Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_15990
- Subject:
- XM_017025089.2
- Aligned Length:
- 1003
- Identities:
- 869
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA 74
Query 75 CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA 148
Query 149 CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC 222
Query 223 AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT 296
Query 297 GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC 370
Query 371 CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT 444
Query 445 GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGAGTCCCATTCACCCAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGAGTCCCATTCACCCAG 518
Query 519 GGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGAGCAGCTGGAGCCTGAGCT---GGTTTGGACAGAGCAGC 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 519 GGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGAGCAGCTGGAGCCTGAGCTGCAGGTTTGGACAGAGCAGC 592
Query 590 GGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGC 666
Query 664 AGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGA 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGA 740
Query 738 GGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCG---------------C 796
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.| |
Sbjct 741 GGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGATGCAGTCTCACTCTGTCGGTC 814
Query 797 AGCCCAGGCCCAGTG------------CTCGGC-CA-TGGCCCCTTGGGCTCCCGGGG--CCCGCGCTGCTCT- 853
||.|..| |||| |||.|| || ||...|||..|.|||||.||| |..||..|.||||
Sbjct 815 AGACTGG----AGTGAAGTGGCGTGAACTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTG 884
Query 854 --TCTTCCTCCTG------TGGCCCTTC-GTCGTCCA-----GTGGC---------TCTTCCGAATGTTTCG-- 902
||..|||||.| |||...|.| |.||.||| .||.| |.||..|.||.|||.|
Sbjct 885 CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTA 958
Query 903 --GACCCAAAAGAGG-------------------------- 915
||| |.||
Sbjct 959 GAGAC------GGGGTTTCACCATCTTGGCCACGCTGGTCT 993