Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_15089
Subject:
NM_001317238.2
Aligned Length:
671
Identities:
465
Gaps:
154

Alignment

Query   1  MSWLFGINKGPKGEDAGPPPPLPPAQPGAEGGGDRGLGDRPAPKDKWSNFDPTGLERAAKAARELEHSRYAKDA  74
                                                                                ....|
Sbjct   1  ---------------------------------------------------------------------MQLEA  5

Query  75  LNL---------------AQMQE--------QTLQLEQQSKLKEYEAAVEQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQ  125
           |||               .|.||        ..........|.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   6  LNLLHTLVWARSLCRAGAVQTQERLSGSASPEQVPAGECCALQEYEAAVEQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQ  79

Query 126  HQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQQLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATVEREMELRHKNEMLRVEAEARARAKA  199
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  80  HQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQQLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATVEREMELRHKNEMLRVETEARARAKA  153

Query 200  ERENADIIREQIRLKAAEHRQTVLESIRTAGTLFGEGFRAFVTDWDKVTATVAGLTLLAVGVYSAKNATLVAGR  273
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 154  ERENADIIREQIRLKASEHRQTVLESIRTAGTLFGEGFRAFVTDRDKVTATVAGLTLLAVGVYSAKNATAVTGR  227

Query 274  FIEARLGKPSLVRETSRITVLEALRHPIQVSRRLLSRPQDALEGVVLSPSLEARVRDIAIATRNTKKNRSLYRN  347
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 228  FIEARLGKPSLVRETSRITVLEALRHPIQVSRRLLSRPQDVLEGVVLSPSLEARVRDIAIATRNTKKNRGLYRH  301

Query 348  ILMYGPPGTGKTLFAKKLALHSGMDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLFDWANTSRRGLLLFVDEADAFLRKRA  421
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 302  ILLYGPPGTGKTLFAKKLALHSGMDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLFDWANTSRRGLLLFMDEADAFLRKRA  375

Query 422  TEKISEDLRATLNAFLYRTGQHSNKFMLVLASNQPEQFDWAINDRINEMVHFDLPGQEERERLVRMYFDKYVLK  495
           ||.||.|||||||||||..||||||||||||||.|||||.|||.||..|||||||.|||||||||..||..|||
Sbjct 376  TEEISKDLRATLNAFLYHMGQHSNKFMLVLASNLPEQFDCAINSRIDVMVHFDLPQQEERERLVRLHFDNCVLK  449

Query 496  PATEGKQRLKLAQFDYGRKCSEVARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYASEDGVLTEAMMDTRVQDAVQQHQQKM  569
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||..|||
Sbjct 450  PATEGKRRLKLAQFDYGRKCSEVARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYASKDGVLTEAMMDACVQDAVQQYRQKM  523

Query 570  CWLKAEGPGRGDEPSPS---------------------------------------------------------  586
           .||||||||||.|...|                                                         
Sbjct 524  RWLKAEGPGRGVEHPLSGVQGETLTSWSLATDPSYPCLAGPCTFRICSWMGTGLCPGPLSPRMSCGGGRPFCPP  597

Query 587  -----  586
                
Sbjct 598  GHPLL  602