Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15089
- Subject:
- NM_179203.3
- Aligned Length:
- 1785
- Identities:
- 1469
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCATTAACAAGGGCCCCAAGGGTGAAGACGCGGGGCCGCCGCCGCCTTTGCCGCCCGC 74
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||.||||.|.|.|||||.||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGTGGCTCTTCGGCAT---CAAGGGCCCCAAGGGCGAAGGCACAGGGCCTCCGCTGCCCTTGCCGCCCGC 71
Query 75 GCAGCCCGGGGCCGAGGGCGGCGGGGACCGCGGCTTGGGAGACCGGCCGGCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 148
.||.||||||||.|||||||||||.||||||||...||||||||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct 72 TCAACCCGGGGCGGAGGGCGGCGGTGACCGCGGGGCGGGAGACCGGCCATCGCCCAAGGACAAATGGAGCAACT 145
Query 149 TCGACCCCACCGGCCTGGAGCGCGCCGCCAAGGCGGCGCGCGAGCTGGAGCACTCGCGTTATGCCAAGGACGCC 222
|||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||.|||||||||||||..||||||||||.||.
Sbjct 146 TCGACCCGACGGGCCTGGAACGTGCGGCCAAAGCGGCTCGCGAGTTGGAGCACTCGCGCCATGCCAAGGAGGCA 219
Query 223 CTGAATCTGGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGTTGGAGCAACAGTCCAAGCTCAAAGAGTATGAGGCCGC 296
||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 220 CTGAGTCTCGCACAGATGCAGGAGCAGACGCTGCAGCTGGAACAGCAGTCCAAGCTCAAGGAGTACGAAGCTGC 293
Query 297 CGTGGAGCAGCTCAAGAGCGAGCAGATCCGGGCGCAGGCTGAGGAGAGGAGGAAGACCCTGAGCGAGGAGACCC 370
|||.||||||||.||||||||.||||||||.|.|||.||.|||||.||.|||||.|||||||..||.|||||.|
Sbjct 294 CGTAGAGCAGCTGAAGAGCGAACAGATCCGTGTGCAAGCCGAGGAAAGAAGGAAAACCCTGACTGAAGAGACAC 367
Query 371 GGCAGCACCAGGCCAGGGCCCAGTATCAAGACAAGCTGGCCCGGCAGCGCTACGAGGACCAACTGAAGCAGCAG 444
|.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 368 GACAGCACCAGGCTAGGGCCCAGTACCAGGATAAGCTCGCTCGACAGCGCTATGAGGACCAGCTGAAACAACAG 441
Query 445 CAACTTCTCAATGAGGAGAATTTACGGAAGCAGGAGGAGTCCGTGCAGAAGCAGGAAGCCATGCGGCGAGCCAC 518
||||||||.|||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 442 CAACTTCTGAATGAAGAGAATTTAAGGAAACAAGAGGAGTCTGTGCAGAAGCAGGAGGCCATACGGCGAGCCAC 515
Query 519 CGTGGAGCGGGAGATGGAGCTGCGGCACAAGAATGAGATGCTGCGAGTGGAGGCCGAGGCCCGGGCGCGCGCCA 592
.||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||||||.||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||||
Sbjct 516 TGTGGAGCGCGAGATGGAGCTGAGGCATAAAAACGAGATGTTGCGGGTGGAAGCTGAAGCCCGAGCACGGGCCA 589
Query 593 AGGCCGAGCGGGAGAATGCAGACATCATCCGCGAGCAGATCCGCCTGAAGGCGGCCGAGCACCGTCAGACCGTC 666
||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||.||
Sbjct 590 AGGCTGATCGAGAGAATGCAGATATCATCCGGGAACAGATTCGACTCAAGGCTGCTGAGCACCGCCAGACCATC 663
Query 667 TTGGAGTCCATCAGGACGGCTGGCACCTTGTTTGGGGAAGGATTCCGTGCCTTTGTGACAGACTGGGACAAAGT 740
||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 TTGGAGTCTATCAGGACAGCTGGCACCTTGCTTGGTGAAGGATTCCGTGCATTTGTGACAGACTGGGACAAAGT 737
Query 741 GACAGCCACGGTGGCTGGGCTGACGCTGCTGGCTGTTGGGGTCTACTCAGCCAAGAATGCCACGCTTGTCGCCG 814
||||||.||||||||||||.||||.||..|.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||...|||.||.|
Sbjct 738 GACAGCTACGGTGGCTGGGTTGACACTATTAGCTGTTGGAGTCTATTCTGCAAAGAATGCTACTTCTGTTGCTG 811
Query 815 GCCGCTTCATCGAGGCTCGGCTGGGGAAGCCGTCCCTAGTGAGGGAGACGTCCCGCATCACGGTGCTTGAGGCG 888
|.||.|..||.|||||.||..||||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||||.|||.|.|||||.|||||.
