Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00128
• Subject: NM_001112738.1
• Aligned Length: 894
• Identities: 722
• Gaps: 72

Alignment

Query   1  ATGTTCTCTCGCGCGGGTGTCGCTGGGCTGTCGGCCTGGACCTTGCAGCCGCAATGGATTCAAGTTCGAAATAT  74
                                                                                   ||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query  75  GGCAACTTTGAAAGATATCACCAGGAGACTAAAGTCCATCAAAAACATCCAGAAAATTACCAAGTCTATGAAAA  148
           |||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   3  GGCAACTCTGAAAGATATTACCAGGAGACTGAAGTCCATCAAAAACATCCAGAAAATTACCAAGTCTATGAAGA  76

Query 149  TGGTAGCGGCAGCAAAATATGCCCGAGCTGAGAGAGAGCTGAAACCAGCTCGAATATATGGATTGGGATCTTTA  222
           ||||.||.||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||.||.||.|||.|.|||||....||.|||||.
Sbjct  77  TGGTGGCAGCTGCAAAGTATGCCCGGGCTGAGCGGGAGCTGAAGCCTGCCCGAGTGTATGGGACAGGTTCTTTG  150

Query 223  GCTCTGTATGAAAAAGCTGATATCAAGGGGCCTGAAGACAAGAAGAAACACCTCCTTATTGGTGTGTCCTCAGA  296
           |||||||||||.||.||||||||.||||..|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 151  GCTCTGTATGAGAAGGCTGATATTAAGGCACCTGAGGACAAGAAGAAGCACCTCATTATTGGTGTGTCCTCAGA  224

Query 297  TCGAGGACTGTGTGGTGCTATTCATTCCTCCATTGCTAAACAGATGAAAAGCGAGGTTGCTACACTAACAGCAG  370
           |.||||.||.||||||||||||||.|||||..|.||||||||||||||.|..||.||.|||.|.||.|||||||
Sbjct 225  TAGAGGGCTTTGTGGTGCTATTCACTCCTCAGTGGCTAAACAGATGAAGAATGAAGTGGCTGCCCTCACAGCAG  298

Query 371  CTGGGAAAGAAGTTATGCTTGTTGGAATTGGTGACAAAATCAGAGGCATACTTTATAGGACTCATTCTGACCAG  444
           |||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 299  CTGGGAAAGAAGTTATGATTGTTGGAGTTGGTGAAAAAATCAAGGGCATACTTTATAGGACTCATTCTGATCAG  372

Query 445  TTTCTGGTGGCATTCAAAGAAGTGGGAAGAAAGCCCCCCACTTTTGGAGATGCGTCAGTCATTGCCCTTGAATT  518
           |||.|||||.||||||||||.||||||.|.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 373  TTTTTGGTGTCATTCAAAGATGTGGGACGGAAGCCTCCTACTTTTGGAGATGCATCAGTCATTGCCCTTGAGTT  446

Query 519  ACTAAATTCTGGATATGAATTTGATGAAGGCTCCATCATCTTTAATAAATTCAGGTCTGTCATCTCCTATAAGA  592
           ..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||.||||||.||||||||.||||
Sbjct 447  GTTAAATTCTGGATATGAATTTGATGAAGGCTCTATCATTTTTAATCAGTTCAAGTCTGTTATCTCCTACAAGA  520

Query 593  CAGAAGAAAAGCCCATCTTTTCCCTTAATACCGTTGCAAGTGCTGACAGCATGAGTATCTATGACGATATTGAT  666
           |||||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||.|.||||||.|.||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 521  CAGAAGAGAAGCCCATCTTCTCTCTGAATACCATTGCGACTGCTGAGACCATGAGCATCTATGATGACATTGAT  594

Query 667  GCTGACGTGCTGCAAAATTACCAAGAATACAATCTGGCCAACATCATCTACTACTCTCTGAAGGAGTCCACCAC  740
           |||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 595  GCTGATGTGCTGCAGAATTACCAGGAGTACAATCTGGCCAACCTCATCTACTACTCCCTGAAGGAGTCCACCAC  668

Query 741  TAGTGAGCAGAGTGCCAGGATGACAGCCATGGACAATGCCAGCAAGAATGCTTCTGAGATGATTGACAAATTGA  814
           .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 669  CAGTGAGCAGAGTGCCAGGATGACCGCCATGGACAACGCCAGCAAGAACGCTTCTGATATGATTGACAAATTGA  742

Query 815  CATTGACATTCAACCGTACCCGCCAAGCTGTCATCACAAAAGAGTTGATTGAAATTATCTCTGGTGCTGCAGCT  888
           |.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 743  CCTTGACTTTCAACCGCACCCGCCAGGCTGTCATCACAAAGGAGTTGATTGAAATCATCTCTGGGGCTGCTGCT  816

Query 889  CTGGAT  894
           ||||||
Sbjct 817  CTGGAT  822