Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_15990
• Subject: XM_017025089.2
• Aligned Length: 1003
• Identities: 869
• Gaps: 98

Alignment

Query    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGAGTCCCATTCACCCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGAGTCCCATTCACCCAG  518

Query  519  GGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGAGCAGCTGGAGCCTGAGCT---GGTTTGGACAGAGCAGC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGAGCAGCTGGAGCCTGAGCTGCAGGTTTGGACAGAGCAGC  592

Query  590  GGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGC  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGC  666

Query  664  AGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGA  740

Query  738  GGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCG---------------C  796
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|               |
Sbjct  741  GGTGCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGATGCAGTCTCACTCTGTCGGTC  814

Query  797  AGCCCAGGCCCAGTG------------CTCGGC-CA-TGGCCCCTTGGGCTCCCGGGG--CCCGCGCTGCTCT-  853
            ||.|..|    ||||            |||.|| || ||...|||..|.|||||.|||  |..||..|.|||| 
Sbjct  815  AGACTGG----AGTGAAGTGGCGTGAACTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTG  884

Query  854  --TCTTCCTCCTG------TGGCCCTTC-GTCGTCCA-----GTGGC---------TCTTCCGAATGTTTCG--  902
              ||..|||||.|      |||...|.| |.||.|||     .||.|         |.||..|.||.|||.|  
Sbjct  885  CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTA  958

Query  903  --GACCCAAAAGAGG--------------------------  915
              |||      |.||                          
Sbjct  959  GAGAC------GGGGTTTCACCATCTTGGCCACGCTGGTCT  993