Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15300
- Subject:
- XM_017006214.1
- Aligned Length:
- 3438
- Identities:
- 2294
- Gaps:
- 1137
Alignment
Query 1 ATGCAATTCCCCTCGCCTCCAGCCGCGAGGAGCTCCCCGGCGCCGCAGGCAGCGTCCTCCTCCGAAGCAGCTGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGCAACTGGGCAGCCTGGACCCTCGTGCCCTGTTCCCGGGACCTCGCGCAGGGGGCGCCCCGGGACACCCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGCGGGCCGGGTGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAGACGTGGACAAGGACCCCCATCCTACCCAGAAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACCTGCCTGCGCTGCCGCCACTTCTCTTTAAGGGAGAGGAAAAGAGAGCCTAGGAGAACCATGGGGGGCTGCGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGTCCGGGAATTTCTTTTGCAATTTGGTTTCTTCTTGCCTCTGCTGACAGCGTGGCCAGGCGACTGCAGTCACG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCTCCAACAACCAAGTTGTGTTGCTTGATACAACAACTGTACTGGGAGAGCTAGGATGGAAAACATATCCATTA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AATGGGTGGGATGCCATCACTGAAATGGATGAACATAATAGGCCCATTCACACATACCAGGTATGTAATGTAAT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 GGAACCAAACCAAAACAACTGGCTTCGTACAAACTGGATCTCCCGTGATGCAGCTCAGAAAATTTATGTGGAAA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 TGAAATTCACACTAAGGGATTGTAACAGCATCCCATGGGTCTTGGGGACTTGCAAAGAAACATTTAATCTGTTT 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 TATATGGAATCAGATGAGTCCCACGGAATTAAATTCAAGCCAAACCAGTATACAAAGATCGACACAATTGCTGC 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 TGATGAGAGTTTTACCCAGATGGATTTGGGTGATCGCATCCTCAAACTCAACACTGAAATTCGTGAGGTGGGGC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 CTATAGAAAGGAAAGGATTTTATCTGGCTTTTCAAGACATTGGGGCGTGCATTGCCCTGGTTTCAGTCCGTGTT 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 TTCTACAAGAAATGCCCCTTCACTGTTCGTAACTTGGCCATGTTTCCTGATACCATTCCAAGGGTTGATTCCTC 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 CTCTTTGGTTGAAGTACGGGGTTCTTGTGTGAAGAGTGCTGAAGAGCGTGACACTCCTAAACTGTATTGTGGAG 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 CTGATGGAGATTGGCTGGTTCCTCTTGGAAGGTGCATCTGCAGTACAGGATATGAAGAAATTGAGGGTTCTTGC 1110
.||||| ..|||.|.||.| ||||.|
Sbjct 1 ------------------------ATGGAA--AACATATCCATT-------------AAATGG----------- 24
Query 1111 CATGCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 25 ---GCTTGCAGACCAGGATTCTATAAAGCTTTTGCTGGGAACACAAAATGTTCTAAATGTCCTCCACACAGTTT 95
Query 1185 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 AACATACATGGAAGCAACTTCTGTCTGTCAGTGTGAAAAGGGTTATTTCCGAGCTGAAAAAGACCCACCTTCTA 169
Query 1259 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170 TGGCATGTACCAGGCCACCTTCAGCTCCTAGGAATGTGGTTTTTAACATCAATGAAACAGCCCTTATTTTGGAA 243
Query 1333 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 TGGAGCCCACCAAGTGACACAGGAGGGAGAAAAGATCTCACATACAGTGTAATCTGTAAGAAATGTGGCTTAGA 317
Query 1407 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 318 CACCAGCCAGTGTGAGGACTGTGGTGGAGGACTCCGCTTCATCCCAAGACATACAGGCCTGATCAACAATTCCG 391
Query 1481 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 392 TGATAGTACTTGACTTTGTGTCTCACGTGAATTACACCTTTGAAATAGAAGCAATGAATGGAGTTTCTGAGTTG 465
Query 1555 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 466 AGTTTTTCTCCCAAGCCATTCACAGCTATTACAGTGACCACGGATCAAGATGCACCTTCCCTGATAGGTGTGGT 539
Query 1629 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 AAGGAAGGACTGGGCATCCCAAAATAGCATTGCCCTATCATGGCAAGCACCTGCTTTTTCCAATGGAGCCATTC 613
Query 1703 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGA----------------------------------------------- 1729
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 TGGACTACGAGATCAAGTACTATGAGAAAGTCTACCCACGGATAGCGCCGGCATTTTGGCACTACCTGCGGGTA 687
Query 1730 -AAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC 1802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 688 GAAGAACATGAGCAGCTGACCTACTCTTCCACAAGGTCCAAAGCCCCCAGTGTCATCATCACAGGTCTTAAGCC 761
Query 1803 AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 762 AGCCACCAAATATGTATTTCACATCCGAGTGAGAACTGCGACAGGATACAGTGGCTACAGTCAGAAATTTGAAT 835
