Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14494
- Subject:
- NM_173537.4
- Aligned Length:
- 2848
- Identities:
- 2835
- Gaps:
- 1
Alignment
Query 1 ATGGCCCAGGTAGCAGTGTCCACCCTGCCTGTTGAAGAAGAGTCCTCCTCAGAGACCAGGATGGTGGTGACATT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCAGGTAGCAGTGTCCACCCTGCCTGTTGAAGAAGAGTCCTCCTCAGAGACCAGGATGGTGGTGACATT 74
Query 75 CCTCGTGTCTGCCCTCGAATCCATGTGTAAAGAACTGGCCAAGTCCAAGGCAGAAGTGGCCTGCATCGCAGTGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCGTGTCTGCCCTCGAATCCATGTGTAAAGAACTGGCCAAGTCCAAGGCAGAAGTGGCCTGCATCGCAGTGT 148
Query 149 ACGAAACAGACGTGTTTGTCGTCGGAACCGAGAGAGGATGCGCTTTTGTTAATGCCAGGACGGATTTTCAGAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACGAAACAGACGTGTTTGTCGTCGGAACCGAGAGAGGATGCGCTTTTGTTAATGCCAGGACGGATTTTCAGAAA 222
Query 223 GATTTTGCAAAATACTGCGTTGCAGAGGGACTGTGTGAGGTGAAACCTCCCTGCCCTGTGAACGGGATGCAGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATTTTGCAAAATACTGCGTTGCAGAGGGACTGTGTGAGGTGAAACCTCCCTGCCCTGTGAACGGGATGCAGGT 296
Query 297 CCACTCGGGCGAAACGGAAATACTCAGGAAGGCAGTGGAGGACTATTTCTGCTTTTGTTATGGTAAAGCCTTAG 370
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCACTCAGGCGAAACGGAAATACTCAGGAAGGCAGTGGAGGACTATTTCTGCTTTTGTTATGGTAAAGCCTTAG 370
Query 371 GGACAACAGTGATGGTGCCTGTTCCCTATGAGAAGATGCTGCGAGACCAGTCGGCTGTGGTAGTGCAGGGGCTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGACAACAGTGATGGTGCCTGTTCCCTATGAGAAGATGCTGCGAGACCAGTCGGCTGTGGTAGTGCAGGGGCTT 444
Query 445 CCGGAAGGCGTTGCCTTTCAACACCCTGAGAATTACGACCTTGCAACCCTGAAATGGATTTTGGAGAACAAAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCGGAAGGCGTTGCCTTTCAACACCCTGAGAATTACGACCTTGCAACCCTGAAATGGATTTTGGAGAACAAAGC 518
Query 519 AGGGATTTCATTCATCATAAATAGACCCTTCCTAGGACCAGAGAGTCAGCTGGGTGGCCCTGGGATGGTAACAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGGATTTCATTCATCATAAATAGACCCTTCCTAGGACCAGAGAGTCAGCTGGGTGGCCCTGGGATGGTAACAG 592
Query 593 ATGCGGAGAGATCCATAGTATCACCAAGTGAAAGCTGCGGCCCCATCAATGTGAAAACTGAACCCATGGAAGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCGGAGAGATCCATAGTATCACCAAGTGAAAGCTGCGGCCCCATCAATGTGAAAACTGAACCCATGGAAGAT 666
Query 667 TCTGGCATTTCACTGAAAGCAGAAGCTGTCTCAGTCAAGAAAGAATCAGAAGATCCTAATTACTATCAATATAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGGCATTTCACTGAAAGCAGAAGCTGTCTCAGTCAAGAAAGAATCAGAAGATCCTAATTACTATCAATATAA 740
Query 741 TATGCAAGGAAGCCACCCTTCTTCCACAAGCAATGAAGTAATAGAAATGGAATTACCAATGGAAGATTCCACTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATGCAAGGAAGCCACCCTTCTTCCACAAGCAATGAAGTAATAGAAATGGAATTACCAATGGAAGATTCCACTC 814
Query 815 CGCTGGTCCCTTCAGAAGAACCAAATGAGGACCCTGAAGCCGAGGTGAAAATCGAAGGAAACACAAATTCATCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGCTGGTCCCTTCAGAAGAACCAAATGAGGACCCTGAAGCCGAGGTGAAAATCGAAGGAAACACAAATTCATCC 888
Query 889 AGTGTTACAAATTCTGCAGCAGGTGTTGAAGATCTTAACATCGTTCAAGTGACTGTTCCAGATAATGAGAAGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTGTTACAAATTCTGCAGCAGGTGTTGAAGATCTTAACATCGTTCAAGTGACTGTTCCAGATAATGAGAAGGA 962
