Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14546
• Subject: XM_006539992.2
• Aligned Length: 2742
• Identities: 1920
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  ATGGCGTGGCGGTGCCCCAGGATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGCTTGGCGCTGTGCGGCTGGGCGTGCAT  74
                                 ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||  |
Sbjct    1  ---------------------ATGGGCAGGGTCCCGCTGGCCTGGTGGTTGGCGCTGTGCTGCTGGGGGTG--T  51

Query   75  G--GCCCCCAGGGGCACGCAGGCTGA---AGAAAGTCCCTTCGTGGGCAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCCG  143
            |  ||||..|.||.|||.|||.|.||   .|..||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   52  GCAGCCCATAAGGACACACAGACCGAGGCTGGCAGCCCGTTTGTGGGGAACCCAGGGAATATCACAGGTGCCAG  125

Query  144  GGGACTCACGGGCACCCTTCGGTGTCAGCTCCAGGTTCAGGGAGAGCCCCCCGAGGTACATTGGCTTCGGGATG  217
            .|||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||....||||||||.||||
Sbjct  126  AGGACTCACGGGGACACTTCGGTGTGAGCTCCAGGTTCAGGGGGAACCCCCTGAGGTGGTGTGGCTTCGAGATG  199

Query  218  GACAGATCCTGGAGCTCGCGGACAGCACCCAGACCCAGGTGCCCCTGGGTGAGGA-TGAACAGGATGACTGGAT  290
            ||||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.|||||.||.|| || .||.|||||.||||.
Sbjct  200  GACAGATCCTAGAACTGGCTGATAACACCCAGACCCAGGTGCCTCTGGGCGAAGACTG-GCAAGATGAATGGAA  272

Query  291  AGTGGTCAGCCAGCTCAGAATCACCTCCCTGCAGCTTTCCGA--CACGGGACAGTACCAGTGTTTGGTGTTTCT  362
            |||.|||||.||||||||||||.|..|||||||.|||||.||  ||.|||  |||||||||||.|||||..|||
Sbjct  273  AGTTGTCAGTCAGCTCAGAATCTCAGCCCTGCAACTTTCAGATGCAGGGG--AGTACCAGTGTATGGTGCATCT  344

Query  363  GGGACATCAGACCTTCGTGTCCCAGCCTGGCTATGTTGGGCTGGAGGGCTTGCCTTACTTCCTGGAGGAGCCCG  436
            .|.|...|.||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  345  AGAAGGACGGACCTTTGTGTCTCAGCCGGGCTTTGTAGGGCTGGAAGGTCTCCCGTACTTCCTGGAGGAGCCTG  418

Query  437  AAGACAGGACTGTGGCCGCCAACACCCCCTTCAACCTGAGCTGCCAAGCTCAGGGACCCCCAGAGCCCGTGGAC  510
            |.||||...|||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||..|
Sbjct  419  AGGACAAAGCTGTGCCTGCCAACACCCCTTTCAACCTAAGCTGCCAGGCCCAGGGACCCCCGGAACCCGTGACC  492

Query  511  CTACTCTGGCTCCAGGATGCTGTCCCCCTGGCCACGGCTC-CAGGTCACGGCCCCCAGCGCAGCCTGCATGTTC  583
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.| || ||||.|||.||.||||||.|||.|||||...||
Sbjct  493  CTACTCTGGCTTCAAGATGCTGTCCCCCTGGCCCCAG-TCACAGGACACAGCTCCCAGCACAGTCTGCAAACTC  565

Query  584  CAGGGCTGAACAAGACATCCTCTTTCTCCTGCGAAGCCCATAACGCCAAGGGGGTCACCACATCCCGCACAGCC  657
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  566  CAGGCCTGAACAAGACATCTTCTTTCTCATGTGAAGCCCACAATGCCAAGGGAGTCACCACCTCCCGCACAGCC  639

Query  658  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGCAGCCCCGTAACCTCCACCTGGTCTCCCGCCAACCCACGGAGCTGGAGGTGGC  731
            |||||||||||||||||||||..|||.|...|.||||||.||||.|||.|.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  640  ACCATCACAGTGCTCCCCCAGAGGCCTCACCATCTCCACGTGGTTTCCAGACAACCTACGGAGCTAGAGGTAGC  713

Query  732  TTGGACTCCAGGCCTGAGCGGCATCTACCCCCTGACCCACTGCACCCTGCAGGCTGTGCTGTCAGACGATGGGA  805
            ||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  714  TTGGACCCCTGGCCTGAGTGGCATCTACCCGCTCACCCACTGCAACCTGCAGGCCGTGCTGTCAGACGATGGGG  787

Query  806  TGGGCATCCAGGC-GGGAGAACCAGACCCCCCAGAGGAGCCCCTCACCTCGCAAGCATCCGTGCCCCCCCATCA  878
            ||||.|| |.||| ||||.|..||||.||.||.||.||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct  788  TGGGTAT-CTGGCTGGGAAAGTCAGATCCTCCTGAAGACCCCCTCACCTTGCAAGTATCAGTGCCCCCCCACCA  860

