Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14704
• Subject: NM_001166281.2
• Aligned Length: 869
• Identities: 772
• Gaps: 96

Alignment

Query   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74

Query  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148

Query 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHN  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHN  222

Query 223  VTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAK  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  VTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAK  296

Query 297  AAATISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELLVHTAWNELKVVSPVCRPAA  370
           ||||||||||                                                                
Sbjct 297  AAATISIAEW----------------------------------------------------------------  306

Query 371  EALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDP  444
                                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307  ------------------------REYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDP  356

Query 445  TACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCC  518
           |||||||||        .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357  TACARLPHL--------AFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCC  422

Query 519  RRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423  RRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQA  496

Query 593  RAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLNEF  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497  RAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLNEF  570

Query 667  LRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVK  740
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Sbjct 571  LRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVK  644

Query 741  IADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYY  814
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Sbjct 645  IADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYY  718

Query 815  VRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  869
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Sbjct 719  VRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  773