Query 963 AAGATTATCAAGCATTGAAAAGATTAAACAGCTAAGAGAACAAGTTAATGACCTCTTTAGCCGAAAATTTGGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAGATTATCAAGCATTGAAAAGATTAAACAGCTAAGAGAACAAGTTAATGACCTCTTTAGCCGAAAATTTGGTG 1036
Query 1037 AAGCAATTGGCGTGGATTTCCCTGTGAAAGTTCCCTACAGGAAGATCACATTCAACCCTGGCTGTGTGGTGATT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGCAATTGGCGTGGATTTCCCTGTGAAAGTTCCCTACAGGAAGATCACATTCAACCCTGGCTGTGTGGTGATT 1110
Query 1111 GATGGCATGCCCCCGGGGGTGGTATTCAAGGCCCCCGGCTATCTGGAAATCAGTTCCATGAGGAGGATCTTGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATGGCATGCCCCCGGGGGTGGTATTCAAGGCCCCCGGCTATCTGGAAATCAGTTCCATGAGGAGGATCTTGGA 1184
Query 1185 GGCAGCTGAGTTTATCAAATTCACAGTCATCAGGCCGCTTCCAGGGCTTGAGCTCAGTAATGTGGGAAAACGCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCAGCTGAGTTTATCAAATTCACAGTCATCAGGCCGCTTCCAGGGCTTGAGCTCAGTAATGTGGGAAAACGCA 1258
Query 1259 AGATAGACCAGGAGGGCCGTGTGTTTCAAGAAAAGTGGGAGAGAGCGTATTTCTTCGTGGAAGTACAGAATATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGATAGACCAGGAGGGCCGTGTGTTTCAAGAAAAGTGGGAGAGAGCGTATTTCTTCGTGGAAGTACAGAATATT 1332
Query 1333 CCAACATGTCTCATATGCAAACAAAGCATGTCTGTGTCCAAAGAATATAACCTAAGACGCCACTATCAAACCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCAACATGTCTCATATGCAAACAAAGCATGTCTGTGTCCAAAGAATATAACCTAAGACGCCACTATCAAACCAA 1406
Query 1407 TCACAGCAAGCATTATGACCAGTATACGGAAAGAATGCGTGACGAGAAGCTTCACGAGCTGAAAAAAGGGCTCA 1480
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCACAGCAAGCATTATGACCAGTATATGGAAAGAATGCGTGACGAGAAGCTTCACGAGCTGAAAAAAGGGCTCA 1480
Query 1481 GGAAGTATCTCTTAGGCTCGTCAGACACCGAGTGTCCCGAGCAAAAACAAGTGTTTGCAAACCCAAGTCCAACC 1554
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGAAGTATCTCTTAGGCTCATCAGACACCGAGTGTCCCGAGCAAAAACAAGTGTTTGCAAACCCAAGTCCAACC 1554
Query 1555 CAGAAATCCCCCGTGCAGCCTGTAGAGGACCTAGCTGGGAACTTATGGGAGAAGTTACGTGAAAAAATCAGGTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGAAATCCCCCGTGCAGCCTGTAGAGGACCTAGCTGGGAACTTATGGGAGAAGTTACGTGAAAAAATCAGGTC 1628
Query 1629 TTTTGTGGCATATTCTATCGCAATCGATGAGATCACGGATATAAATAATACCACCCAGTTGGCCATATTCATCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTTGTGGCATATTCTATCGCAATCGATGAGATCACGGATATAAATAATACCACCCAGTTGGCCATATTCATCC 1702
Query 1703 GTGGTGTCGATGAGAATTTCGATGTGTCCGAAGAACTTCTGGACACGGTGCCCATGACGGGTACAAAATCTGGC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGGTGTCGATGAGAATTTCGATGTGTCCGAAGAACTTCTGGACACGGTGCCCATGACGGGTACAAAATCTGGC 1776
Query 1777 AACGAGATCTTTTTGCGTGTTGAGAAGAGCCTGAAAAAGTTCTGTATCAACTGGTCGAGATTAGTAAGCGTGGC 1850
|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1777 AACGAGATCTTTTCGCGTGTTGAGAAAAGCCTGAAAAACTTCTGTATCGACTGGTCGAAATTAGTAAGCGTGGC 1850
Query 1851 CTCCACTGGCACCCCAGCGATGGTGGATGCCAATAACGGGCTTGTCACAAAACTGAAGTCCAGGGTGGCGACGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTCCACTGGCACCCCAGCGATGGTGGATGCCAATAACGGGCTTGTCACAAAACTGAAGTCCAGGGTGGCGACGT 1924