Query  879  GCTTCGGCTAGGCAGCCTCCATCCTCACACCCCTTATCACATCCGCGTGGCATGCACCAGCAGCCAGGGCCCCT  952
            |||||||||.|..|..||||.||||||||||||.|||||||||||..|..|.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  861  GCTTCGGCTGGAAAAGCTCCTTCCTCACACCCCGTATCACATCCGGATATCCTGCAGCAGCAGCCAGGGCCCCT  934

Query  953  CATCCTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACGCCGGAGGGAGTGCCCCTGGGCCCCCCTGAGAACATTAGTGCT  1026
            ||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||                                  
Sbjct  935  CACCTTGGACCCACTGGCTTCCTGTGGAGACCACAGAGGG----------------------------------  974

Query 1027  ACGCGGAATGGGAGCCAGGCCTTCGTGCATTGGCAAGAGCCCCGGGCGCCCCTGCAGGGTACCCTGTTAGGGTA  1100
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1101  CCGGCTGGCGTATCAAGGCCAGGACACCCCAGAGGTGCTAATGGACATAGGGCTAAGGCAAGAGGTGACCCTGG  1174
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1175  AGCTGCAGGGGGACGGGTCTGTGTCCAATCTGACAGTGTGTGTGGCAGCCTACACTGCTGCTGGGGATGGACCC  1248
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1249  TGGAGCCTCCCAGTACCCCTGGAGGCCTGGCGCCCAGGGCAAGCACAGCCAGTCCACCAGCTGGTGAAGGAACC  1322
                                               ||||||||.|||||||.|||||||.|||||||..|||||
Sbjct  975  -----------------------------------AGGGCAAGGACAGCCACTCCACCATCTGGTGAGTGAACC  1013

Query 1323  TTCAACTCCTGCCTTCTCGTGGCCCTGGTGGTATGTACTGCTAGGAGCAGTCGTGGCCGCTGCCTGTGTCCTCA  1396
            ..||.|||..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1014  CCCACCTCGCGCCTTCTCGTGGCCTTGGTGGTATGTACTGCTGGGAGCACTTGTGGCTGCCGCCTGCGTCCTCA  1087

Query 1397  TCTTGGCTCTCTTCCTTGTCCACCGGCGAAAGAAGGAGACCCGTTATGGAGAAGTGTTTGAACCAACAGTGGAA  1470
            |||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1088  TCTTGGCCCTGTTCCTTGTCCATCGGAGGAAGAAGGAGACTCGATATGGGGAGGTGTTTGAGCCAACCGTGGAA  1161

Query 1471  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGCGTGCGCAAGTCCTACAGTCGTCGGACCACTGAAGCTACCTTGAACAG  1544
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1162  AGAGGTGAACTGGTAGTCAGGTACCGTGTCCGAAAGTCCTACAGCCGGCGGACCACTGAAGCCACCTTGAACAG  1235

Query 1545  CCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAGCTGCGGGATGTGATGGTGGACCGGCACAAGGTGGCCCTGGGGA  1618
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct 1236  TCTGGGCATCAGTGAAGAGCTGAAGGAGAAACTACGAGACGTCATGGTAGATCGGCATAAGGTGGCCTTGGGGA  1309

Query 1619  AGACTCTGGGAGAGGGAGAGTTTGGAGCTGTGATGGAAGGCCAGCTCAACCAGGACGACTCCATCCTCAAGGTG  1692
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1310  AGACCCTGGGAGAAGGAGAATTTGGCGCTGTGATGGAAGGTCAGCTCAATCAGGATGACTCCATCCTCAAGGTC  1383

Query 1693  GCTGTGAAGACGATGAAGATTGCCATCTGCACGAGGTCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCGGTCTGCAT  1766
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1384  GCTGTGAAGACCATGAAAATTGCCATCTGCACAAGATCAGAGCTGGAGGATTTCCTGAGTGAAGCTGTCTGCAT  1457

Query 1767  GAAGGAATTTGACCATCCCAACGTCATGAGGCTCATCGGTGTCTGTTTCCAGGGTTCTGAACGAGAGAGCTTCC  1840
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||..|||||.|.||||
Sbjct 1458  GAAGGAATTTGACCACCCCAACGTCATGAGGCTCATTGGCGTCTGTTTTCAGGGCTCTGACAGAGAGGGTTTCC  1531

Query 1841  CAGCACCTGTGGTCATCTTACCTTTCATGAAACATGGAGACCTACACAGCTTCCTCCTCTATTCCCGGCTCGGG  1914
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1532  CAGAACCTGTGGTCATCTTGCCTTTCATGAAACACGGAGACCTACACAGTTTCCTCCTGTACTCCCGGCTCGGG  1605

Query 1915  GACCAGCCAGTGTACCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCAGACATCGCCAGTGGCATGGAGTATCT  1988
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1606  GACCAGCCAGTGTTCCTGCCCACTCAGATGCTAGTGAAGTTCATGGCCGACATTGCCAGTGGTATGGAGTACCT  1679

