Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_00229
• Subject: XM_005261068.3
• Aligned Length: 1445
• Identities: 1378
• Gaps: 46

Alignment

Query    1  ATGGCTTCAG-ACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACC--CACAGTGCTTCATGAGAGAATGCATACTTGG  71
            |||.|..||| ||.||                  ..|.|||  |.|||.|                      ||
Sbjct    1  ATGCCCGCAGCACCGC------------------GGGGACCGGCGCAGGG----------------------GG  34

Query   72  AA--TGAATCCTTCTAGAGACGTCCACGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAG  143
            ||  .|...||..|..|.||.| ||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  AAGCGGCCGCCCGCACGCGAAG-CCGGGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCGCCTTCCACCGCGCTGAG  107

Query  144  CCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGA  217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  108  CCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGTTGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGGCAAGCTGAGGA  181

Query  218  GCGGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTC  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  182  GCGGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTGGCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCAACTTC  255

Query  292  CTCTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGG  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  256  CTCTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAACAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGG  329

Query  366  GGATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATG  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  330  GGATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCAATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATG  403

Query  440  CTACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAA  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  CTACCGCAGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGGTTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAA  477

Query  514  AGCTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCAC  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  AGCTTCACTCTGACCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTACCACAGAGCCATCAAAATCAC  551

Query  588  AGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCT  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  552  AGTGGATGGGCCCCGAGAACCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGCCCGGGAGCTTGTCCT  625

Query  662  TTTCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCC  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  TTTCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGAGCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCACCCAGCCCCC  699

Query  736  ACGCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATAC  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  ACGCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACTCCACTGCCTTTAACCCTCAGCCTCAGAGTCAGATGCAGGATAC  773

Query  810  AAGGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTT  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  AAGGCAGATCCAACCATCCCCACCGTGGTCCTACGATCAGTCCTACCAATACCTGGGATCCATTGCCTCTCCTT  847

Query  884  CTGTGCACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGT  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  CTGTGCACCCAGCAACGCCCATTTCACCTGGACGTGCCAGCGGCATGACAACCCTCTCTGCAGAACTTTCCAGT  921

Query  958  CGACTCTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGA  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  CGACTCTCAACGGCACCCGACCTGACAGCGTTCAGCGACCCGCGCCAGTTCCCCGCGCTGCCCTCCATCTCCGA  995

Query 1032  CCCCCGCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGT  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  996  CCCCCGCATGCACTATCCAGGCGCCTTCACCTACTCCCCGACGCCGGTCACCTCGGGCATCGGCATCGGCATGT  1069

Query 1106  CGGCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGA  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070  CGGCCATGGGCTCGGCCACGCGCTACCACACCTACCTGCCGCCGCCCTACCCCGGCTCGTCGCAAGCGCAGGGA  1143

Query 1180  GGCCCGTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCAT  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1144  GGCCCGTTCCAAGCCAGCTCGCCCTCCTACCACCTGTACTACGGCGCCTCGGCCGGCTCCTACCAGTTCTCCAT  1217

Query 1254  GGTGGGCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCA  1327
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Sbjct 1218  GGTGGGCGGCGAGCGCTCGCCGCCGCGCATCCTGCCGCCCTGCACCAACGCCTCCACCGGCTCCGCGCTGCTCA  1291

Query 1328  ACCCCAGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCG  1401
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Sbjct 1292  ACCCCAGCCTCCCGAACCAGAGCGACGTGGTGGAGGCCGAGGGCAGCCACAGCAACTCCCCCACCAACATGGCG  1365

Query 1402  CCCTCCGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1440
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Sbjct 1366  CCCTCCGCGCGCCTGGAGGAGGCCGTGTGGAGGCCCTAC  1404