Query 1925 TCTGCAAGGGTGCGGAACTGAAGTCCATCTGTTGTATAATTCATCCGGAATCACTCTGTGCTCAGAAGTTGAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TCTGCAAGGGTGCGGAACTGAAGTCCATCTGTTGTATAATTCATCCGGAATCACTCTGTGCTCAGAAGTTGAAG 1998
Query 1999 ATGGACCACGTCATGGACGTGGTAGTGAAGTCCGTGAACTGGATATGCTCCCGGGGACTGAACCACAGCGAGTT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1999 ATGGACCACGTCATGGACGTGGTAGTGAAGTCCGTGAACTGGATATGCTCCCGGGGACTGAACCACAGTGAGTT 2072
Query 2073 CACAACCTTGCTCTATGAGCTGGACAGCCAGTATGGTAGCCTCCTGTACTACACGGAGATTAAGTGGCTCAGTC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CACAACCTTGCTCTATGAGCTGGACAGCCAGTATGGTAGCCTCCTGTACTACACGGAGATTAAGTGGCTCAGTC 2146
Query 2147 GCGGGCTCGTGCTAAAGAGATTTTTCGAATCCTTGGAAGAAATCGACTCCTTCATGTCATCCAGAGGGAAACCC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GCGGGCTCGTGCTAAAGAGATTTTTCGAATCCTTGGAAGAAATCGACTCCTTCATGTCATCCAGAGGGAAACCC 2220
Query 2221 CTGCCTCAACTGAGCTCCATAGATTGGATCCGAGACCTGGCCTTCTTGGTTGACATGACGATGCATCTGAACGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGCCTCAACTGAGCTCCATAGATTGGATCCGAGACCTGGCCTTCTTGGTTGACATGACGATGCATCTGAACGC 2294
Query 2295 TTTGAACATCTCTCTCCAAGGACACTCCCAAATCGTCACGCAGATGTATGACCTGATCCGGGCGTTCCTAGCAA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TTTGAACATCTCTCTCCAAGGACACTCCCAAATCGTCACGCAGATGTATGACCTGATCCGGGCGTTCCTAGCAA 2368
Query 2369 AACTGTGCCTCTGGGAGACTCATTTGACGAGGAATAATCTGGCCCACTTTCCCACCCTGAAATTGGTTTCCAGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2369 AACTGTGCCTCTGGGAGACTCATTTGACGAGGAATAATCTGGCCCACTTTCCCACCCTGAAATTGGCTTCCAGA 2442
Query 2443 AATGAAAGCGATGGCCTGAACTACATTCCCAAAATCGCGGAACTCAAGACCGAATTCCAGAAAAGGCTGTCTGA 2516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AATGAAAGCGATGGCCTGAACTACATTCCCAAAATCGCGGAACTCCAGACCGAATTCCAGAAAAGGCTGTCTGA 2516
Query 2517 TTTCAAACTCTACGAAAGCGAACTGACTCTGTTCAGCTCCCCGTTTTCCACGAAGATCGACAGTGTGCACGAGG 2590
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TTTCAAACTCTACGAAAGCGAACTGACTCTGTTCAGCTCCCCGTTCTCCACGAAGATCGACAGTGTGCACGAGG 2590
Query 2591 AGCTCCAGATGGAGGTTATCGACCTGCAATGCAACACGGTCCTGAAGACGAAATACGACAAGGTGGGAATACCA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AGCTCCAGATGGAGGTTATCGACCTGCAATGCAACACGGTCCTGAAGACGAAATACGACAAGGTGGGAATACCA 2664
Query 2665 GAATTCTACAAGTACCTCTGGGGTAGCTACCCGAAATACAAGCACCATTGCGCAAAGATTCTTTCCATGTTCGG 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAATTCTACAAGTACCTCTGGGGTAGCTACCCGAAATACAAGCACCATTGCGCAAAGATTCTTTCCATGTTCGG 2738
Query 2739 GAGCACCTACATCTGCGAACAGCTGTTCTCCATTATGAAACTGAGCAAAACAAAATACTGCTCCCAGTTAAAGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GAGCACCTACATCTGCGAACAGCTGTTCTCCATTATGAAACTGAGCAAAACAAAATACTGCTCCCAGTTAAAGG 2812
Query 2813 ATTCCCAGTGGGATTCTGTACTCCACCATCGCAACG 2848
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2813 ATTCCCAGTGGGATTCTGTACTCCA-CATCGCAACG 2847