Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15039
• Subject: NM_001350880.1
• Aligned Length: 729
• Identities: 580
• Gaps: 147

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222

Query 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACAC  296

Query 297  TGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGTGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 297  TGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAG----------------  354

Query 371  CACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACATC  444
                                                                                     
Sbjct 355  --------------------------------------------------------------------------  354

Query 445  ACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTGCA  518
                                                                    |||||||||||||||||
Sbjct 355  ---------------------------------------------------------GGAAAGCACAGGTTGCA  371

Query 519  TGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAACCA  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 372  TGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACAACCA  445

Query 593  CAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACGAC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446  CAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACGAC  519

Query 667  GGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  729
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520  GGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC  582