Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00128
• Subject: XM_006497310.2
• Aligned Length: 894
• Identities: 779
• Gaps: 3

Alignment

Query   1  ATGTTCTCTCGCGCGGGTGTCGCTGGGCTGTCGGCCTGGACCTTGCAGCCGCAATGGATTCAAGTTCGAAATAT  74
           ||||||||.||.|||.|.||.|..||||||||||||||..||.||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct   1  ATGTTCTCGCGGGCGAGCGTTGTCGGGCTGTCGGCCTGCGCCGTGCAGCCGCAATGGATCCAAGTTCGAAACAT  74

Query  75  GGCAACTTTGAAAGATATCACCAGGAGACTAAAGTCCATCAAAAACATCCAGAAAATTACCAAGTCTATGAAAA  148
           |||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  75  GGCAACTCTGAAAGATATTACCAGGAGACTGAAGTCCATCAAAAACATCCAGAAAATTACCAAGTCTATGAAGA  148

Query 149  TGGTAGCGGCAGCAAAATATGCCCGAGCTGAGAGAGAGCTGAAACCAGCTCGAATATATGGATTGGGATCTTTA  222
           ||||.||.||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||.||.||.|||.|.|||||....||.|||||.
Sbjct 149  TGGTGGCAGCTGCAAAGTATGCCCGGGCTGAGCGGGAGCTGAAGCCTGCCCGAGTGTATGGGACAGGTTCTTTG  222

Query 223  GCTCTGTATGAAAAAGCTGATATCAAGGGGCCTGAAGACAAGAAGAAACACCTCCTTATTGGTGTGTCCTCAGA  296
           |||||||||||.||.||||||||.||||..|||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCTCTGTATGAGAAGGCTGATATTAAGGCACCTGAGGACAAGAAGAAGCACCTCATTATTGGTGTGTCCTCAGA  296

Query 297  TCGAGGACTGTGTGGTGCTATTCATTCCTCCATTGCTAAACAGATGAAAAGCGAGGTTGCTACACTAACAGCAG  370
           |.||||.||.||||||||||||||.|||||..|.||||||||||||||.|..||.||.|||.|.||.|||||||
Sbjct 297  TAGAGGGCTTTGTGGTGCTATTCACTCCTCAGTGGCTAAACAGATGAAGAATGAAGTGGCTGCCCTCACAGCAG  370

Query 371  CTGGGAAAGAAGTTATGCTTGTTGGAATTGGTGACAAAATCAGAGGCATACTTTATAGGACTCATTCTGACCAG  444
           |||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371  CTGGGAAAGAAGTTATGATTGTTGGAGTTGGTGAAAAAATCAAGGGCATACTTTATAGGACTCATTCTGATCAG  444

Query 445  TTTCTGGTGGCATTCAAAGAAGTGGGAAGAAAGCCCCCCACTTTTGGAGATGCGTCAGTCATTGCCCTTGAATT  518
           |||.|||||.||||||||||.||||||.|.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 445  TTTTTGGTGTCATTCAAAGATGTGGGACGGAAGCCTCCTACTTTTGGAGATGCATCAGTCATTGCCCTTGAGTT  518

Query 519  ACTAAATTCTGGATATGAATTTGATGAAGGCTCCATCATCTTTAATAAATTCAGGTCTGTCATCTCCTATAAGA  592
           ..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||.||||||.||||||||.||||
Sbjct 519  GTTAAATTCTGGATATGAATTTGATGAAGGCTCTATCATTTTTAATCAGTTCAAGTCTGTTATCTCCTACAAGA  592

Query 593  CAGAAGAAAAGCCCATCTTTTCCCTTAATACCGTTGCAAGTGCTGACAGCATGAGTATCTATGACGATATTGAT  666
           |||||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||.|.||||||.|.||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 593  CAGAAGAGAAGCCCATCTTCTCTCTGAATACCATTGCGACTGCTGAGACCATGAGCATCTATGATGACATTGAT  666

Query 667  GCTGACGTGCTGCAAAATTACCAAGAATACAATCTGGCCAACATCATCTACTACTCTCTGAAGGAGTCCACCAC  740
           |||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667  GCTGATGTGCTGCAGAATTACCAGGAGTACAATCTGGCCAACCTCATCTACTACTCCCTGAAGGAGTCCACCAC  740

Query 741  TAGTGAGCAGAGTGCCAGGATGACAGCCATGGACAATGCCAGCAAGAATGCTTCTGAGATGATTGACAAATTGA  814
           .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741  CAGTGAGCAGAGTGCCAGGATGACCGCCATGGACAACGCCAGCAAGAACGCTTCTGATATGATTGACAAATTGA  814

Query 815  CATTGACATTCAACCGTACCCGCCAAGCTGTCATCACAAAAGAGTTGATTGAAATTATCTCTGGTGCTGCAGCT  888
           |.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 815  CCTTGACTTTCAACCGCACCCGCCAGGCTGTCATCACAAAGGAGTTGATTGAAATCATCTCTGGGGCTGCTGCT  888

Query 889  CTGGAT  894
           |||   
Sbjct 889  CTG---  891