Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15398
• Subject: NM_001030307.2
• Aligned Length: 1550
• Identities: 1363
• Gaps: 31

Alignment

Query    1  ATGGCGGATGCGGAAGTAATTATTTTGCCAAAGAAACATAAGAAGAAAAAGGAGCGGAAGTCATTGCCAGAAGA  74
            |||||||||||.||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.||||.|.||||||
Sbjct    1  ATGGCGGATGCAGAAGTAATTACATTCCCAAAGAAGCATAAGAAGAAAAAAGACCGGAAGCCATTACAAGAAGA  74

Query   75  AGATGTAGCCGAAATACAACACGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCTGAATCCAAAGTTGCTAAGTTGGACACGT  148
            .|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|.||.|||||.|
Sbjct   75  TGATGTTGCCGAAATACAACATGCTGAAGAATTTCTTATCAAACCAGAATCTAAAGTGGCTCAATTAGACACTT  148

Query  149  CTCAGTGGCCCCTTTTGCTAAAGAATTTTGATAAGCTGAATGTAAGGACAACACACTATACACCTCTTGCATGT  222
            |||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||
Sbjct  149  CTCAGTGGCCCTTGTTACTAAAGAATTTTGATAAGCTAAATGTAAGGACAGCACACTATACACCTCTTCCTTGT  222

Query  223  GGTTCAAATCCTCTGAAGAGAGAGATTGGGGACTATATCAGGACAGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTCTAA  296
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTTCAAATCCTCTGAAGAGGGAGATTGGGGACTATATCAGGACCGGTTTCATTAATCTTGACAAGCCCTCTAA  296

Query  297  CCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATTCGACGGATACTTCGGGTGGAGAAGACAGGGCACAGTGGTACTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|
Sbjct  297  CCCCTCTTCCCATGAGGTGGTAGCCTGGATCCGACGAATACTTCGGGTAGAGAAGACTGGCCACAGTGGCACAC  370

Query  371  TGGATCCCAAGGTGACTGGTTGTTTAATCGTGTGCATAGAACGAGCCACTCGCTTGGTGAAGTCACAACAGAGT  444
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TAGATCCCAAAGTGACTGGTTGTTTAATTGTGTGCATTGAACGAGCCACTCGTTTGGTGAAATCACAACAGAGT  444

Query  445  GCAGGCAAAGAGTATGTGGGGATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGGACCCAGCTTTCTAGGGCCCT  518
            |||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGGCAAAGAGTATGTTGGAATTGTCCGGCTGCACAATGCTATTGAAGGGGGTACTCAGCTTTCTAGGGCCCT  518

Query  519  AGAAACTCTGACAGGTGCCTTATTCCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTCCGAGTGAGGA  592
            |||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  AGAAACTCTGACAGGTGCCCTGTTTCAGCGACCCCCACTTATTGCTGCAGTAAAGAGGCAGCTTCGAGTGAGGA  592

Query  593  CCATCTACGAGAGCAAAATGATTGAATACGATCCTGAAAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTGAGTTGTGAGGCT  666
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  593  CTATCTACGAGAGCAAAATGATAGAATATGATCCTGAGAGAAGATTAGGAATCTTTTGGGTAAGCTGTGAAGCT  666

Query  667  GGCACCTACATTCGGACATTATGTGTGCACCTTGGTTTGTTATTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAGCTTCG  740
            ||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  GGCACCTACATTCGGACACTATGCGTACACCTTGGCTTGTTACTGGGAGTTGGTGGTCAGATGCAGGAACTTCG  740

Query  741  GAGGGTTCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTGCTTGATGCTCAGTGGC  814
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  741  GAGGGTGCGTTCTGGAGTCATGAGTGAAAAGGACCACATGGTGACAATGCATGATGTACTCGATGCTCAGTGGC  814

Query  815  TGTATGATAACCACAAGGATGAGAGTTACCTGCGGCGATTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCTCAT  888
            |||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTATGATAACCATAAGGATGAGAGTTACTTGCGGCGTGTTGTTTACCCTTTGGAAAAGCTGTTGACATCTCAT  888

