATGAGA 1758