Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15300
• Subject: XM_017006211.1
• Aligned Length: 3479
• Identities: 2965
• Gaps: 514

Alignment

Query    1  ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA  444
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------ATGGAAAACATATCCATTA  19

Query  445  AATGGG-----------------------------------------TGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAA  477
            ||||||                                         |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   20  AATGGGGTATGCCTCCTTTCACCACAAGCTCAAGACTCAAGAAATTTTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAA  93

Query  478  CATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAATGGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAA  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  CATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAATGGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAA  167

Query  552  CTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAATGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCC  625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  CTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAATGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCC  241

Query  626  CATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTTTATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAA  699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  CATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTTTATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAA  315

Query  700  TTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGA  773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  TTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGCTGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGA  389

Query  774  TCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTC  847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  TCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGCCTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTC  463

Query  848  AAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTTTTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAAC  921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  AAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTTTTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAAC  537

Query  922  TTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTCCTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAA  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  TTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTCCTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAA  611

Query  996  GAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAGCTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGT  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  GAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAGCTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGT  685

Query 1070  GCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGCCATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTT  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  GCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGCCATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTT  759

Query 1144  GCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTTAACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTG  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  GCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTTAACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTG  833

Query 1218  TGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTATGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGA  1291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  TGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTATGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGA  907

Query 1292  ATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAATGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAA  1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  ATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAATGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAA  981

Query 1366  GATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGACACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACT  1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  GATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGACACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACT  1055

Query 1440  CCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCGTGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATT  1513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  CCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCGTGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATT  1129

Query 1514  ACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTGAGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACA  1587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  ACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTGAGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACA  1203

Query 1588  GTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGTAAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGC  1661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  GTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGTAAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGC  1277

Query 1662  CCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTCTGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGA------  1729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1278  CCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTCTGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGTCT  1351

Query 1730  ------------------------------------------AAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACA  1761
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  ACCCACGGATAGCGCCGGCATTTTGGCACTACCTGCGGGTAGAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACA  1425

Query 1762  AGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAG  1835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  AGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCCAGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAG  1499

Query 1836  AACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAG  1909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  AACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAATTTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAG  1573

Query 1910  CAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTA  1983
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  CAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTTGGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTA  1647

Query 1984  TTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCA  2057
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  TTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGCCAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCA  1721

Query 2058  CTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCC  2131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  CTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTTACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCC  1795

Query 2132  TAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAA  2205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  TAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGAATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAA  1869

Query 2206  TTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAA  2279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870  TTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAAAAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAA  1943

Query 2280  AGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAA  2353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944  AGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAGAAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAA  2017

Query 2354  ACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGC  2427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018  ACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTCCCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGC  2091

Query 2428  TTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAG  2501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092  TTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCATCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAG  2165

Query 2502  GATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGA  2575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166  GATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATATGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGA  2239

Query 2576  AGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTT  2649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2240  AGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATGCTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTT  2313

Query 2650  TCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGT  2723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2314  TCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAATATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGT  2387

Query 2724  TTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCC  2797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388  TTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAGAAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCC  2461

Query 2798  CCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGC  2871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462  CCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAATTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGC  2535

Query 2872  ATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTC  2945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2536  ATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTATTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTC  2609

Query 2946  CATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCT  3019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2610  CATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTCCAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCT  2683

Query 3020  GGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCC  3093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2684  GGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATTGTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCC  2757

Query 3094  AGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTT  3167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2758  AGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCCAGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTT  2831

Query 3168  GTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGT  3241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2832  GTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGGGGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGT  2905

Query 3242  TTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACAC  3315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2906  TTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGACATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACAC  2979

Query 3316  CAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGT  3389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2980  CAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACACATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGT  3053

Query 3390  A  3390
            |
Sbjct 3054  A  3054