Query  889  AAACGGCTGGTTATGAAAGACAGTGCAGTAAATGCCATCTGCTATGGGGCCAAGATTATGCTTCCAGGTGTTCT  962
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||
Sbjct  889  AAACGTCTGGTTATGAAAGATAGTGCAGTGAATGCAATCTGCTATGGGGCCAAGATCATGCTTCCTGGTCTTCT  962

Query  963  TCGATATGAGGACGGCATTGAGGTCAATCAGGAGATTGTGGTTATCACCACCAAAGGAGAAGCAATCTGCATGG  1036
            |||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  TCGATATGAAGATGGCATTGAGGTCAACCAGGAGATTGTGGTCATTACTACTAAGGGGGAAGCTATCTGCATGG  1036

Query 1037  CTATTGCATTAATGACCACAGCGGTCATCTCTACCTGCGACCATGGTATAGTAGCCAAGATCAAGAGAGTGATC  1110
            |.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1037  CAATTGCATTGATGACTACAGCAGTGATTTCTACCTGTGACCATGGTATAGTAGCCAAAATAAAGAGGGTGATC  1110

Query 1111  ATGGAGAGAGACACTTACCCTCGGAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGCTGATGATCAAGCA  1184
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGAGAGAGACACTTATCCTCGCAAGTGGGGTTTAGGTCCAAAGGCAAGTCAGAAGAAGATGATGATCAAGCA  1184

Query 1185  GGGCCTTCTGGACAAGCATGGGAAGCCCACAGACAGCACACCTGCCACCTGGAAGCAGGAGTATGTTGACTACA  1258
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||||..||.||||||||.|||||.|||||.||..|||||||.|
Sbjct 1185  GGGCCTTCTGGACAAGCATGGCAAACCCACAGACAATACCCCTGCCACATGGAAACAGGATTACATTGACTATA  1258

Query 1259  GTGAGTCTGCCAA-AAAAGAGGTGGTTGCTGAAGTGGTAAAAGCCCCGCAGGTAGTTGCCGAAGCAG-------  1324
            ||||.||||.||| ||.|.| .|||||.|.||||..|||.|||||||.|||.|||.|||.|||||||       
Sbjct 1259  GTGATTCTGGCAAGAACACA-CTGGTTACCGAAGCAGTACAAGCCCCTCAGTTAGCTGCTGAAGCAGTAAATGT  1331

Query 1325  CAAAAACTGCGAAGCGGAAGCGAGAGAGTGAGAGTGAAAGTGACGAGACTCCTCCAGCAGCTCCTCAGTTGATC  1398
            ||.|||     ||  |||||||.||.|||||||||||||||||.||||   |.|||.|||.|||.|||||    
Sbjct 1332  CATAAA-----AA--GGAAGCGGGATAGTGAGAGTGAAAGTGATGAGA---CCCCAACAGTTCCCCAGTT----  1391

Query 1399  AAGAAGGAAAAGAAGAAGAGTAAGAAGGACAAGAAGGCCAAAGCTGGTCTGGAGAGCGGGGCCGAGCCTGGAGA  1472
              ||||||||||||||||   ||||||||.||||||.|||||.|||..||.||.||.||||.|||..|||||||
Sbjct 1392  --GAAGGAAAAGAAGAAG---AAGAAGGATAAGAAGCCCAAAACTGTGCTAGAAAGTGGGGGCGAAACTGGAGA  1460

Query 1473  TGGGGACAGTGATACCACCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGCAAAAGAGGTAGAATTGGTTTCTGAG  1542
            ||||||||..||.||||||   ||.|||||.|||||||||||||.|||||.|||||||..|.|.|||||.
Sbjct 1461  TGGGGACAACGACACCACC---AAAAAGAAAAAGAAGAAGAAAGTAAAAGTGGTAGAAGAGATGTCTGAA  1527