Query 1877 TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 836 TTGAAACAGGAGATGAAACTTCTGACATGGCAGCAGAACAAGGACAGATTCTCGTGATAGCCACCGCCGCTGTT 909
Query 1951 GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 GGCGGATTCACTCTCCTCGTCATCCTCACTTTATTCTTCTTGATCACTGGGAGATGTCAGTGGTACATAAAAGC 983
Query 2025 CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 CAAGATGAAGTCAGAAGAGAAGAGAAGAAACCACTTACAGAATGGGCATTTGCGCTTCCCGGGAATTAAAACTT 1057
Query 2099 ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA 2172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058 ACATTGATCCAGATACATATGAAGACCCATCCCTAGCAGTCCATGAATTTGCAAAGGAGATTGATCCCTCAAGA 1131
Query 2173 ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA 2246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 ATTCGTATTGAGAGAGTCATTGGGGCAGGTGAATTTGGAGAAGTCTGTAGTGGGCGTTTGAAGACACCAGGGAA 1205
Query 2247 AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG 2320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 AAGAGAGATCCCAGTTGCCATTAAAACTTTGAAAGGTGGCCACATGGATCGGCAAAGAAGAGATTTTCTAAGAG 1279
Query 2321 AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC 2394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280 AAGCTAGTATCATGGGCCAGTTTGACCATCCAAACATCATTCGCCTAGAAGGGGTTGTCACCAAAAGATCCTTC 1353
Query 2395 CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA 2468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354 CCGGCCATTGGGGTGGAGGCGTTTTGCCCCAGCTTCCTGAGGGCAGGGTTTTTAAATAGCATCCAGGCCCCGCA 1427
Query 2469 TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA 2542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 TCCAGTGCCAGGGGGAGGATCTTTGCCCCCCAGGATTCCTGCTGGCAGACCAGTAATGATTGTGGTGGAATATA 1501
Query 2543 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG 2616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 TGGAGAATGGATCCCTAGACTCCTTTTTGCGGAAGCATGATGGCCACTTCACAGTCATCCAGTTGGTCGGAATG 1575
Query 2617 CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA 2690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1576 CTCCGAGGCATTGCATCAGGCATGAAGTATCTTTCTGATATGGGTTATGTTCATCGAGACCTAGCGGCTCGGAA 1649
Query 2691 TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG 2764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1650 TATACTGGTCAATAGCAACTTAGTATGCAAAGTTTCTGATTTTGGTCTCTCCAGAGTGCTGGAAGATGATCCAG 1723
Query 2765 AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA 2838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1724 AAGCTGCTTATACAACAACTGGTGGAAAAATCCCCATAAGGTGGACAGCCCCAGAAGCCATCGCCTACAGAAAA 1797
Query 2839 TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA 2912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1798 TTCTCCTCAGCAAGCGATGCATGGAGCTATGGCATTGTCATGTGGGAGGTCATGTCCTATGGAGAGAGACCTTA 1871
Query 2913 TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC 2986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1872 TTGGGAAATGTCTAACCAAGATGTCATTCTGTCCATTGAAGAAGGGTACAGACTTCCAGCTCCCATGGGCTGTC 1945
Query 2987 CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1946 CAGCATCTCTACACCAGCTGATGCTCCACTGCTGGCAGAAGGAGAGAAATCACAGACCAAAATTTACTGACATT 2019
Query 3061 GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC 3134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2020 GTCAGCTTCCTTGACAAACTGATCCGAAATCCCAGTGCCCTTCACACCCTGGTGGAGGACATCCTTGTAATGCC 2093
Query 3135 AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG 3208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2094 AGAGTCCCCTGGTGAAGTTCCGGAATATCCTTTGTTTGTCACAGTTGGTGACTGGCTAGATTCTATAAAGATGG 2167
Query 3209 GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC 3282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2168 GGCAATACAAGAATAACTTCGTGGCAGCAGGGTTTACAACATTTGACCTGATTTCAAGAATGAGCATTGATGAC 2241
Query 3283 ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA 3356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2242 ATTAGAAGAATTGGAGTCATACTTATTGGACACCAGAGACGAATAGTCAGCAGCATACAGACTTTACGTTTACA 2315
Query 3357 CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 3390
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2316 CATGATGCACATACAGGAGAAGGGATTTCATGTA 2349
