Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14807
• Subject: NM_008927.3
• Aligned Length: 1180
• Identities: 1069
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGACGGCTCTGCAGTTAACGGGACCAGCTC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGATGGCTCGGCGGTTAACGGGACCAGCTC  74

Query   75  TGCGGAGACCAACTTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTAGAGCTTGATGAGCAGCAGCGAAAGCGCC  148
            .||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  GGCCGAGACCAACCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAGCTTGACGAGCAGCAGCGGAAGCGGC  148

Query  149  TTGAGGCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAAGGTGGGAGAACTGAAGGATGACGACTTTGAGAAGATCAGTGAGCTG  222
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  TCGAGGCCTTTCTGACGCAGAAGCAGAAGGTGGGGGAACTGAAGGATGATGACTTTGAGAAGATCAGCGAACTG  222

Query  223  GGGGCTGGCAATGGCGGTGTGGTGTTCAAGGTCTCCCACAAGCCTTCTGGCCTGGTCATGGCCAGAAAGCTAAT  296
            ||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  223  GGAGCTGGCAACGGTGGAGTGGTCTTCAAGGTCTCCCACAAGCCATCTGGCCTGGTTATGGCTAGAAAGCTGAT  296

Query  297  TCATCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATAAGGGAGCTGCAGGTTCTGCATGAGTGCAACTCTC  370
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  CCACCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTACTGCACGAGTGCAACTCCC  370

Query  371  CGTACATCGTGGGCTTCTATGGTGCGTTCTACAGCGATGGCGAGGATCAGTATCTGCATGGAGCACATGGATGG  444
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||| ||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGA-GATCAGCATCTGCATGGAGCACATGGATGG  443

Query  445  AGGTTCTCTGGATCAAGTCCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAACAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGCTG  518
            .||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TGGGTCCTTGGATCAAGTTCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAGCAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTGCTG  517

Query  519  TAATAAAAGGCCTGACATATCTGAGGGAGAAGCACAAGATCATGCACAGAGATGTCAAGCCCTCCAACATCCTA  592
            |.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  518  TGATAAAAGGCCTGACCTATCTTCGGGAGAAGCACAAGATTATGCACAGAGATGTCAAGCCATCCAACATTCTA  591

Query  593  GTCAACTCCCGTGGGGAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTCATCGACTCCATGGCCAACTC  666
            ||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  592  GTGAACTCACGTGGGGAGATCAAACTCTGTGATTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTAATTGACTCTATGGCCAACTC  665

Query  667  CTTCGTGGGCACAAGGTCCTACATGTCGCCAGAAAGACTCCAGGGGACTCATTACTCTGTGCAGTCAGACATCT  740
            ||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  666  CTTCGTGGGCACGAGATCCTACATGTCGCCTGAGAGACTCCAGGGGACTCACTACTCTGTGCAGTCGGACATCT  739

Query  741  GGAGCATGGGACTGTCTCTGGTAGAGATGGCGGTTGGGAGGTATCCCATCCCTCCTCCAGATGCCAAGGAGCTG  814
            ||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  740  GGAGCATGGGGCTCTCTCTGGTGGAGATGGCAGTTGGGAGATACCCCATTCCTCCTCCTGATGCCAAGGAGCTG  813

Query  815  GAGCTGATGTTTGGGTGCCAGGTGGAAGGAGATGCGGCTGAGACCCCACCCAGGCCAAGGACCCCCGGGAGGCC  888
            |||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  814  GAGCTACTGTTTGGATGCCATGTGGAAGGAGACGCAGCCGAAACACCACCCAGGCCAAGGACCCCTGGGAGGCC  887

Query  889  CCTTAGCTCATACGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATAGTCAACGAGC  962
            .||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  888  TCTCAGCTCATATGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATTGTCAATGAGC  961

Query  963  CTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTGTTCAGTCTGGAATTTCAAGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAAAAC  1036
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  962  CTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTATTCAGTCTGGAGTTTCAGGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAGAAC  1035

Query 1037  CCCGCAGAGAGAGCAGATTTGAAGCAACTCATGGTTCATGCTTTTATCAAGAGATCTGATGCTGAGGAAGTGGA  1110
            ||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1036  CCTGCAGAGAGAGCAGATCTGAAGCAGCTCATGGTACATGCTTTCATCAAAAGATCTGACGCCGAGGAGGTAGA  1109

Query 1111  TTTTGCAGGTTGGCTCTGCTCCACCATCGGCCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCATGCTGCTGGCGTC  1180
            .||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 1110  CTTCGCAGGCTGGCTCTGCTCCACCATTGGGCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCACGCTGCCAGCATC  1179