Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14755
• Subject: XM_017012324.2
• Aligned Length: 1298
• Identities: 1159
• Gaps: 137

Alignment

Query    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74

Query   75  CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  148

Query  149  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  222

Query  223  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT  296

Query  297  CTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTG  370

Query  371  AGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCA  444
            ||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCA  443

Query  445  CCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  CCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCCT  517

Query  519  GCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCG----------------------------------------------  546
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  518  GCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC  591

Query  547  --------------------------------------------------------------------------  546
                                                                                      
Sbjct  592  CTGACCTTACGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCAGCAGG  665

Query  547  ---------------AGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATG  605
                           |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GCTAGGCATTTCTTCAGAGGTCTGCGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATG  739

Query  606  AGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGC  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGC  813

Query  680  TCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTC  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTC  887

Query  754  GCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGGTTCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAAC  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGG-TCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAAC  960

Query  828  CGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAG  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAG  1034

Query  902  CCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGG  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  CCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGG  1108

Query  976  TGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCC  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCC  1182

Query 1050  TACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACAC  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  TACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACAC  1256

Query 1124  ACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  ACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC  1296