Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00072
• Subject: NM_004034.4
• Aligned Length: 1464
• Identities: 1398
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC  74

Query   75  TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC  148

Query  149  CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT  222

Query  223  GCCCCACAGCCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCCACAGCCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTGG  296

Query  297  AGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCTG  370

Query  371  GTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAG---------  435
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  371  GTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAGATCAATACA  444

Query  436  ---------------------------------------------------------CCTGCCACAGTGACTCA  452
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTCTTTTTCTTCCTATCCTGTTTTCTCTCCTGTTTCTTTGGATTATAGCAGTGAACCTGCCACAGTGACTCA  518

Query  453  GGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTCGTAAGGCAA  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTCGTAAGGCAA  592

Query  527  TGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAGAGGCAAAAA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAGAGGCAAAAA  666

Query  601  ATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAGTGGAAATAT  674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAGTGGAAATAT  740

Query  675  GGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAGCAATGCAGG  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAGCAATGCAGG  814

Query  749  GAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGAGAAATTGTC  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGAGAAATTGTC  888

Query  823  AGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACATTTTGAACG  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACATTTTGAACG  962

Query  897  TTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTCAGGAAGATG  970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTCAGGAAGATG  1036

Query  971  CTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATCCTTGCCACA  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATCCTTGCCACA  1110

Query 1045  AGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTTAAGCAGTGT  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTTAAGCAGTGT  1184

Query 1119  GAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACCGCCCTGCCT  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACCGCCCTGCCT  1258

Query 1193  TCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGGATTGTGGTC  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGGATTGTGGTC  1332

Query 1267  ACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCTGGGCACAAT  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCTGGGCACAAT  1406

Query 1341  GATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTACCGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTACCGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG  1464