Sbjct 812 GTCGGTATATTGAGGCCCGATTGGGAAAGCCGTCCTTGGTGAGAGAGACCTCCCGAATCTCAGTGCTAGAGGCA 885
Query 889 CTGCGGCACCCCATCCAGGTCAGCCGGCGGCTCCTCAGTCGACCCCAGGACGCGCTGGAGGGTGTTGTGCTCAG 962
.||.||||.|||||||||||||||.||||.||..||||..||||||||||.||..|||||||.||..|.|||||
Sbjct 886 TTGAGGCATCCCATCCAGGTCAGCAGGCGACTGGTCAGCAGACCCCAGGATGCATTGGAGGGCGTCATCCTCAG 959
Query 963 TCCCAGCCTGGAAGCACGGGTGCGCGACATCGCCATAGCAACAAGGAACACCAAGAAGAACCGCAGCCTGTACA 1036
|||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||...||||||||.|
Sbjct 960 TCCTAGCCTGGAGGCACGGGTCCGAGATATTGCCATCGCAACAAGAAATACCAAGAAGAACAAAAGCCTGTATA 1033
Query 1037 GGAACATCCTGATGTACGGGCCACCAGGCACCGGGAAGACGCTGTTTGCCAAGAAACTCGCCCTGCACTCAGGC 1110
|||||.|.||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1034 GGAACGTTCTGATGTATGGGCCCCCGGGGACTGGCAAGACACTATTTGCCAAGAAACTTGCACTGCATTCAGGC 1107
Query 1111 ATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCCATGGGGCGGGAAGGCGTGACCGCCATGCACAAGCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|
Sbjct 1108 ATGGACTACGCCATCATGACAGGCGGGGACGTGGCCCCAATGGGGCGGGAGGGTGTGACTGCCATGCACAAGGT 1181
Query 1185 CTTTGACTGGGCCAATACCAGCCGGCGCGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCGGACGCCTTCCTTCGGAAGC 1258
|||.||||||||.|..||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|
Sbjct 1182 CTTCGACTGGGCAAGCACCAGCCGACGAGGCCTCCTGCTCTTTGTGGATGAAGCAGACGCCTTCCTCAGGAAAC 1255
Query 1259 GAGCCACCGAGAAGATAAGCGAGGACCTCAGGGCCACACTGAACGCCTTCCTGTACCGCACGGGCCAGCACAGC 1332
||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..||.|.||.||.||||||||.
Sbjct 1256 GAGCGACTGAAAAGATAAGTGAAGACCTCAGGGCTACTCTGAATGCCTTCCTACACAGGACAGGACAGCACAGT 1329
Query 1333 AACAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGCAACCAACCAGAGCAGTTCGACTGGGCCATCAATGACCGCATCAATGA 1406
|..|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||..|.||
Sbjct 1330 AGTAAGTTCATGCTGGTCCTGGCCAGTAACCAGCCTGAGCAGTTTGATTGGGCTATCAATGACCGCATTGACGA 1403
Query 1407 GATGGTCCACTTCGACCTGCCAGGGCAGGAGGAACGGGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTTC 1480
|||||||..|||.|.|||||||..||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1404 GATGGTCTGCTTTGCCCTGCCACAGCGGGAGGAGCGAGAGCGCCTGGTGAGAATGTATTTTGACAAGTATGTCC 1477
Query 1481 TTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCCTGAAGCTGGCCCAGTTTGACTACGGGAGGAAGTGCTCGGAGGTC 1554
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||.||.|.|||.|||||.|||||.
Sbjct 1478 TTAAGCCGGCCACAGAAGGAAAGCAGCGCTTGAAGGTGGCCCAGTTTGACTATGGAAAGAAATGCTCAGAGGTT 1551
Query 1555 GCTCGGCTGACGGAGGGCATGTCGGGCCGGGAGATCGCTCAGCTGGCCGTGTCCTGGCAGGCCACGGCGTATGC 1628
||.|.|||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||.|.||||||||||.|||.|||.|
Sbjct 1552 GCCCAGCTAACGGAGGGGATGTCAGGCCGGGAGATTGCTCAGCTTGCTGTGGCGTGGCAGGCCATGGCATATTC 1625
Query 1629 CTCCGAGGACGGGGTCCTGACCGAGGCCATGATGGACACCCGCGTGCAAGATGCTGTCCAGCAGCACCAGCAGA 1702
.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||||||||..||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1626 ATCTGAGGATGGAGTCCTCACGGAAGCTATGATGGATGCCCGTGTGCAGGATGCTGTGCAGCAGCACCAGCAGA 1699
Query 1703 AGATGTGCTGGCTGAAGGCGGA-AGGGCCTGGGCGTGGG-------GACGAGC---CCTCCCCATCC------- 1758
|||||...|||||.||.|..|| ||..|| | |||.|.| ||.||.|||||
Sbjct 1700 AGATGCAGTGGCTTAAAGTAGAGAGACCC---------GATTCCCAGACCAACAAGCCGCCACATCCTTCACTC 1764
Query 1759 --------- 1758
Sbjct 1765 CTCAGCTGC 1773