Query 1989  GAGTACCAAGAGATTCATACACCGGGACCTGGGGGTCAG--ATTTTTGCCTAGCTCACATCCCCACATCTCC--  2058
            |||||||||||||||||||||.||||||||||..|.|||  |   .|||.| |||.| ||....||||.|||  
Sbjct 1680  GAGTACCAAGAGATTCATACATCGGGACCTGGCTGCCAGGAA---CTGCAT-GCTGA-ATGAGAACATGTCCGT  1748

Query 2059  -CCTGTACCAGATGTCGCTTCGAGTTCTACAAAAAGATCGGACATC----ATGTCCTACTCCCGGCACGTGTTG  2127
             ..|||..||||     |||||.|.|||.|||.|||||| .|||.|    ||    ||||.|||.||.| |..|
Sbjct 1749  GTGTGTGGCAGA-----CTTCGGGCTCTCCAAGAAGATC-TACAACGGGGAT----TACTACCGCCAAG-GGCG  1811

Query 2128  TATGTGGCAAGGATACCAGTCAATGTGGATTGGCAATGCACA-AGTATAGCACAACCATT----TCTACTCCAT  2196
            .|| ||.||| |||.|||||||| ||||||||..|.||   | |||.|.|||.|     |    |||||.|||.
Sbjct 1812  CAT-TGCCAA-GATGCCAGTCAA-GTGGATTGCTATTG---AGAGTCTGGCAGA-----TCGGGTCTACACCAG  1874

Query 2197  CAAGAGGGACATGTGGTGCTT-----TAAGGAAGCCCAACGCGGCTGATTCCCACACGAGGCCAA--TCCAGAT  2263
            ||||||.||..||||||.|||     |.|       |||.|.||..|||..||||.|||||||||  |||  .|
Sbjct 1875  CAAGAGCGATGTGTGGTCCTTCGGTGTGA-------CAATGTGGGAGATCGCCACCCGAGGCCAAACTCC--CT  1939

Query 2264  ATGCA--GGTGATAAAACACTG-GACTTTATG-CTCTTTACGCCGGGGCAATGGCCTGAAGCAGCTGGCGGAGT  2333
            ||.||  |||| .|.||||.|| || ||||.| ||...|.||.|..||.|||.|.|||||.||||..|.|||.|
Sbjct 1940  ATCCAGGGGTG-GAGAACAGTGAGA-TTTACGACTACCTGCGTCAAGGAAATCGGCTGAAACAGCCTGTGGACT  2011

Query 2334  GTATCGATGGTCCGTATGCCC-GATATCGCGGCGCTGGTAGCTAAAGCCCCAGGACAGCTCAA-TTAATCAAAG  2405
            ||.|.||.||.|.|||||||| |||.||.|||.|||||.|.||.||.||.|..|||.|..||| ||...|..||
Sbjct 2012  GTCTGGACGGCCTGTATGCCCTGATGTCTCGGTGCTGGGAACTGAACCCTCGAGACCGGCCAAGTTTTGCGGAG  2085

Query 2406  CTGCC------ACTGCTTTGTAGAACACGGT-CAGGC-CTGCCCATTTCCCAGGAGCCAGACGTAATCCTCTTT  2471
            || ||      ||    |||.|||||||..| .|||| ||||||..|.|.|||||||||||.|.||||||| |.
Sbjct 2086  CT-CCGGGAAGAC----TTGGAGAACACACTGAAGGCTCTGCCCCCTGCTCAGGAGCCAGATGAAATCCTC-TA  2153

Query 2472  TTTCCCCCTGCACGAGGGCAGAGGTTACTCTGTCCCCCTCGTAGACACAAGAGGAGCTGAGCCACCAGTCCAGC  2545
            |.||..|.||.|.||||||.||.|..||..||..||||..|..|...|..||||||||||.||.|||..|||.|
Sbjct 2154  TGTCAACATGGATGAGGGCGGAAGCCACCTTGAACCCCGTGGGGCTGCTGGAGGAGCTGACCCCCCAACCCAAC  2227

Query 2546  CGGACCATAAGGATACCAGTAGGTGCCTCCCTGCGGTTCAGGTCCA-TCCGCATGGAGGGTATGTCC-AGGACC  2617
            |.||.|.|||||||.||.||||.||.|||.||||.|.|.|.||||| ||.|| ||||.|.||||||| ..|.||
Sbjct 2228  CTGATCCTAAGGATTCCTGTAGCTGTCTCACTGCAGCTGACGTCCACTCAGC-TGGACGCTATGTCCTTTGTCC  2300

Query 2618  ATTCCCCAACCCCTAGCCCCGCTCAG-CGGGTCA-ATAGGGTCTCCGCCA-CAGCCCCAGGGCAGGAGGA-GGA  2687
             |||..||.||||..|.|||.|||.| |.|.|.| |.|||  ||.| ||| ||.|.|||||||||||||| |||
Sbjct 2301  -TTCTACAGCCCCAGGACCCACTCTGTCTGCTGACAGAGG--CTGC-CCAGCACCTCCAGGGCAGGAGGACGGA  2370

Query 2688  TGCC  2691
             |||
Sbjct 2371  -GCC  2373