Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14988
• Subject: NM_007181.6
• Aligned Length: 2516
• Identities: 2435
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG  74

Query   75  CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA  148

Query  149  TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC  222

Query  223  GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT  296

Query  297  CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG  370

Query  371  GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCT  444

Query  445  GGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCAT  518

Query  519  TGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGACA  592

Query  593  TCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGA  666

Query  667  GTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCTT  740

Query  741  CCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCAT  814
            ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACAACTTCATCAAAGTCAC-TCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCAT  813

Query  815  CAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAA  887

Query  889  AGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGATCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGATCCA  961

Query  963  CCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCCGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCCGA  1035

Query 1037  GGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG  1109

Query 1111  GAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTC  1183

Query 1185  CTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  CTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAG  1257

Query 1259  CTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATC  1331

Query 1333  CACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGC  1405

Query 1407  CCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGC  1479

Query 1481  TGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  TGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGC  1553

Query 1555  AGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  AGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTA  1627

Query 1629  CGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCCCTTTTATTCTCATAGCATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||| 
Sbjct 1628  CGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCACCTGTATTCTCATAGCAT-  1700

Query 1703  CCTTGCCCTGCTGGAACGGGAAAGAGACCAGAAGCAGGAAACCCCCATCGGTTCACATTAGCCCCCCACCGCCT  1776
            |||||.||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |.||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1701  CCTTGGCCTGCTGGAAC-GGAAAGAGACCAG-AGCAGGAAA-CCCCATC-GCTCACATTAG-CCCCCACCGCCT  1769

Query 1777  ACTGCNAANGGAGAAACATGGTTTCCACCAANGATCCAGGACACCAAAGGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGG  1850
            ||||..||.|.|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770  ACTGGCAAGGAAG-AACATGGTTTCCACCAA-GATCCAGGACACCAAA-GGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGG  1840

Query 1851  AGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  AGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAG  1914

Query 1925  CCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  CCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCT  1988

Query 1999  GACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  GACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCT  2062

Query 2073  TCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  TCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAG  2136

Query 2147  GTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  GTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTC  2210

Query 2221  CCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211  CCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTC  2284

Query 2295  AGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285  AGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGA  2358

Query 2369  GACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTGTAGTG--GTGGAGACACG-------CCCAGT  2433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.||||  ||||   ||||       |.||.|
Sbjct 2359  GACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGG-CTGGAGTGCAGTGG---CACGATCTCGCCTCACT  2428

Query 2434  GGATGATCCTACTGCTCCCAG---CAA------------CCTCTACATCCAG-GAA------------------  2473
            |   .|.|||.||.|||||||   |||            ||||..|.|||.| |.|                  
Sbjct 2429  G---CAACCTCCTCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCCTG  2499