Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15039
• Subject: NM_001350881.1
• Aligned Length: 751
• Identities: 674
• Gaps: 50

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222

Query 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACAC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCACAC  296

Query 297  TGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGTGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGTGA  370

Query 371  CACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACATC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACATC  444

Query 445  ACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTGCA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTGCA  518

Query 519  TGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAACCA  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 519  TGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACAACCA  592

Query 593  CAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACA-TTGGTCAGTACTTCCA---ATA----  658
           |||||||||||||||||||||.||.|  ||||..|.|..|.|||.|| .|||..||     |||   |||    
Sbjct 593  CAGGCCTCAAGTGGAACCTCAGAACT--TGTGACTACACTAGGACCACCTGGATAG-----CCAAGGATAATCC  659

Query 659  ---CCTACGACGGGTCTGGTGT--TGTGAC---------TGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGG  718
              ||.|.|||...||.|.| |  |..|||         |.||.|||.|          |||||       |.|
Sbjct 660  CGTCCCAAGACTAATCAGAT-TAATCAGACTTAATCACATCTGTAAAGT----------TCCTC-------TTG  715

Query 719  CCATCAAAAGC  729
           ||||||||   
Sbjct 716  CCATCAAA---  723